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KASP技术在动物资源鉴定及标记辅助育种中的应用
1
作者
符宏高
杨理程
+1 位作者
吴锐琼
黄镇
《福建农业科技》
CAS
2023年第9期32-41,共10页
竞争性等位基因特异性PCR(KompetitiveAllele-SpecificPCR,KASP)是一种基于荧光的同质基因分型技术,可对基因组的单核苷酸多态性位点以及插入/缺失多态性进行双等位基因分型检测,具有检测快速,成本低,准确率高等优点。阐述了KASP检测体...
竞争性等位基因特异性PCR(KompetitiveAllele-SpecificPCR,KASP)是一种基于荧光的同质基因分型技术,可对基因组的单核苷酸多态性位点以及插入/缺失多态性进行双等位基因分型检测,具有检测快速,成本低,准确率高等优点。阐述了KASP检测体系组成、扩增原理与反应步骤,以及相对于传统SNP检测方法的优势,总结其目前在动物遗传鉴定、功能基因分析、分子标记选择(MAS)辅助育种中的研究进展,以期为KASP技术在动物领域的应用提供参考依据。
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关键词
KASP
SNP
遗传鉴定
分子标记辅助育种
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职称材料
基于16sRNA扩增子测序分析患烂皮病棘胸蛙皮肤的细菌多样性
被引量：
2
2
作者
张雪萍
徐莉
+6 位作者
符宏高
陈美玲
黄其锻
陆永树
耿宝荣
陈友铃
黄镇
《福建农业科技》
CAS
2022年第11期1-9,共9页
烂皮病是棘胸蛙人工养殖过程中的常见疾病,主要表现为细菌感染而引起的蛙表皮溃烂。该病传染性强,死亡率高,严重影响棘胸蛙养殖的经济效益。解析溃烂皮肤中的细菌多样性,对于棘胸蛙烂皮病的诊断以及防治有着重要意义。因此,收集了患烂...
烂皮病是棘胸蛙人工养殖过程中的常见疾病,主要表现为细菌感染而引起的蛙表皮溃烂。该病传染性强,死亡率高,严重影响棘胸蛙养殖的经济效益。解析溃烂皮肤中的细菌多样性,对于棘胸蛙烂皮病的诊断以及防治有着重要意义。因此,收集了患烂皮病棘胸蛙的健康和溃烂部位的皮肤样本,采用细菌16sRNA片段高通量测序和生物信息学分析手段,挖掘烂皮病棘胸蛙的溃烂皮肤中的细菌结构特征。结果显示,溃烂皮肤中细菌的丰度和多样性均显著低于健康皮肤。在门分类水平上,溃烂皮肤的优势菌门是变形菌门Proteobacteria,而健康皮肤的优势菌门是蓝细菌门/叶绿体Cyanobacteria Chloroplast、变形菌门Proteobacteria、厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes、放线菌门Actinobacteria。在属分类水平上,溃烂皮肤的优势菌属为不动杆菌属Acinetobacter,健康皮肤中的优势菌属为链形植物属Streptophyta、不动杆菌属。不动杆菌属虽然为健康皮肤和患病皮肤的共有属,但是溃烂皮肤中的不动杆菌属的含量显著高于健康皮肤。研究结果解析了患烂皮病棘胸蛙的皮肤中可能的致病细菌,对于棘胸蛙养殖过程中的病害防治有重要的指导意义。
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关键词
棘胸蛙
烂皮病
皮肤
高通量测序
菌群结构
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职称材料
题名
KASP技术在动物资源鉴定及标记辅助育种中的应用
1
作者
符宏高
杨理程
吴锐琼
黄镇
机构
福建师范大学生命科学学院/福建省发育与神经生物学重点实验室
出处
《福建农业科技》
CAS
2023年第9期32-41,共10页
基金
福建省自然科学杰出青年基金项目(2023J06027)。
文摘
竞争性等位基因特异性PCR(KompetitiveAllele-SpecificPCR,KASP)是一种基于荧光的同质基因分型技术,可对基因组的单核苷酸多态性位点以及插入/缺失多态性进行双等位基因分型检测,具有检测快速,成本低,准确率高等优点。阐述了KASP检测体系组成、扩增原理与反应步骤,以及相对于传统SNP检测方法的优势,总结其目前在动物遗传鉴定、功能基因分析、分子标记选择(MAS)辅助育种中的研究进展,以期为KASP技术在动物领域的应用提供参考依据。
关键词
KASP
SNP
遗传鉴定
分子标记辅助育种
Keywords
KASP
SNP
Genetic identification
Molecular marker-assisted breeding
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
基于16sRNA扩增子测序分析患烂皮病棘胸蛙皮肤的细菌多样性
被引量：
2
2
作者
张雪萍
徐莉
符宏高
陈美玲
黄其锻
陆永树
耿宝荣
陈友铃
黄镇
机构
福建师范大学生命科学学院/福建省发育与神经生物学重点实验室
福建省健丰生物科技有限公司
福建省石冻王生物技术研发中心有限公司
福建省南平市政和县天富盈农业专业合作社
出处
《福建农业科技》
CAS
2022年第11期1-9,共9页
基金
福建省科技厅高校产学合作项目(2021N5003)。
文摘
烂皮病是棘胸蛙人工养殖过程中的常见疾病,主要表现为细菌感染而引起的蛙表皮溃烂。该病传染性强,死亡率高,严重影响棘胸蛙养殖的经济效益。解析溃烂皮肤中的细菌多样性,对于棘胸蛙烂皮病的诊断以及防治有着重要意义。因此,收集了患烂皮病棘胸蛙的健康和溃烂部位的皮肤样本,采用细菌16sRNA片段高通量测序和生物信息学分析手段,挖掘烂皮病棘胸蛙的溃烂皮肤中的细菌结构特征。结果显示,溃烂皮肤中细菌的丰度和多样性均显著低于健康皮肤。在门分类水平上,溃烂皮肤的优势菌门是变形菌门Proteobacteria,而健康皮肤的优势菌门是蓝细菌门/叶绿体Cyanobacteria Chloroplast、变形菌门Proteobacteria、厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes、放线菌门Actinobacteria。在属分类水平上,溃烂皮肤的优势菌属为不动杆菌属Acinetobacter,健康皮肤中的优势菌属为链形植物属Streptophyta、不动杆菌属。不动杆菌属虽然为健康皮肤和患病皮肤的共有属,但是溃烂皮肤中的不动杆菌属的含量显著高于健康皮肤。研究结果解析了患烂皮病棘胸蛙的皮肤中可能的致病细菌,对于棘胸蛙养殖过程中的病害防治有重要的指导意义。
关键词
棘胸蛙
烂皮病
皮肤
高通量测序
菌群结构
Keywords
Quasipaa spinosa
Rotten-skin disease
Skin
High-throughput sequencing
Microbial community structure
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
KASP技术在动物资源鉴定及标记辅助育种中的应用
符宏高
杨理程
吴锐琼
黄镇
《福建农业科技》
CAS
2023
0
在线阅读
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职称材料
2
基于16sRNA扩增子测序分析患烂皮病棘胸蛙皮肤的细菌多样性
张雪萍
徐莉
符宏高
陈美玲
黄其锻
陆永树
耿宝荣
陈友铃
黄镇
《福建农业科技》
CAS
2022
2
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职称材料
已选择
0
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