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转录组测序技术识别腹膜后脂肪肉瘤预后相关基因
1
作者
叶长春
迟苗苗
+3 位作者
胡延昇
李鸽
孙学军
孙祺
《中国现代普通外科进展》
CAS
2024年第4期292-297,共6页
目的:通过转录组测序技术(RNA-Seq)比较腹膜后脂肪肉瘤(RPL)组织与正常脂肪组织基因表达谱的差异,识别预后相关的关键基因并探究其潜在机制。方法:收集RPL患者肿瘤组织与瘤旁正常脂肪组织进行RNA-Seq并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分...
目的:通过转录组测序技术(RNA-Seq)比较腹膜后脂肪肉瘤(RPL)组织与正常脂肪组织基因表达谱的差异,识别预后相关的关键基因并探究其潜在机制。方法:收集RPL患者肿瘤组织与瘤旁正常脂肪组织进行RNA-Seq并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析;基于TCGA数据库筛选预后相关的高风险基因并使用Kaplan-Meier曲线和受试者操作特征(ROC)曲线进行验证。结果:与正常脂肪组织相比,RPL组织中同时上调的基因共279个,主要富集在免疫反应过程和PPAR信号通路;结合TCGA数据集共鉴别出稳定的预后高风险基因7个,高风险组患者总生存率显著低于低风险组(P<0.05)。结论:KCNQ5、RBPJ等基因可能与RPL患者的不良预后相关,解析这些基因在RPL中的作用及机制有望为RPL患者诊疗策略的制定提供有力证据。
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关键词
腹膜后肿瘤
转录组测序技术
差异表达基因
预后
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题名
转录组测序技术识别腹膜后脂肪肉瘤预后相关基因
1
作者
叶长春
迟苗苗
胡延昇
李鸽
孙学军
孙祺
机构
西安交通大学第一附属医院普通外科
出处
《中国现代普通外科进展》
CAS
2024年第4期292-297,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(81972720)。
文摘
目的:通过转录组测序技术(RNA-Seq)比较腹膜后脂肪肉瘤(RPL)组织与正常脂肪组织基因表达谱的差异,识别预后相关的关键基因并探究其潜在机制。方法:收集RPL患者肿瘤组织与瘤旁正常脂肪组织进行RNA-Seq并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析;基于TCGA数据库筛选预后相关的高风险基因并使用Kaplan-Meier曲线和受试者操作特征(ROC)曲线进行验证。结果:与正常脂肪组织相比,RPL组织中同时上调的基因共279个,主要富集在免疫反应过程和PPAR信号通路;结合TCGA数据集共鉴别出稳定的预后高风险基因7个,高风险组患者总生存率显著低于低风险组(P<0.05)。结论:KCNQ5、RBPJ等基因可能与RPL患者的不良预后相关,解析这些基因在RPL中的作用及机制有望为RPL患者诊疗策略的制定提供有力证据。
关键词
腹膜后肿瘤
转录组测序技术
差异表达基因
预后
Keywords
Retroperitoneal neoplasms
Transcriptome sequencing
Differentially expressed genes
Prognosis
分类号
R735.4 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
转录组测序技术识别腹膜后脂肪肉瘤预后相关基因
叶长春
迟苗苗
胡延昇
李鸽
孙学军
孙祺
《中国现代普通外科进展》
CAS
2024
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