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题名两个大白菜FT基因的生物信息学解析
被引量：2
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作者
李利斌
刘立锋
李化银
程玉正
高建伟
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机构
山东省农业科学院蔬菜研究所
济南市种子公司
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出处
《山东农业科学》
2010年第3期1-4,7,共5页
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文摘
本文利用比较基因组学的方法从大白菜的基因组中解析出两个成花素基因BrFT1和BrFT2,并对这两个基因的结构、顺式调控元件以及遗传进化进行了分析。结果表明,BrFT1和BrFT2都含有4个外显子,编码区大小均为528 bp,二者预测编码蛋白的序列一致性为90.29%,说明这两个基因序列存在某种程度的分化。进化分析表明这两个基因应为拟南芥FT和TSF基因的直系同源基因。另外,这两个基因都含有响应激素和逆境信号的顺式调控元件,而且不尽相同,说明这两个基因的表达调控有所不同,可能在功能上存在一定分化。本研究为进一步揭示大白菜FT基因在开花和逆境响应中的功能奠定了基础。
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关键词
大白菜
FT基因
生物信息学分析
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Keywords
Chinese cabbage
FT gene
Bioinformatics analysis
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分类号
Q754
[生物学—分子生物学]
S634.1
[农业科学—蔬菜学]
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题名蒺藜状苜蓿HK1的基因组解析
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作者
李利斌
李爱芹
程玉正
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机构
山东省农业科学院蔬菜研究所
山东省农业科学院高新技术中心
济南市种子公司
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出处
《山东农业科学》
2009年第11期5-7,共3页
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基金
山东省农业科学院青年基金项目(2005YQ046)资助
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文摘
利用生物信息学的方法,从蒺藜状苜蓿的基因组中解析得到一个与拟南芥渗透胁迫感受器基因AtHK1同源的基因,命名为MtHK1,并对它的基因结构、蛋白基序、启动子区的顺式元件和基因的遗传进化进行了分析。结果显示,蒺藜状苜蓿基因MtHK1编码的蛋白具有组氨酸蛋白激酶的结构特征,而且在进化上与拟南芥的AtHK1分属同一个类群。从基因顺式反应元件分析来看,蒺藜状苜蓿基因MtHK1具有数个响应不同逆境和激素的顺式元件,预示这个基因在逆境响应和植物生长发育过程中具有一定功能。本文为下一步深入研究这个基因的生物学功能奠定了基础。
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关键词
蒺藜状苜蓿
HK1
基因和蛋白结构
顺式反应元件
遗传进化
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Keywords
Medicago truncatula
HK1
Gene and protein structure
Cis-element
Phylogeny
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分类号
Q343.12
[生物学—遗传学]
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