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‘潘那利’番茄碱性螺旋环螺旋转录因子基因的克隆与表达分析
被引量：
4
1
作者
胡佳蕙
王柏柯
+2 位作者
李宁
余庆辉
王娟
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期541-548,共8页
碱性螺旋环螺旋(basic/Helix-Loop-Helix,bHLH)转录因子是植物最大的转录因子家族之一,其广泛参与植物逆境胁迫响应。该研究从野生‘潘那利’番茄(Solanum pennellii Correll)中成功克隆出bHLH转录因子基因SpbHLH89(Sol Genomics登录号S...
碱性螺旋环螺旋(basic/Helix-Loop-Helix,bHLH)转录因子是植物最大的转录因子家族之一,其广泛参与植物逆境胁迫响应。该研究从野生‘潘那利’番茄(Solanum pennellii Correll)中成功克隆出bHLH转录因子基因SpbHLH89(Sol Genomics登录号Sopen04g001150),采用qRT-PCR分析其在干旱胁迫下的表达模式,并利用异源表达初步分析其对非生物胁迫的响应。结果表明:(1)SpbHLH89编码区包含684 bp,编码227个氨基酸,具有典型的碱性螺旋环螺旋区,主要定位于细胞核中;进化树结果显示,SpbHLH89转录因子高度保守,与拟绒毛烟草NtbHLH94(Nicotiana tomentosiformis)存在高度相似性。(2)qRT-PCR结果显示,SpbHLH89在‘潘那利’番茄的茎、叶和花中均有表达,其表达量受干旱胁迫诱导。(3)SDS-PAGE与Western bloting结果显示,pET-30a-SpbHLH89重组蛋白大小约为31 kD。(4)在盐胁迫(400 mmol/L NaCl)和干旱胁迫(600 mmol/L甘露醇)条件下,异源表达重组蛋白的E.coli BL21(DE3)重组菌生长速度提高,说明异源表达SpbHLH89转录因子基因可提高细菌对非生物胁迫的耐受性。
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关键词
‘潘那利’番茄
SpbHLH89
亚细胞定位
表达模式
原核表达
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职称材料
番茄转录因子基因SlWRKY6的克隆与原核表达分析
被引量：
10
2
作者
周涛
王娟
+3 位作者
胡佳蕙
王柏柯
李宁
余庆辉
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第11期1824-1832,共9页
该研究基于番茄基因组数据库SGN(Sol Genomic Network)信息,利用RT-PCR从栽培番茄‘M82’(Solanum lycopersicum)中成功克隆到番茄SlWRKY6基因(登录号:Solyc02g080890),通过qRT-PCR方法和原核表达初步验证其生物学功能。结果表明:(1)生...
该研究基于番茄基因组数据库SGN(Sol Genomic Network)信息,利用RT-PCR从栽培番茄‘M82’(Solanum lycopersicum)中成功克隆到番茄SlWRKY6基因(登录号:Solyc02g080890),通过qRT-PCR方法和原核表达初步验证其生物学功能。结果表明:(1)生物信息学分析显示,番茄SlWRKY6基因ORF全长1653 bp,编码550个氨基酸,其蛋白结构含有1个WRKYGQK保守结构域和C2H2锌指结构域,属于IIb类;其基因启动子上游1500 bp含有多个激素响应元件和非生物胁迫响应元件。(2)进化树分析显示,SlWRKY6与潘那利番茄SpWRKY31-X1(NP_001352691.1)的相似性最高,且定位于细胞核内。(3)qRT-PCR结果显示,SlWRKY6基因在番茄根、茎、叶中均有表达,在叶中的表达量最高,且受盐和干旱诱导表达。(4)SDS-PAGE及Western blot结果显示,pET-30a-SlWRKY6重组蛋白的大小约66 kDa,与预期大小一致。(5)原核表达分析显示,重组菌E.coli BL21∷pET-30a-SlWRKY6在不同浓度盐(NaCl)和干旱(Mannitol)胁迫下生长速度显著低于对照菌E.coli BL21∷pET-30a,且在400 mmol/L NaCl、800 mmol/L甘露醇胁迫条件下最为显著;滴板实验初步验证SlWRKY6转录因子能提高重组菌E.coli BL21∷pET-30a-SlWRKY6在ABA和pH 9(NaOH)胁迫的耐受性;在400 mmol/L NaCl、pH 5(HCl)、800 mmol/L甘露醇胁迫条件下耐受能力降低。研究表明,SlWRKY6转录因子可能通过参与ABA途径来响应非生物胁迫。
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关键词
番茄
SlWRKY6
亚细胞定位
QRT-PCR
原核表达
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职称材料
题名
‘潘那利’番茄碱性螺旋环螺旋转录因子基因的克隆与表达分析
被引量：
4
1
作者
胡佳蕙
王柏柯
李宁
余庆辉
王娟
机构
新疆农业科学院园艺作物研究所
新疆农业大学园艺学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期541-548,共8页
基金
中国博士后科学基金面上资助(2019M663862)
天山青年计划(2019Q048)。
文摘
碱性螺旋环螺旋(basic/Helix-Loop-Helix,bHLH)转录因子是植物最大的转录因子家族之一,其广泛参与植物逆境胁迫响应。该研究从野生‘潘那利’番茄(Solanum pennellii Correll)中成功克隆出bHLH转录因子基因SpbHLH89(Sol Genomics登录号Sopen04g001150),采用qRT-PCR分析其在干旱胁迫下的表达模式,并利用异源表达初步分析其对非生物胁迫的响应。结果表明:(1)SpbHLH89编码区包含684 bp,编码227个氨基酸,具有典型的碱性螺旋环螺旋区,主要定位于细胞核中;进化树结果显示,SpbHLH89转录因子高度保守,与拟绒毛烟草NtbHLH94(Nicotiana tomentosiformis)存在高度相似性。(2)qRT-PCR结果显示,SpbHLH89在‘潘那利’番茄的茎、叶和花中均有表达,其表达量受干旱胁迫诱导。(3)SDS-PAGE与Western bloting结果显示,pET-30a-SpbHLH89重组蛋白大小约为31 kD。(4)在盐胁迫(400 mmol/L NaCl)和干旱胁迫(600 mmol/L甘露醇)条件下,异源表达重组蛋白的E.coli BL21(DE3)重组菌生长速度提高,说明异源表达SpbHLH89转录因子基因可提高细菌对非生物胁迫的耐受性。
关键词
‘潘那利’番茄
SpbHLH89
亚细胞定位
表达模式
原核表达
Keywords
Solanum pennellii
SpbHLH89
subcelluar localization
expression pattern
prokaryotic expression
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
番茄转录因子基因SlWRKY6的克隆与原核表达分析
被引量：
10
2
作者
周涛
王娟
胡佳蕙
王柏柯
李宁
余庆辉
机构
新疆农业科学院园艺作物研究所
新疆生物资源基因工程重点实验室/新疆大学生命科学与技术学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第11期1824-1832,共9页
基金
国家重点研发计划(2017YFD0101906)
新疆农业科学院重点项目前期预研专项(xjzdy-003)
现代农业产业技术体系专项(CARS-23-G25)。
文摘
该研究基于番茄基因组数据库SGN(Sol Genomic Network)信息,利用RT-PCR从栽培番茄‘M82’(Solanum lycopersicum)中成功克隆到番茄SlWRKY6基因(登录号:Solyc02g080890),通过qRT-PCR方法和原核表达初步验证其生物学功能。结果表明:(1)生物信息学分析显示,番茄SlWRKY6基因ORF全长1653 bp,编码550个氨基酸,其蛋白结构含有1个WRKYGQK保守结构域和C2H2锌指结构域,属于IIb类;其基因启动子上游1500 bp含有多个激素响应元件和非生物胁迫响应元件。(2)进化树分析显示,SlWRKY6与潘那利番茄SpWRKY31-X1(NP_001352691.1)的相似性最高,且定位于细胞核内。(3)qRT-PCR结果显示,SlWRKY6基因在番茄根、茎、叶中均有表达,在叶中的表达量最高,且受盐和干旱诱导表达。(4)SDS-PAGE及Western blot结果显示,pET-30a-SlWRKY6重组蛋白的大小约66 kDa,与预期大小一致。(5)原核表达分析显示,重组菌E.coli BL21∷pET-30a-SlWRKY6在不同浓度盐(NaCl)和干旱(Mannitol)胁迫下生长速度显著低于对照菌E.coli BL21∷pET-30a,且在400 mmol/L NaCl、800 mmol/L甘露醇胁迫条件下最为显著;滴板实验初步验证SlWRKY6转录因子能提高重组菌E.coli BL21∷pET-30a-SlWRKY6在ABA和pH 9(NaOH)胁迫的耐受性;在400 mmol/L NaCl、pH 5(HCl)、800 mmol/L甘露醇胁迫条件下耐受能力降低。研究表明,SlWRKY6转录因子可能通过参与ABA途径来响应非生物胁迫。
关键词
番茄
SlWRKY6
亚细胞定位
QRT-PCR
原核表达
Keywords
Solanum lycopersicum
SlWRKY6
subcellular localization
qRT-PCR
prokaryotic expression
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
‘潘那利’番茄碱性螺旋环螺旋转录因子基因的克隆与表达分析
胡佳蕙
王柏柯
李宁
余庆辉
王娟
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
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下载PDF
职称材料
2
番茄转录因子基因SlWRKY6的克隆与原核表达分析
周涛
王娟
胡佳蕙
王柏柯
李宁
余庆辉
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
10
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