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基于图神经网络的IL-6诱导肽预测方法
1
作者
曹瑞芬
胡维玲
+2 位作者
李强生
宾艳南
郑春厚
《华南理工大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第5期109-117,共9页
白细胞介素6(简称IL-6)是一种高多效性的糖蛋白因子,可以调节先天性免疫、适应性免疫以及代谢的各个方面,包括糖酵解、脂肪酸氧化和氧化磷酸化等。许多研究已证明,病毒感染患者体内的IL-6表达和释放量显著增加,并且与疾病的严重程度呈...
白细胞介素6(简称IL-6)是一种高多效性的糖蛋白因子,可以调节先天性免疫、适应性免疫以及代谢的各个方面,包括糖酵解、脂肪酸氧化和氧化磷酸化等。许多研究已证明,病毒感染患者体内的IL-6表达和释放量显著增加,并且与疾病的严重程度呈正相关,因此,识别IL-6诱导肽并探究其作用机制,对于开发免疫治疗以及疾病严重程度生物标志物具有重要的意义。目前对于IL-6诱导肽的识别大多采用传统的机器学习方法,特征选择与提取较为复杂,且需要依赖领域专家知识。鉴于此,该文提出一种基于图神经网络的IL-6诱导肽预测方法SFGNN-IL6。该方法根据所预测的IL-6诱导肽的结构特征,通过阈值筛选距离信息构建邻接矩阵,结合氨基酸的编码方式(One-hot编码、位置编码和BLOSUM62编码)提取氨基酸节点特征并进行图表示;然后,采用图注意力机制层和图卷积神经网络层,由双通道分别提取多视角特征,既关注节点权重的更新,也考虑节点信息的更新;最后,将两类特征进行融合,用于IL-6诱导肽的分类。实验结果验证了该方法的有效性。
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关键词
IL-6诱导肽
图神经网络
结构特征
图注意力机制
图卷积神经网络
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职称材料
利用导电涂膜直接电解海水法防护生物腐蚀 1.模拟和测量技术
被引量:
6
2
作者
胡维玲
吴玲玲
+3 位作者
周静
李竞新
罗瑾
林仲华
《电化学》
CAS
CSCD
1999年第3期299-303,共5页
基于电化 学微探针 和微弱 信号检测 技术, 采用 四电 极体 系、双恒 电 位仪、锁相 相 关测定系统 以及三维 微调装 置建立模 拟和测量 系统,将 首次实 现对利 用导 电涂 膜直 接电 解海 水法 防护生物腐 蚀中微 米尺度内 痕量 Cl...
基于电化 学微探针 和微弱 信号检测 技术, 采用 四电 极体 系、双恒 电 位仪、锁相 相 关测定系统 以及三维 微调装 置建立模 拟和测量 系统,将 首次实 现对利 用导 电涂 膜直 接电 解海 水法 防护生物腐 蚀中微 米尺度内 痕量 Cl O - 浓度 的测量.本 文报道 了模拟和 测量实验 的阶段 性进展.
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关键词
海水直接电解
导电涂膜
生物防腐
生物腐蚀
防护
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职称材料
微系统科技的发展及电化学的新应用
被引量:
10
3
作者
田昭武
林华水
+9 位作者
孙建军
周勇亮
祖延斌
田中群
罗瑾
林仲华
谢兆雄
胡维玲
胡涌刚
苏文煅
《电化学》
CAS
CSCD
2001年第1期1-9,共9页
本文根据田昭武在中国化学会第一届全国纳米技术与应用会议 (2 0 0 0 .11.2 8,厦门 )特邀大会报告内容整理而成 :1 微系统技术概述 (技术的必要性和前景 )2 发展微系统技术的特殊困难3 电化学在微系统技术中的应用 3.1 用于复杂 ...
本文根据田昭武在中国化学会第一届全国纳米技术与应用会议 (2 0 0 0 .11.2 8,厦门 )特邀大会报告内容整理而成 :1 微系统技术概述 (技术的必要性和前景 )2 发展微系统技术的特殊困难3 电化学在微系统技术中的应用 3.1 用于复杂 3D 图形微加工的约束刻蚀剂层技术 (CELT) 3.2 聚焦电泳和微系统在 (生物 )化学中的应用 (μ TAS或芯片上实验室 ) 3.3 芯片实验室中微流体输运网络的合理选择之一 -灵巧 (Smart)
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关键词
微系统
CELT
电渗
α-TAS
芯片上实验室
电化学
应用
微电子技术
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职称材料
一种电驱动高倍率、连续、无损伤浓缩装置的研究
被引量:
1
4
作者
林华水
陈良格
+3 位作者
张润香
罗凡
胡维玲
田昭武
《电化学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期144-147,共4页
提出使用膜聚焦浓缩方法并建立电驱动高倍率、连续、无损伤装置.分别以溴酚蓝、荧光素钠溶液为浓缩对象进行测试.该实验装置达近2个数量级浓缩效果,并可根据需要放大,成为有规模产量的生产设备,也可微型化,成为结构简单小巧、可以装配...
提出使用膜聚焦浓缩方法并建立电驱动高倍率、连续、无损伤装置.分别以溴酚蓝、荧光素钠溶液为浓缩对象进行测试.该实验装置达近2个数量级浓缩效果,并可根据需要放大,成为有规模产量的生产设备,也可微型化,成为结构简单小巧、可以装配到电泳、色谱、质谱或光谱等分离分析仪器的零部件,或集成在芯片上,成为芯片实验室的预浓缩元件.
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关键词
浓缩装置
电泳
离子交换膜
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职称材料
等速电泳新技术及仪器研究
5
作者
林华水
胡维玲
田昭武
《福建分析测试》
CAS
1994年第3期124-125,128,共3页
本文提出一种新型的微机化、开放式毛细管等速电泳仪,同常规毛细管等速电泳仪比较,本仪器结构简单,价格便宜。实验条件、结果和曲线可打印或存盘。曲线可由XY记录仪记录。阳离子或阴离子的分析已获得满意的结果,临床应用已获得初步结果。
关键词
毛细管等速电泳
淌度
仪器结构
仪器研究
微机化
实验条件
电泳分离
电泳仪
离子迁移率
中性分子
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职称材料
XYZ-2型高性能电化学离子色谱抑制柱
6
作者
胡维玲
林华水
《电化学》
CAS
CSCD
1999年第2期212-217,共6页
本文研究离子色谱电化学抑制器的填料问题,提出以直径大小一致、中等磺化深度的球状树脂为最佳方案.改进后的抑制效率达99.98%,灵敏度提高了约10%,离子的峰高及保留时间的重现性均优良(c.v.<2).
关键词
抑制柱
填料
离子色谱
电导
抑制器
XYZ-2
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职称材料
题名
基于图神经网络的IL-6诱导肽预测方法
1
作者
曹瑞芬
胡维玲
李强生
宾艳南
郑春厚
机构
安徽大学计算机科学与技术学院
安徽大学物质科学与信息技术研究院
安徽大学人工智能学院
出处
《华南理工大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第5期109-117,共9页
基金
国家自然科学基金项目(62373001,62272004)
国家重点研发计划项目(2020YFA0908700)
安徽省高校协同创新项目(GXXT-2021-030)。
文摘
白细胞介素6(简称IL-6)是一种高多效性的糖蛋白因子,可以调节先天性免疫、适应性免疫以及代谢的各个方面,包括糖酵解、脂肪酸氧化和氧化磷酸化等。许多研究已证明,病毒感染患者体内的IL-6表达和释放量显著增加,并且与疾病的严重程度呈正相关,因此,识别IL-6诱导肽并探究其作用机制,对于开发免疫治疗以及疾病严重程度生物标志物具有重要的意义。目前对于IL-6诱导肽的识别大多采用传统的机器学习方法,特征选择与提取较为复杂,且需要依赖领域专家知识。鉴于此,该文提出一种基于图神经网络的IL-6诱导肽预测方法SFGNN-IL6。该方法根据所预测的IL-6诱导肽的结构特征,通过阈值筛选距离信息构建邻接矩阵,结合氨基酸的编码方式(One-hot编码、位置编码和BLOSUM62编码)提取氨基酸节点特征并进行图表示;然后,采用图注意力机制层和图卷积神经网络层,由双通道分别提取多视角特征,既关注节点权重的更新,也考虑节点信息的更新;最后,将两类特征进行融合,用于IL-6诱导肽的分类。实验结果验证了该方法的有效性。
关键词
IL-6诱导肽
图神经网络
结构特征
图注意力机制
图卷积神经网络
Keywords
IL-6 inducing peptide
graph neural network
structural feature
graph attention mechanism
graph convolutional neural network
分类号
TP183 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
利用导电涂膜直接电解海水法防护生物腐蚀 1.模拟和测量技术
被引量:
6
2
作者
胡维玲
吴玲玲
周静
李竞新
罗瑾
林仲华
机构
固体表面物理化学国家重点实验室
出处
《电化学》
CAS
CSCD
1999年第3期299-303,共5页
基金
船舶工业总公司七二五所厦门分部的资助
文摘
基于电化 学微探针 和微弱 信号检测 技术, 采用 四电 极体 系、双恒 电 位仪、锁相 相 关测定系统 以及三维 微调装 置建立模 拟和测量 系统,将 首次实 现对利 用导 电涂 膜直 接电 解海 水法 防护生物腐 蚀中微 米尺度内 痕量 Cl O - 浓度 的测量.本 文报道 了模拟和 测量实验 的阶段 性进展.
关键词
海水直接电解
导电涂膜
生物防腐
生物腐蚀
防护
Keywords
Direct electrolysis of seawater, Conducting film, Microbial anticorrosion, Concentration of sodium hypochlorite
分类号
TG174.46 [金属学及工艺—金属表面处理]
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职称材料
题名
微系统科技的发展及电化学的新应用
被引量:
10
3
作者
田昭武
林华水
孙建军
周勇亮
祖延斌
田中群
罗瑾
林仲华
谢兆雄
胡维玲
胡涌刚
苏文煅
机构
厦门大学固体表面物理化学国家重点实验室
出处
《电化学》
CAS
CSCD
2001年第1期1-9,共9页
基金
国家自然科学基金委多年来对本文各研究项目的资助支持!基金项目批准号 :2 92 330 70 (重点项目
1 993)
+1 种基金
2 93830 0 4( 1 994)
5 96 0
文摘
本文根据田昭武在中国化学会第一届全国纳米技术与应用会议 (2 0 0 0 .11.2 8,厦门 )特邀大会报告内容整理而成 :1 微系统技术概述 (技术的必要性和前景 )2 发展微系统技术的特殊困难3 电化学在微系统技术中的应用 3.1 用于复杂 3D 图形微加工的约束刻蚀剂层技术 (CELT) 3.2 聚焦电泳和微系统在 (生物 )化学中的应用 (μ TAS或芯片上实验室 ) 3.3 芯片实验室中微流体输运网络的合理选择之一 -灵巧 (Smart)
关键词
微系统
CELT
电渗
α-TAS
芯片上实验室
电化学
应用
微电子技术
Keywords
Microsystem,CELT,Electro-osmosis, μTAS, Lab on A Chip
分类号
O646 [理学—物理化学]
TN4 [电子电信—微电子学与固体电子学]
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职称材料
题名
一种电驱动高倍率、连续、无损伤浓缩装置的研究
被引量:
1
4
作者
林华水
陈良格
张润香
罗凡
胡维玲
田昭武
机构
厦门大学化学化工学院化学系固体表面物理化学国家重点实验室
出处
《电化学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期144-147,共4页
基金
国家自然科学基金(20475047)
专项基金(29927001)资助
文摘
提出使用膜聚焦浓缩方法并建立电驱动高倍率、连续、无损伤装置.分别以溴酚蓝、荧光素钠溶液为浓缩对象进行测试.该实验装置达近2个数量级浓缩效果,并可根据需要放大,成为有规模产量的生产设备,也可微型化,成为结构简单小巧、可以装配到电泳、色谱、质谱或光谱等分离分析仪器的零部件,或集成在芯片上,成为芯片实验室的预浓缩元件.
关键词
浓缩装置
电泳
离子交换膜
Keywords
Concentrationdevice, Electrophoresis, Ion exchange membrane
分类号
TQ051 [化学工程]
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职称材料
题名
等速电泳新技术及仪器研究
5
作者
林华水
胡维玲
田昭武
机构
厦门大学化学系
出处
《福建分析测试》
CAS
1994年第3期124-125,128,共3页
文摘
本文提出一种新型的微机化、开放式毛细管等速电泳仪,同常规毛细管等速电泳仪比较,本仪器结构简单,价格便宜。实验条件、结果和曲线可打印或存盘。曲线可由XY记录仪记录。阳离子或阴离子的分析已获得满意的结果,临床应用已获得初步结果。
关键词
毛细管等速电泳
淌度
仪器结构
仪器研究
微机化
实验条件
电泳分离
电泳仪
离子迁移率
中性分子
分类号
O658.9 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
XYZ-2型高性能电化学离子色谱抑制柱
6
作者
胡维玲
林华水
机构
厦门大学固体表面物理化学国家重点实验室厦门大学物理化学研究所厦门大学化学系
出处
《电化学》
CAS
CSCD
1999年第2期212-217,共6页
文摘
本文研究离子色谱电化学抑制器的填料问题,提出以直径大小一致、中等磺化深度的球状树脂为最佳方案.改进后的抑制效率达99.98%,灵敏度提高了约10%,离子的峰高及保留时间的重现性均优良(c.v.<2).
关键词
抑制柱
填料
离子色谱
电导
抑制器
XYZ-2
Keywords
Ion chromatography,Conduct,Suppressor
分类号
O657.750.3 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于图神经网络的IL-6诱导肽预测方法
曹瑞芬
胡维玲
李强生
宾艳南
郑春厚
《华南理工大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
利用导电涂膜直接电解海水法防护生物腐蚀 1.模拟和测量技术
胡维玲
吴玲玲
周静
李竞新
罗瑾
林仲华
《电化学》
CAS
CSCD
1999
6
在线阅读
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职称材料
3
微系统科技的发展及电化学的新应用
田昭武
林华水
孙建军
周勇亮
祖延斌
田中群
罗瑾
林仲华
谢兆雄
胡维玲
胡涌刚
苏文煅
《电化学》
CAS
CSCD
2001
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
一种电驱动高倍率、连续、无损伤浓缩装置的研究
林华水
陈良格
张润香
罗凡
胡维玲
田昭武
《电化学》
CAS
CSCD
北大核心
2006
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
5
等速电泳新技术及仪器研究
林华水
胡维玲
田昭武
《福建分析测试》
CAS
1994
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
6
XYZ-2型高性能电化学离子色谱抑制柱
胡维玲
林华水
《电化学》
CAS
CSCD
1999
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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