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Cyt b和12S rRNA基因进化速度对构建系统进化树的影响
被引量：
2
1
作者
王利利
彭建军
+4 位作者
于冬梅
胡诗佳
高赛飞
傅美兰
刘曦庆
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第9期5101-5103,5106,共4页
[目的]论证线粒体Cyt b和12S rRNA基因不同进化速率影响构建的系统树拓扑结构。[方法]从GenBank下载了蛇亚目12科15种蛇线粒体全序列,提取Cyt b和12S rRNA基因序列,选用GTR+I+G核苷酸替代模型,基于最大似然法,用PAUP4.0软件分别构建2个...
[目的]论证线粒体Cyt b和12S rRNA基因不同进化速率影响构建的系统树拓扑结构。[方法]从GenBank下载了蛇亚目12科15种蛇线粒体全序列,提取Cyt b和12S rRNA基因序列,选用GTR+I+G核苷酸替代模型,基于最大似然法,用PAUP4.0软件分别构建2个基因的系统关系树。[结果]在选用相同的软件、建树方法和研究物种的情况下,构建的系统树拓扑结构差异主要是因为线粒体Cyt b和12S rRNA基因进化速率不同产生的。[结论]在分子系统进化研究中,要针对不同的研究物种和研究目的,选择合适的基因构建系统进化树。
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关键词
系统进化
蛇
CYTB
12S
RRNA
进化速度
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职称材料
题名
Cyt b和12S rRNA基因进化速度对构建系统进化树的影响
被引量：
2
1
作者
王利利
彭建军
于冬梅
胡诗佳
高赛飞
傅美兰
刘曦庆
机构
华南濒危动物研究所物种鉴定中心
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第9期5101-5103,5106,共4页
基金
广东省自然科学基金项目(9151026001000003)
广东省科学院优秀青年科技人才基金项目(200804)
广东省野生动物保护和利用公共实验室基金项目(200901)
文摘
[目的]论证线粒体Cyt b和12S rRNA基因不同进化速率影响构建的系统树拓扑结构。[方法]从GenBank下载了蛇亚目12科15种蛇线粒体全序列,提取Cyt b和12S rRNA基因序列,选用GTR+I+G核苷酸替代模型,基于最大似然法,用PAUP4.0软件分别构建2个基因的系统关系树。[结果]在选用相同的软件、建树方法和研究物种的情况下,构建的系统树拓扑结构差异主要是因为线粒体Cyt b和12S rRNA基因进化速率不同产生的。[结论]在分子系统进化研究中,要针对不同的研究物种和研究目的,选择合适的基因构建系统进化树。
关键词
系统进化
蛇
CYTB
12S
RRNA
进化速度
Keywords
Molecular phylogeny
Snake
Cyt b
12S rRNA
Evolution rate
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Cyt b和12S rRNA基因进化速度对构建系统进化树的影响
王利利
彭建军
于冬梅
胡诗佳
高赛飞
傅美兰
刘曦庆
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011
2
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