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洋山深水港海域表层海水中古菌多样性特点
被引量：
4
1
作者
孙国伟
肖劲洲
+4 位作者
陈小兵
王洪明
龚超文
潘迎捷
王永杰
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2014年第5期13-20,共8页
利用DGGE、定量PCR以及16S rRNA基因克隆文库技术对洋山深水港海域表层海水中的古菌多样性组成进行了调查和分析.通过Quantity One软件分析不同样品的DGGE图谱,发现洋山深水港3个不同海域（小洋山港口区、大洋山港口区、中间航道）的古...
利用DGGE、定量PCR以及16S rRNA基因克隆文库技术对洋山深水港海域表层海水中的古菌多样性组成进行了调查和分析.通过Quantity One软件分析不同样品的DGGE图谱,发现洋山深水港3个不同海域（小洋山港口区、大洋山港口区、中间航道）的古菌群落多样性组成不存在明显的区别;利用定量PCR的方法对3个不同样品中的古菌16S rRNA基因拷贝进行计数,发现3个不同海域的古菌16S rRNA基因拷贝数的数量关系为：大洋山海域（（1.69±0.19）×106 copies/mL）＜中间航道（（2.17±0.20）×106 copies/mL）＜小洋山港口区（（2.42±0.22）× 106 copies/mL）,这说明洋山深水港3个不同海域的古菌群落组成是一致的,只是在数量上略有差异,为对该海域古菌的更深入调查研究提供了便利和数据基础.洋山深水港海域表层海水的古菌16S rRNA基因文库分析表明,古菌由三大门类组成：广古菌门（Euryarchaeota）、泉古菌门（Crenarchaeota）和奇古菌门（Thaumarchaeota）.广古菌门所占比例约为26.8％,泉古菌门约为33.0％,奇古菌门约为40.2％.广古菌门含有2个类群,分别是Mathanobacteriales（10.3％）和Marine Group Ⅱ（16.5％）;泉古菌门含有1个类群,为Unidentified Crenarchaeotic Group（33.0％）;奇古菌门含有1个类群,为Marine Group Ⅰ （40.2％）.结果显示,Mathanobacteriales类群和Marine Group Ⅱ类群的比例失调,这可能预示着洋山深水港海域存在油污污染及外来微生物物种入侵的风险.
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关键词
洋山深水港
表层海水
16S
RRNA基因
古菌
多样性
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职称材料
养殖中华绒螯蟹肠道内优势细菌群组成分析
被引量：
6
2
作者
狄盼盼
陈小兵
+2 位作者
孙国伟
肖劲洲
潘迎捷
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2014年第1期58-61,共4页
采用荧光染色计数法对养殖中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)肠道内微生物进行定量分析。结果表明肠道内细菌数量为(2.5±0.9)×106/μL。同时采用分离培养与16S rDNA基因克隆测序相结合的方法对其进行多样性分析,旨在揭示其中可...
采用荧光染色计数法对养殖中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)肠道内微生物进行定量分析。结果表明肠道内细菌数量为(2.5±0.9)×106/μL。同时采用分离培养与16S rDNA基因克隆测序相结合的方法对其进行多样性分析,旨在揭示其中可培养细菌的组成结构。结果发现,分离自养殖中华绒螯蟹肠道内的49株代表性细菌均属于γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria),其中假单胞菌属(Pseudomonas)、气单胞菌属(Aeromonas)和肠杆菌科(Enterobacteriales)为优势菌群。
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关键词
中华绒螯蟹
肠道微生物
优势菌群
克隆测序
荧光染色计数
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职称材料
枸杞岛海域表层水真菌群落多样性研究
被引量：
2
3
作者
王雪
肖劲洲
王永杰
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2021年第6期11-17,共7页
通过扩增子测序,分析了枸杞岛附近海域表层水中真菌群落组成及其多样性特征。结果表明,枸杞岛周围海域真菌群落组成稳定,优势真菌菌门为子囊菌门(Ascomycota),优势菌纲为座囊菌纲(Dothideomycetes),优势真菌属包括Hortaea、青霉菌属(Pen...
通过扩增子测序,分析了枸杞岛附近海域表层水中真菌群落组成及其多样性特征。结果表明,枸杞岛周围海域真菌群落组成稳定,优势真菌菌门为子囊菌门(Ascomycota),优势菌纲为座囊菌纲(Dothideomycetes),优势真菌属包括Hortaea、青霉菌属(Penicillium)、曲霉菌属(Aspergillus)。其中丰度最高的OTU1765属于威尼克外瓶霉(Hortaea werneckii),经FUNGuild功能预测发现这是一种潜在的人类和植物病原真菌。枸杞岛附近海域表层水中真菌群落的生态功能组成比较丰富,主要为植物病原菌和未明确的腐生真菌。研究结果揭示了枸杞岛附近海域表层水中的真菌群落组成特点,为枸杞岛附近海域表层水中微生物资源的开发利用及环境保护提供参考。
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关键词
枸杞岛
真菌群落
多样性
植物病原菌
威尼克外瓶霉(Hortaea
werneckii)
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职称材料
题名
洋山深水港海域表层海水中古菌多样性特点
被引量：
4
1
作者
孙国伟
肖劲洲
陈小兵
王洪明
龚超文
潘迎捷
王永杰
机构
上海海洋大学食品学院
上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心
农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海)
出处
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2014年第5期13-20,共8页
基金
国家自然科学基金(41376135)
上海高校特聘教授东方学者岗位计划基金(20101222)
+1 种基金
上海市人才发展基金(2011010)
上海市科委工程中心建设(11DZ2280300)
文摘
利用DGGE、定量PCR以及16S rRNA基因克隆文库技术对洋山深水港海域表层海水中的古菌多样性组成进行了调查和分析.通过Quantity One软件分析不同样品的DGGE图谱,发现洋山深水港3个不同海域（小洋山港口区、大洋山港口区、中间航道）的古菌群落多样性组成不存在明显的区别;利用定量PCR的方法对3个不同样品中的古菌16S rRNA基因拷贝进行计数,发现3个不同海域的古菌16S rRNA基因拷贝数的数量关系为：大洋山海域（（1.69±0.19）×106 copies/mL）＜中间航道（（2.17±0.20）×106 copies/mL）＜小洋山港口区（（2.42±0.22）× 106 copies/mL）,这说明洋山深水港3个不同海域的古菌群落组成是一致的,只是在数量上略有差异,为对该海域古菌的更深入调查研究提供了便利和数据基础.洋山深水港海域表层海水的古菌16S rRNA基因文库分析表明,古菌由三大门类组成：广古菌门（Euryarchaeota）、泉古菌门（Crenarchaeota）和奇古菌门（Thaumarchaeota）.广古菌门所占比例约为26.8％,泉古菌门约为33.0％,奇古菌门约为40.2％.广古菌门含有2个类群,分别是Mathanobacteriales（10.3％）和Marine Group Ⅱ（16.5％）;泉古菌门含有1个类群,为Unidentified Crenarchaeotic Group（33.0％）;奇古菌门含有1个类群,为Marine Group Ⅰ （40.2％）.结果显示,Mathanobacteriales类群和Marine Group Ⅱ类群的比例失调,这可能预示着洋山深水港海域存在油污污染及外来微生物物种入侵的风险.
关键词
洋山深水港
表层海水
16S
RRNA基因
古菌
多样性
Keywords
Yangshan deep-water port
surface seawater
16S rRNA gene
archabacteria
diversity
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
养殖中华绒螯蟹肠道内优势细菌群组成分析
被引量：
6
2
作者
狄盼盼
陈小兵
孙国伟
肖劲洲
潘迎捷
机构
上海海洋大学农业部水产品贮藏保鲜风险评估重点实验室
出处
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2014年第1期58-61,共4页
基金
上海市科委项目(10540503000)
文摘
采用荧光染色计数法对养殖中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)肠道内微生物进行定量分析。结果表明肠道内细菌数量为(2.5±0.9)×106/μL。同时采用分离培养与16S rDNA基因克隆测序相结合的方法对其进行多样性分析,旨在揭示其中可培养细菌的组成结构。结果发现,分离自养殖中华绒螯蟹肠道内的49株代表性细菌均属于γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria),其中假单胞菌属(Pseudomonas)、气单胞菌属(Aeromonas)和肠杆菌科(Enterobacteriales)为优势菌群。
关键词
中华绒螯蟹
肠道微生物
优势菌群
克隆测序
荧光染色计数
Keywords
Chinese mitten crab （Eriocheir sinensis）
intestinal microbes
dominant community
clone sequencing
fluorescent staining enumeration
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
枸杞岛海域表层水真菌群落多样性研究
被引量：
2
3
作者
王雪
肖劲洲
王永杰
机构
上海海洋大学食品学院
农业农村部水产品质量安全贮藏保鲜风险评估实验室(上海)
出处
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2021年第6期11-17,共7页
基金
国家自然科学基金项目(41376135)。
文摘
通过扩增子测序,分析了枸杞岛附近海域表层水中真菌群落组成及其多样性特征。结果表明,枸杞岛周围海域真菌群落组成稳定,优势真菌菌门为子囊菌门(Ascomycota),优势菌纲为座囊菌纲(Dothideomycetes),优势真菌属包括Hortaea、青霉菌属(Penicillium)、曲霉菌属(Aspergillus)。其中丰度最高的OTU1765属于威尼克外瓶霉(Hortaea werneckii),经FUNGuild功能预测发现这是一种潜在的人类和植物病原真菌。枸杞岛附近海域表层水中真菌群落的生态功能组成比较丰富,主要为植物病原菌和未明确的腐生真菌。研究结果揭示了枸杞岛附近海域表层水中的真菌群落组成特点,为枸杞岛附近海域表层水中微生物资源的开发利用及环境保护提供参考。
关键词
枸杞岛
真菌群落
多样性
植物病原菌
威尼克外瓶霉(Hortaea
werneckii)
Keywords
Gouqi Island
fungal community
diversity
plant pathogenic fungi
Hortaea wernecki
分类号
Q939.99 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
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1
洋山深水港海域表层海水中古菌多样性特点
孙国伟
肖劲洲
陈小兵
王洪明
龚超文
潘迎捷
王永杰
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2014
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
养殖中华绒螯蟹肠道内优势细菌群组成分析
狄盼盼
陈小兵
孙国伟
肖劲洲
潘迎捷
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2014
6
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职称材料
3
枸杞岛海域表层水真菌群落多样性研究
王雪
肖劲洲
王永杰
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2021
2
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职称材料
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