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烟草自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族的鉴定与分析
被引量：
1
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作者
陈邦兰
翟梦倩
+6 位作者
龙涛
赵顺程
刘娟
尹茂灵
万心言
王治杰
刘继恺
《安徽农业科学》
CAS
2021年第3期100-104,109,共6页
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用。为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信...
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用。为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信息,利用生物信息学方法对烟草NRAMP基因家族成员进行了鉴定,对其基本信息、结构特点、蛋白理化性质及保守序列、启动子元件和组织表达模式等进行了分析。结果表明:烟草基因组含有9个NtNRAMP基因,分别命名为NtNRAMP1.1~6.2,其编码氨基酸长度为500~542 aa,蛋白分子量为54.31~59.11 kD,等电点为5.09~8.73,总平均亲水性为0.475~0.604;除了NRAMP6.1和6.2不含有motif4外,其余NRAMP蛋白都含有motif1~motif10。顺式作用元件分析表明所有NtNRAMP基因启动子中均含有参与基因转录、非生物胁迫、植物激素响应和光应答途径的元件,部分基因含有生物胁迫、次生代谢、组织表达和结合位点的元件。染色体定位发现,6个NtNRAMP基因分别分布在5条烟草染色体上。表达分析表明:NtNRAMP基因组织表达模式差异较大,其中NtNRAMP6.1和NtNRAMP6.2基因表达具有组织特异性。该研究结果为进一步研究烟草NtNRAMP基因的功能奠定了基础。
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关键词
自然抗性相关巨噬细胞蛋白
烟草
基因家族
表达分析
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职称材料
题名
烟草自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族的鉴定与分析
被引量：
1
1
作者
陈邦兰
翟梦倩
龙涛
赵顺程
刘娟
尹茂灵
万心言
王治杰
刘继恺
机构
西南科技大学生命科学与工程学院
伊犁师范大学生物与地理科学学院
西南科技大学核废物与环境安全国防重点实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
2021年第3期100-104,109,共6页
基金
西南科技大学大学生创新创业训练项目(S201910619065)
西南科技大学龙山人才科研支持计划(18LZX626)。
文摘
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(natural resistance associated macrophage proteins,NRAMPs)是一类高度保守的二价金属跨膜转运蛋白,在调控生物体内重金属稳态中发挥着重要作用。为了探究烟草NRAMP基因的多样性,该研究根据烟草基因组数据信息,利用生物信息学方法对烟草NRAMP基因家族成员进行了鉴定,对其基本信息、结构特点、蛋白理化性质及保守序列、启动子元件和组织表达模式等进行了分析。结果表明:烟草基因组含有9个NtNRAMP基因,分别命名为NtNRAMP1.1~6.2,其编码氨基酸长度为500~542 aa,蛋白分子量为54.31~59.11 kD,等电点为5.09~8.73,总平均亲水性为0.475~0.604;除了NRAMP6.1和6.2不含有motif4外,其余NRAMP蛋白都含有motif1~motif10。顺式作用元件分析表明所有NtNRAMP基因启动子中均含有参与基因转录、非生物胁迫、植物激素响应和光应答途径的元件,部分基因含有生物胁迫、次生代谢、组织表达和结合位点的元件。染色体定位发现,6个NtNRAMP基因分别分布在5条烟草染色体上。表达分析表明:NtNRAMP基因组织表达模式差异较大,其中NtNRAMP6.1和NtNRAMP6.2基因表达具有组织特异性。该研究结果为进一步研究烟草NtNRAMP基因的功能奠定了基础。
关键词
自然抗性相关巨噬细胞蛋白
烟草
基因家族
表达分析
Keywords
Natural resistance associated macrophage proteins
Nicotiana tabacum
Gene family
Expression analysis
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
烟草自然抗性相关巨噬细胞蛋白基因家族的鉴定与分析
陈邦兰
翟梦倩
龙涛
赵顺程
刘娟
尹茂灵
万心言
王治杰
刘继恺
《安徽农业科学》
CAS
2021
1
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