目的运用网络药理学方法及分子对接技术探讨黄芪-半夏”药对治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法通过文献查找及TCMSP数据库筛选“黄芪-半夏”药对主要成分及作用靶点,在GeneCards、PharmGKB、DrugBank、OMIM数据库获取NSCLC相关靶...目的运用网络药理学方法及分子对接技术探讨黄芪-半夏”药对治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法通过文献查找及TCMSP数据库筛选“黄芪-半夏”药对主要成分及作用靶点,在GeneCards、PharmGKB、DrugBank、OMIM数据库获取NSCLC相关靶点,利用Cytoscape软件分别构建“中药-成分-靶点”“中药-成分-靶点-疾病”相互作用网络;运用STRING数据库构建蛋白互作网络,并根据拓扑学参数筛选“黄芪-半夏”药对治疗NSCLC的关键靶点;对关键靶点进行GO功能富集和KEGG通路分析,并构建“成分-靶点-通路”网络图,运用Auto Dock Vina 1.1.2将得到的主要活性成分与关键靶点进行分子对接,运用PyMOL软件进行结果可视化。结果共获得“黄芪-半夏”药对有效成分33个,作用于227个潜在靶点,NSCLC靶点1253个,拓扑分析得到关键靶点97个,其中度值≥中位数的靶点有48个,包括TP53、AKT1、CASP3、JUN等。GO功能富集分析得到生物过程主要涉及细胞因子介导的信号通路,基因表达的正向调控,RNA聚合酶II启动子转录的正调控;KEGG通路富集分析主要包括Pathways in cancer通路、肿瘤坏死因子信号通路、PI3K-Akt通路等,分子对接结果显示,“黄芪-半夏”药对主要活性化合物与5个核心靶点的结合能力皆良好。结论“黄芪-半夏”药对可能通过槲皮素、山奈酚、黄芩素等主要活性成分,作用于TP53、AKT1、CASP3、JUN、VEGFA等相关靶点,干预Pathways in cancer、肿瘤坏死因子、PI3K-Akt等信号通路,协同产生调控肿瘤细胞周期、介导肿瘤细胞凋亡、抑制其增殖分化及转移等来防治NSCLC。展开更多
文摘目的运用网络药理学方法及分子对接技术探讨黄芪-半夏”药对治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法通过文献查找及TCMSP数据库筛选“黄芪-半夏”药对主要成分及作用靶点,在GeneCards、PharmGKB、DrugBank、OMIM数据库获取NSCLC相关靶点,利用Cytoscape软件分别构建“中药-成分-靶点”“中药-成分-靶点-疾病”相互作用网络;运用STRING数据库构建蛋白互作网络,并根据拓扑学参数筛选“黄芪-半夏”药对治疗NSCLC的关键靶点;对关键靶点进行GO功能富集和KEGG通路分析,并构建“成分-靶点-通路”网络图,运用Auto Dock Vina 1.1.2将得到的主要活性成分与关键靶点进行分子对接,运用PyMOL软件进行结果可视化。结果共获得“黄芪-半夏”药对有效成分33个,作用于227个潜在靶点,NSCLC靶点1253个,拓扑分析得到关键靶点97个,其中度值≥中位数的靶点有48个,包括TP53、AKT1、CASP3、JUN等。GO功能富集分析得到生物过程主要涉及细胞因子介导的信号通路,基因表达的正向调控,RNA聚合酶II启动子转录的正调控;KEGG通路富集分析主要包括Pathways in cancer通路、肿瘤坏死因子信号通路、PI3K-Akt通路等,分子对接结果显示,“黄芪-半夏”药对主要活性化合物与5个核心靶点的结合能力皆良好。结论“黄芪-半夏”药对可能通过槲皮素、山奈酚、黄芩素等主要活性成分,作用于TP53、AKT1、CASP3、JUN、VEGFA等相关靶点,干预Pathways in cancer、肿瘤坏死因子、PI3K-Akt等信号通路,协同产生调控肿瘤细胞周期、介导肿瘤细胞凋亡、抑制其增殖分化及转移等来防治NSCLC。
