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黄芪治疗局灶节段性肾小球硬化的分子作用机制及miRNA-mRNA调控网络构建
被引量：
9
1
作者
程馨缘
杜根发
+3 位作者
韩鹏勋
王梦华
孙惠力
易铁钢
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2023年第1期107-119,共13页
目的通过网络药理学及生物信息学结合体内实验探讨黄芪治疗局灶节段性肾小球硬化的分子作用机制,并构建miRNA-mRNA调控互作网络。方法从GEO、CTD、DisGeNET和GeneCards数据库获取局灶节段性肾小球硬化疾病基因,借助TCMSP、BATMAN-TCM数...
目的通过网络药理学及生物信息学结合体内实验探讨黄芪治疗局灶节段性肾小球硬化的分子作用机制,并构建miRNA-mRNA调控互作网络。方法从GEO、CTD、DisGeNET和GeneCards数据库获取局灶节段性肾小球硬化疾病基因,借助TCMSP、BATMAN-TCM数据库及前期研究获得黄芪主要活性成分及相应靶点,筛选中药-疾病的交集基因为两者的共同靶点,并构建中药-成分-靶点-疾病调控网络及通路富集分析。STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI),鉴定核心基因及其miRNAs,并进行分子对接验证。利用阿霉素建立肾小球硬化小鼠模型,活性成分黄芪甲苷干预后,Western blot检测核心靶点Akt1、p-Mapk1表达量。结果黄芪-疾病共有靶点146个,涉及槲皮素、山奈酚、甜菜碱和黄芪甲苷等主要活性成分及免疫-炎症、自噬-凋亡等相关通路,其中TNF、TLRs、PI3K-Akt及MAPK是核心信号通路。核心靶点有TNF、AKT1、JUN、IL6、IL1β、CASP3、VEGFA和MAPK1,及核心miRNAs有has-miR-203a-3p、has-miR-155-5p、has-miR-106a-5p和has-miR-34a-5p。分子对接显示核心靶点与相应成分结合活性良好;体内实验显示,黄芪甲苷上调Akt1、抑制p-MAPK1蛋白表达,改善FSGS肾损伤。结论黄芪可能主要通过槲皮素、山奈酚、甜菜碱、黄芪甲苷等主要成分经免疫-炎症和自噬-凋亡相关通路作用于局灶节段性肾小球硬化症,其中核心靶点和miRNAs在治疗过程中可能发挥重要作用。
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关键词
黄芪
局灶节段性肾小球硬化
网络药理学
生物信息学
分子对接
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题名
黄芪治疗局灶节段性肾小球硬化的分子作用机制及miRNA-mRNA调控网络构建
被引量：
9
1
作者
程馨缘
杜根发
韩鹏勋
王梦华
孙惠力
易铁钢
机构
广州中医药大学第四临床医学院
广州中医药大学
广州医科大学附属中医医院
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2023年第1期107-119,共13页
基金
国家自然科学基金委员会青年项目(82004156):从TFAM-STING通路探讨蒿甲醚改善肾小管上皮细胞重塑的分子机制,负责人:韩鹏勋
深圳市科技计划委员会基础研究项目(JCYJ20190812183603627):基于丙酮酸脱氢酶激酶调控Warburg效应探讨青蒿素衍生物抗糖尿病肾脏肥大的分子代谢基础,负责人:孙惠力。
文摘
目的通过网络药理学及生物信息学结合体内实验探讨黄芪治疗局灶节段性肾小球硬化的分子作用机制,并构建miRNA-mRNA调控互作网络。方法从GEO、CTD、DisGeNET和GeneCards数据库获取局灶节段性肾小球硬化疾病基因,借助TCMSP、BATMAN-TCM数据库及前期研究获得黄芪主要活性成分及相应靶点,筛选中药-疾病的交集基因为两者的共同靶点,并构建中药-成分-靶点-疾病调控网络及通路富集分析。STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI),鉴定核心基因及其miRNAs,并进行分子对接验证。利用阿霉素建立肾小球硬化小鼠模型,活性成分黄芪甲苷干预后,Western blot检测核心靶点Akt1、p-Mapk1表达量。结果黄芪-疾病共有靶点146个,涉及槲皮素、山奈酚、甜菜碱和黄芪甲苷等主要活性成分及免疫-炎症、自噬-凋亡等相关通路,其中TNF、TLRs、PI3K-Akt及MAPK是核心信号通路。核心靶点有TNF、AKT1、JUN、IL6、IL1β、CASP3、VEGFA和MAPK1,及核心miRNAs有has-miR-203a-3p、has-miR-155-5p、has-miR-106a-5p和has-miR-34a-5p。分子对接显示核心靶点与相应成分结合活性良好;体内实验显示,黄芪甲苷上调Akt1、抑制p-MAPK1蛋白表达,改善FSGS肾损伤。结论黄芪可能主要通过槲皮素、山奈酚、甜菜碱、黄芪甲苷等主要成分经免疫-炎症和自噬-凋亡相关通路作用于局灶节段性肾小球硬化症,其中核心靶点和miRNAs在治疗过程中可能发挥重要作用。
关键词
黄芪
局灶节段性肾小球硬化
网络药理学
生物信息学
分子对接
Keywords
Astragalus
Focal segmental glomerulosclerosis
Network pharmacology
Bioinformatics
Molecular docking
分类号
R-058 [医药卫生]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
黄芪治疗局灶节段性肾小球硬化的分子作用机制及miRNA-mRNA调控网络构建
程馨缘
杜根发
韩鹏勋
王梦华
孙惠力
易铁钢
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2023
9
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