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冬瓜ARF4基因克隆及表达特性分析
1
作者
程晓欣
翟许玲
+5 位作者
闫晋强
王宝琛
莫仁连
刘文睿
吴智明
江彪
《广东农业科学》
2024年第11期93-101,共9页
【目的】克隆冬瓜(Benincasahispida)ARF4基因,开展生物信息学分析,并研究其在不同组织的表达模式,为进一步深入探究BhARF4在冬瓜果实发育中的功能提供参考。【方法】以冬瓜高代自交系B227开花当天的果实cDNA为模板,根据参考基因中BhARF...
【目的】克隆冬瓜(Benincasahispida)ARF4基因,开展生物信息学分析,并研究其在不同组织的表达模式,为进一步深入探究BhARF4在冬瓜果实发育中的功能提供参考。【方法】以冬瓜高代自交系B227开花当天的果实cDNA为模板,根据参考基因中BhARF4的CDS序列设计引物克隆BhARF4。在结果期,取B227不同组织(根、茎、叶、开花当天的雌花和雄花),及授粉后0、5、10、15、20、30 d的果实样本,通过qRT-PCR分析BhARF4在冬瓜不同组织的表达模式。【结果】BhARF4含有12个外显子和2个内含子,CDS序列长2412bp;motif和保守结构域分析显示,BhARF4蛋白含9个motif并含有保守的ARF、AUX_IAA和B3结构域;系统进化分析显示,BhARF4蛋白与黄瓜、甜瓜的ARF4蛋白亲缘关系最近,与拟南芥、中国南瓜的ARF4蛋白亲缘关系最远;基因表达模式分析显示,4种葫芦科作物中,ARF4在甜瓜中表达量较高,在冬瓜和黄瓜中表达量较低。此外,ARF4在11份不同果型大小的冬瓜种质中的表达具有特异性,其在B227中表达量明显高于其他冬瓜材料。BhARF4在冬瓜果实中表达量较高,尤其是当天授粉的果实,其次是叶、茎、根,在雄花中的表达量最低。亚细胞定位分析发现BhARF4蛋白定位于细胞核。【结论】明确了BhARF4的基因结构、BhARF4蛋白保守结构域等生物学信息特征,以及基因表达模式,推测BhARF4在冬瓜果实生长阶段,尤其是果实生长初期发挥重要作用,且该基因在不同冬瓜材料中表达具有特异性。
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关键词
冬瓜
ARF
果实发育
基因克隆
生物信息学
表达分析
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职称材料
题名
冬瓜ARF4基因克隆及表达特性分析
1
作者
程晓欣
翟许玲
闫晋强
王宝琛
莫仁连
刘文睿
吴智明
江彪
机构
仲恺农业工程学院园艺园林学院
广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室
出处
《广东农业科学》
2024年第11期93-101,共9页
基金
国家自然科学基金(32202504)
广西科技计划项目(桂科AA22068086)
江门市科技计划项目(江科[2022]191)。
文摘
【目的】克隆冬瓜(Benincasahispida)ARF4基因,开展生物信息学分析,并研究其在不同组织的表达模式,为进一步深入探究BhARF4在冬瓜果实发育中的功能提供参考。【方法】以冬瓜高代自交系B227开花当天的果实cDNA为模板,根据参考基因中BhARF4的CDS序列设计引物克隆BhARF4。在结果期,取B227不同组织(根、茎、叶、开花当天的雌花和雄花),及授粉后0、5、10、15、20、30 d的果实样本,通过qRT-PCR分析BhARF4在冬瓜不同组织的表达模式。【结果】BhARF4含有12个外显子和2个内含子,CDS序列长2412bp;motif和保守结构域分析显示,BhARF4蛋白含9个motif并含有保守的ARF、AUX_IAA和B3结构域;系统进化分析显示,BhARF4蛋白与黄瓜、甜瓜的ARF4蛋白亲缘关系最近,与拟南芥、中国南瓜的ARF4蛋白亲缘关系最远;基因表达模式分析显示,4种葫芦科作物中,ARF4在甜瓜中表达量较高,在冬瓜和黄瓜中表达量较低。此外,ARF4在11份不同果型大小的冬瓜种质中的表达具有特异性,其在B227中表达量明显高于其他冬瓜材料。BhARF4在冬瓜果实中表达量较高,尤其是当天授粉的果实,其次是叶、茎、根,在雄花中的表达量最低。亚细胞定位分析发现BhARF4蛋白定位于细胞核。【结论】明确了BhARF4的基因结构、BhARF4蛋白保守结构域等生物学信息特征,以及基因表达模式,推测BhARF4在冬瓜果实生长阶段,尤其是果实生长初期发挥重要作用,且该基因在不同冬瓜材料中表达具有特异性。
关键词
冬瓜
ARF
果实发育
基因克隆
生物信息学
表达分析
Keywords
Benincasa hispida
ARF
fruit development
gene cloning
bioinformatics
expression analysis
分类号
S642.3 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
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1
冬瓜ARF4基因克隆及表达特性分析
程晓欣
翟许玲
闫晋强
王宝琛
莫仁连
刘文睿
吴智明
江彪
《广东农业科学》
2024
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