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中国西北地区婴儿肠道长双歧杆菌婴儿亚种的遗传差异及益生特性分析
1
作者
耿欣雅
安美玲
+3 位作者
张瑞瑞
孙芳芳
孙海龙
倪永清
《食品科学》
北大核心
2025年第20期121-132,共12页
本研究通过培养法结合聚合酶链式反应基因检测,从西北地区150份婴儿粪便样品中分离并鉴定出23株长双歧杆菌婴儿亚种(Bifidobacterium longum subsp.infantis,B.infantis),分离率仅为10.67%,并对其基因组、益生特性进行了比较分析。基因...
本研究通过培养法结合聚合酶链式反应基因检测,从西北地区150份婴儿粪便样品中分离并鉴定出23株长双歧杆菌婴儿亚种(Bifidobacterium longum subsp.infantis,B.infantis),分离率仅为10.67%,并对其基因组、益生特性进行了比较分析。基因组分析表明,B.infantis的平均GC含量、基因组长度、编码序列数量分别为59.81%、2.61 Mb、2273;基于核心基因的系统发育分析及平均核苷酸一致性分析表明,相同地理宿主来源的菌株具有较高遗传相似性,其菌株系统发育更相近。不同菌株基因组中与植物源碳水化合物代谢相关的基因存在差异。碳水化合物代谢实验结果表明,绝大部分B.infantis菌株能够代谢低聚半乳糖、低聚果糖、菊糖等益生元,与糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH)32、GH43在其基因组中的存在相印证,4株菌(A47X1、A79X4、A79X3、S19X4)能够利用木糖。菌株B.infantis S8X8、S5X8_2能最有效地抑制致泻大肠埃希氏菌、产肠毒素大肠埃希氏菌、鼠伤寒血清型肠沙门氏菌肠亚种、出血性大肠埃希氏菌、血清型肠炎沙门氏菌,但不能抑制单核细胞增生李斯特菌。B.infantis的基因组中检测到利福平抗性基因、莫匹罗星抗性基因、氨基糖苷类抗性基因等内源性抗性基因,未检测到致病性毒力因子。所有B.infantis分离株对万古霉素、庆大霉素和链霉素敏感。本研究对中国不同地域人群B.infantis菌株进行了有效分离,通过基因型及表型特征分析揭示了菌株的安全性及功能特性,可为针对不同地域婴幼儿开发个性化益生菌制剂提供参考依据。
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关键词
长双歧杆菌婴儿亚种
比较基因组学
益生特性
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职称材料
题名
中国西北地区婴儿肠道长双歧杆菌婴儿亚种的遗传差异及益生特性分析
1
作者
耿欣雅
安美玲
张瑞瑞
孙芳芳
孙海龙
倪永清
机构
石河子大学食品学院
新疆生产建设兵团乳制品产业创新研究院
新疆石河子花园乳业有限公司
出处
《食品科学》
北大核心
2025年第20期121-132,共12页
基金
新疆生产建设兵团重点领域科技攻关项目(2023AB050,2024AB050,2022DB008)
八师重点领域科技攻关项目(2024GY02)
国家自然科学基金-新疆联合基金重点项目(U1903205)。
文摘
本研究通过培养法结合聚合酶链式反应基因检测,从西北地区150份婴儿粪便样品中分离并鉴定出23株长双歧杆菌婴儿亚种(Bifidobacterium longum subsp.infantis,B.infantis),分离率仅为10.67%,并对其基因组、益生特性进行了比较分析。基因组分析表明,B.infantis的平均GC含量、基因组长度、编码序列数量分别为59.81%、2.61 Mb、2273;基于核心基因的系统发育分析及平均核苷酸一致性分析表明,相同地理宿主来源的菌株具有较高遗传相似性,其菌株系统发育更相近。不同菌株基因组中与植物源碳水化合物代谢相关的基因存在差异。碳水化合物代谢实验结果表明,绝大部分B.infantis菌株能够代谢低聚半乳糖、低聚果糖、菊糖等益生元,与糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH)32、GH43在其基因组中的存在相印证,4株菌(A47X1、A79X4、A79X3、S19X4)能够利用木糖。菌株B.infantis S8X8、S5X8_2能最有效地抑制致泻大肠埃希氏菌、产肠毒素大肠埃希氏菌、鼠伤寒血清型肠沙门氏菌肠亚种、出血性大肠埃希氏菌、血清型肠炎沙门氏菌,但不能抑制单核细胞增生李斯特菌。B.infantis的基因组中检测到利福平抗性基因、莫匹罗星抗性基因、氨基糖苷类抗性基因等内源性抗性基因,未检测到致病性毒力因子。所有B.infantis分离株对万古霉素、庆大霉素和链霉素敏感。本研究对中国不同地域人群B.infantis菌株进行了有效分离,通过基因型及表型特征分析揭示了菌株的安全性及功能特性,可为针对不同地域婴幼儿开发个性化益生菌制剂提供参考依据。
关键词
长双歧杆菌婴儿亚种
比较基因组学
益生特性
Keywords
Bifidobacterium longum subsp.infantis
comparative genomics
probiotic properties
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
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1
中国西北地区婴儿肠道长双歧杆菌婴儿亚种的遗传差异及益生特性分析
耿欣雅
安美玲
张瑞瑞
孙芳芳
孙海龙
倪永清
《食品科学》
北大核心
2025
0
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