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牛樟芝Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子的全基因组鉴定与分析被引量：3: 1; 作者罗玛妮娅王毅 +3 位作者郑元张璋王娟杨宇明《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2021年第2期157-163,共7页; 为深入了解牛樟芝Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子的功能,利用本地Blast对牛樟芝全基因组的蛋白序列进行全局比对,鉴定出20个牛樟芝Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子蛋白序列。通过生物信息学方法对Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子进行结构和功能预测,并利用转录组测序分析... 展开更多; 关键词牛樟芝 Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子生物信息学表达分析转录组分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

小叶龙竹种子人工老化劣变特性研究被引量：3: 2; 作者罗玛妮娅张艺 +4 位作者普甜郭跻敏王娟杨宇明郑元《种子》北大核心 2021年第10期85-89,共5页; 以云南省红河州金平县采集的小叶龙竹(Dendrocalamus barbatus)种子为材料,利用人工气候箱进行高温高湿(相对湿度95%,温度40℃)的人工老化处理,以新鲜采收的种子作为对照,分别测定发芽率、发芽势、含水量等生长指标,以及电解质外渗率(R... 展开更多; 关键词小叶龙竹种子萌发人工老化生理生化特性; 在线阅读下载PDF 职称材料

竹叶花椒MYB基因家族的鉴定及其表达特性的分析被引量：10: 3; 作者冯发玉王毅 +4 位作者王丽娟罗玛妮娅徐令文杨彦萍陆斌《经济林研究》北大核心 2021年第4期148-157,共10页; 【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据... 展开更多; 关键词竹叶花椒 MYB 皮刺生物信息学分析基因表达分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

油橄榄AP2/ERF转录因子鉴定及水胁迫表达分析被引量：4: 4; 作者王丽娟王毅 +4 位作者陆斌罗玛妮娅徐令文原晓龙李贤忠《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期2032-2043,共12页; 为探究油橄榄AP2/ERF基因家族对水胁迫的响应机制,该研究对受干旱及水淹胁迫的‘佛奥’和‘TYZ-1号’2个品种的根和叶进行转录组测序,并对油橄榄中AP2/ERF转录因子的蛋白理化性质、基因结构及系统进化进行分析,同时分析与水胁迫相关的AP... 展开更多; 关键词油橄榄 AP2/ERF转录因子生物信息学基因表达谱水分胁迫; 在线阅读下载PDF 职称材料

牛樟芝羊毛甾醇合成酶基因AcLSS的克隆和表达分析被引量：3: 5; 作者郑元罗娅娜 +2 位作者罗玛妮娅张璋王毅《西南林业大学学报（自然科学）》 CAS 北大核心 2021年第3期94-99,共6页; 为探究牛樟芝羊毛甾醇合成酶的合成机制,对牛樟芝的一个羊毛甾醇合成酶基因进行克隆,将其命名为AcLSS,然后利用生物信息学软件对其理化性质进行预测,并对其表达情况进行初步分析。结果表明:AcLSS基因的开放阅读框为2205 bp,编码734个氨... 展开更多; 关键词牛樟芝羊毛甾醇合成酶基因克隆生物信息学; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名牛樟芝Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子的全基因组鉴定与分析被引量：3: 1; 作者罗玛妮娅王毅郑元张璋王娟杨宇明; 机构西南林业大学林学院云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室西南林业大学绿色发展研究院; 出处《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2021年第2期157-163,共7页; 基金云南省重大科技专项计划食用菌项目子课题(202002AE320003) 云南省博士后科研基金项目(188102) +1 种基金国家林业局云南珍稀濒特植物保护与繁育重点实验室开放基金项目(2016-01)。; 文摘为深入了解牛樟芝Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子的功能,利用本地Blast对牛樟芝全基因组的蛋白序列进行全局比对,鉴定出20个牛樟芝Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子蛋白序列。通过生物信息学方法对Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子进行结构和功能预测,并利用转录组测序分析Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子在不同段木培养条件下菌丝体和子实体的表达情况。结果表明:20个Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子均具有Cy6型锌指基序,属于GAL4型锌簇蛋白转录因子,其氨基酸数量为225~1384个;理论等电点平均pI值为6.91,均为不稳定蛋白;其中,AcCys6-17存在跨膜结构;AcCys6-9、AcCys6-14定位在细胞质中;平均每个转录因子含9个外显子,AcCys6-6有25个外显子,二级结构以无规卷曲为主要结构。Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子基因表达在不同段木的菌丝体和子实体存在差异,有11个转录因子在香樟段木菌丝体表达量高,AcCys6-16在香樟段木子实体表达量高;AcCys6-11在牛樟段木菌丝体表达量高;AcCys6-4在云南樟段木菌丝体表达量最高。; 关键词牛樟芝 Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子生物信息学表达分析转录组分析; Keywords Antrodia cinnamomea Zn(Ⅱ)2Cys6 transcription factor bioinformatics expression analysis transcriptome analysis; 分类号 Q939.5 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名小叶龙竹种子人工老化劣变特性研究被引量：3: 2; 作者罗玛妮娅张艺普甜郭跻敏王娟杨宇明郑元; 机构西南林业大学林学院西南林业大学绿色发展研究院; 出处《种子》北大核心 2021年第10期85-89,共5页; 基金云南省农业基础研究联合专项(2017 FG 001(-082)) 云南省高校优势特色重点学科(生物学)建设项目“国家林业局云南珍稀濒特植物保护与繁育重点实验室开放基金”(2016-01)。; 文摘以云南省红河州金平县采集的小叶龙竹(Dendrocalamus barbatus)种子为材料,利用人工气候箱进行高温高湿(相对湿度95%,温度40℃)的人工老化处理,以新鲜采收的种子作为对照,分别测定发芽率、发芽势、含水量等生长指标,以及电解质外渗率(REC)、游离脯氨酸(Pro)含量、超氧化物歧化酶(SOD)活性、过氧化物酶(POD)活性等生理生化指标。结果表明,在人工老化处理19 d期间,小叶龙竹种子含水量、发芽率和发芽势均随老化天数的增加呈不断下降的趋势,其REC和伤害度总体呈上升趋势,而Pro含量、SOD活性和POD活性均呈先上升后下降的变化趋势,并在老化第7天达到峰值,表明小叶龙竹种子在人工老化前期通过调节渗调作用和保护酶活性来维持相对较高的种子活力。; 关键词小叶龙竹种子萌发人工老化生理生化特性; Keywords Dendrocalamus barbatus seed germination artificial aging physiological and biochemical characteristics; 分类号 S795 [农业科学—林木遗传育种]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名竹叶花椒MYB基因家族的鉴定及其表达特性的分析被引量：10: 3; 作者冯发玉王毅王丽娟罗玛妮娅徐令文杨彦萍陆斌; 机构西南林业大学林学院云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南省林业和草原科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室; 出处《经济林研究》北大核心 2021年第4期148-157,共10页; 基金云南省重点研发计划项目“花椒产业提质增效关键技术与示范”(202102AE090013)。; 文摘【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据,为后续的无刺竹叶花椒品种的基因工程培育奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法,从测序获得的竹叶花椒转录组数据库中筛选MYB转录因子,对其蛋白基序、理化性质、系统进化关系、基因表达特性等进行分析,并利用qRT-PCR技术和基因克隆,对所选基因进行验证。【结果】从竹叶花椒中共鉴定出39条MYB转录因子序列,其中包括9个R1-MYB型基因、28个R2R3-MYB型基因、1个R3型基因和1个R4型基因。对其蛋白理化性质的分析结果表明:39个MYB转录因子所含氨基酸数量为101~621个,其均为可溶性蛋白,而其二级结构以无规则卷曲为主。亚细胞定位预测结果显示:39个MYB转录因子定位于细胞核的可能性最大,这符合转录因子调控下游基因的表达特性。基因表达情况的分析结果显示:部分MYB转录因子在竹叶花椒同一组织的不同发育时期的表达差异显著,其中ZaMYB10、ZaMYB23和ZaMYB25这3个基因的表达量随着皮刺的不断发育均呈逐渐增长的趋势,表明这3个基因可能与皮刺的生长发育相关。qRT-PCR分析结果表明:ZaMYB10基因在皮刺中有特异表达。基因克隆结果表明:ZaMYB10基因具有长为1032 bp的完整的cDNA开放阅读框,其编码343个氨基酸。【结论】鉴定出39个竹叶花椒MYB转录因子,其均包含SANT保守结构域,根据表达模式判断,其中的ZaMYB10转录因子可能参与了竹叶花椒皮刺生长发育的调控。; 关键词竹叶花椒 MYB 皮刺生物信息学分析基因表达分析; Keywords Zanthoxylum armatum MYB aculeus bioinformatics analysis gene expression profiles; 分类号 S603 [农业科学—园艺学] S573 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名油橄榄AP2/ERF转录因子鉴定及水胁迫表达分析被引量：4: 4; 作者王丽娟王毅陆斌罗玛妮娅徐令文原晓龙李贤忠; 机构西南林业大学林学院云南省林业和草原科学院; 出处《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期2032-2043,共12页; 基金国家“十三五”重点研发计划项目(2020YFD1000703) 中央财政林草技术推广项目(云【2021】TG01号) 云南省林业和草原科学院创新团队基金(LKYTD-2020-001)。; 文摘为探究油橄榄AP2/ERF基因家族对水胁迫的响应机制,该研究对受干旱及水淹胁迫的‘佛奥’和‘TYZ-1号’2个品种的根和叶进行转录组测序,并对油橄榄中AP2/ERF转录因子的蛋白理化性质、基因结构及系统进化进行分析,同时分析与水胁迫相关的AP2/ERF转录因子在2个油橄榄品种中的基因表达差异且进行RT-qPCR验证。结果表明:(1)在油橄榄中鉴定得到110个AP2/ERF基因家族成员,该110个蛋白质所含氨基酸大小为173~717 bp,均不存在信号肽,为非分泌蛋白。将油橄榄AP2/ERF与模式植物拟南芥AP2/ERF蛋白构建进化树发现,油橄榄AP2/ERF蛋白分为AP2、RAV、ERF和Solosist 4大类,其中ERF分为ERF和DREB 2个亚类,ERF包含ERF B1~ERF B66个子亚类,DREB包含DREB A1~DREB A66个子亚类,这与模式植物拟南芥AP2/ERF的分类一致,每个亚家族同时包含了油橄榄和拟南芥AP2/ERF蛋白,说明拟南芥和油橄榄的AP2/ERF家族在进化水平上有一定的相似性。(2)油橄榄AP2/ERF同一亚家族蛋白具有相同的基因结构及保守元件,结合基因表达和进化树中已知水分调控功能的基因初步推测OeAP2-75、OeAP2-97、OeAP2-101、OeAP2-23、OeAP2-13与油橄榄水分调节密切相关,OeAP2-13、OeAP2-28、OeAP2-104、OeAP2-75、OeAP2-80、OeAP2-50在2个品种中都有不同的表达量,推测可能是‘佛奥’和‘TYZ-1号’抗性不同的原因。(3)利用RT-qPCR技术检测油橄榄AP2/ERF基因在不同胁迫下的表达变化,OeAP2-101、OeAP2-28、OeAP2-42受水胁迫诱导显著上调,这与转录组分析结果一致。该研究结果为油橄榄AP2/ERF家族基因的抗逆性表达及基因功能研究奠定了基础,为油橄榄选育抗旱和耐涝砧木品种提供了方法和理论依据。; 关键词油橄榄 AP2/ERF转录因子生物信息学基因表达谱水分胁迫; Keywords Olea europaea AP2/ERF transcription factor bioinformatics gene expression profile water stress; 分类号 Q943.2 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名牛樟芝羊毛甾醇合成酶基因AcLSS的克隆和表达分析被引量：3: 5; 作者郑元罗娅娜罗玛妮娅张璋王毅; 机构云南省林业和草原科学院西南林业大学林学院; 出处《西南林业大学学报（自然科学）》 CAS 北大核心 2021年第3期94-99,共6页; 基金云南省博士后科研基金项目(188102)资助云南省重大科技专项计划食用菌项目子课题(202002AE320003-05-02)资助 +1 种基金国家林业局云南珍稀濒特植物保护与繁育重点实验室开放基金(2016-01)资助。; 文摘为探究牛樟芝羊毛甾醇合成酶的合成机制,对牛樟芝的一个羊毛甾醇合成酶基因进行克隆,将其命名为AcLSS,然后利用生物信息学软件对其理化性质进行预测,并对其表达情况进行初步分析。结果表明:AcLSS基因的开放阅读框为2205 bp,编码734个氨基酸;该基因含有8个内含子,9个外显子;AcLSS蛋白存在由14个氨基酸“KGAWPFSTKTQGYT”和6个氨基酸“VSDCTG”组成的保守特征序列,并且包含一个16个氨基酸组成的OSC保守结合域“KACNFLISKQRSDGGW”。分子系统进化分析显示,AcLSS蛋白与绣球菌(XP_027617410.1)的LSS蛋白亲缘关系最近;表达谱分析显示,碳源添加物中以甘露醇的诱导表达力最高、氮源添加物中以番茄浸粉的诱导表达力最佳。; 关键词牛樟芝羊毛甾醇合成酶基因克隆生物信息学; Keywords Antrodia cinnamomea lanosterol synthetase gene cloning bioinformatics; 分类号 S718.81 [农业科学—林学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	牛樟芝Zn(Ⅱ)2Cys6转录因子的全基因组鉴定与分析	罗玛妮娅王毅郑元张璋王娟杨宇明	《森林与环境学报》 CSCD 北大核心	2021	3	在线阅读下载PDF 职称材料
2	小叶龙竹种子人工老化劣变特性研究	罗玛妮娅张艺普甜郭跻敏王娟杨宇明郑元	《种子》北大核心	2021	3	在线阅读下载PDF 职称材料
3	竹叶花椒MYB基因家族的鉴定及其表达特性的分析	冯发玉王毅王丽娟罗玛妮娅徐令文杨彦萍陆斌	《经济林研究》北大核心	2021	10	在线阅读下载PDF 职称材料
4	油橄榄AP2/ERF转录因子鉴定及水胁迫表达分析	王丽娟王毅陆斌罗玛妮娅徐令文原晓龙李贤忠	《广西植物》 CAS CSCD 北大核心	2022	4	在线阅读下载PDF 职称材料
5	牛樟芝羊毛甾醇合成酶基因AcLSS的克隆和表达分析	郑元罗娅娜罗玛妮娅张璋王毅	《西南林业大学学报（自然科学）》 CAS 北大核心	2021	3	在线阅读下载PDF 职称材料