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一起学校聚集甲型流感的流行特点和全基因组特征分析
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作者 丁一 王小羽 +6 位作者 窦慧馨 王艳勤 董燕 岳营 贾勇健 焦伯延 江亚娟 《口岸卫生控制》 2023年第4期40-45,共6页
目的分析2023年3月发生的甲型H_(1)N_(1)流感病毒和季节性H3N2流感病毒共同引起的一起学校聚集流感疫情的流行特点和全基因组特征。方法对聚集疫情开展流行病学调查并采集10份病例咽拭子标本,利用实时荧光定量PCR法进行流感病毒核酸检测... 目的分析2023年3月发生的甲型H_(1)N_(1)流感病毒和季节性H3N2流感病毒共同引起的一起学校聚集流感疫情的流行特点和全基因组特征。方法对聚集疫情开展流行病学调查并采集10份病例咽拭子标本,利用实时荧光定量PCR法进行流感病毒核酸检测,利用MDCK细胞培养流感病毒,利用NEXTSEQ 2000高通量测序仪进行流感病毒全基因组测序,利用生物信息学软件进行序列分析。结果9日内3个班级共报告病例32例;采集的10份标本中甲型H_(1)N_(1)流感病毒阳性2份,季节性H_(3)N_(2)流感病毒阳性3份;培养流感病毒毒株2株。两条序列与疫苗株相比,8个基因节段核苷酸相似性分别为98.44%~98.68%和97.95%~99.34%;两条序列的血凝素(HA)抗原表位未发生漂移,受体结合位点未发生变异,神经氨酸酶(NA)抑制剂耐药位点未发生变异;但发生多个糖基化和磷酸化位点的改变。结论本次学校聚集流感疫情由甲型H1N1流感病毒和季节性H3N2流感病毒共同引起,应加大学校流感防控力度,提升学生流感疫苗接种率。 展开更多
关键词 甲型 H1N1流感病毒 季节性 H_(3)N_(2)流感病毒 学校 全基因组
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一例境外输入新型冠状病毒奥密克戎BA.2.3突变株的全基因组特征分析 被引量:1
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作者 张杨 江亚娟 +2 位作者 王小羽 窦慧馨 焦伯延 《口岸卫生控制》 2023年第2期10-13,19,共5页
目的分析1例境外输入新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎BA.2.3突变株的全基因组序列分子特征。方法对1例境外输入SARS-CoV-2感染者进行核酸检测和全基因组测序,利用生物信息学软件进行分型、同源性分析、氨基酸位点变异分析、磷酸化位... 目的分析1例境外输入新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎BA.2.3突变株的全基因组序列分子特征。方法对1例境外输入SARS-CoV-2感染者进行核酸检测和全基因组测序,利用生物信息学软件进行分型、同源性分析、氨基酸位点变异分析、磷酸化位点分析和构建进化树等。结果获得1条长29609 bp的SARS-CoV-2全基因序列,在进化树上位于B.1.1.529进化分支BA.2.3进化小枝。与wuhan-hu-1相比,共发生71个核苷酸位点变异和27个核苷酸位点缺失;62个氨基酸位点发生变异或缺失,其中S蛋白和N蛋白变异或缺失位点最多,分别发生31个和7个。结论加强境外归国人员SARS-CoV-2的核酸检测和全基因组测序,有利于防控由境外输入引起的新型冠状病毒感染暴发。 展开更多
关键词 境外输入 新型冠状病毒 奥密克戎 全基因序列 新型冠状病毒感染
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