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安徽合肥地区2018—2019年犬细小病毒遗传进化分析
被引量：
4
1
作者
姬凯元
邱月阳
+2 位作者
程敖
蒋书东
彭梦玲
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第10期1817-1825,共9页
为掌握安徽地区犬细小病毒(CPV)的遗传变异情况,采用PCR法扩增2018—2019年安徽地区收集的10株CPV全基因组,采用生物信息学分析安徽地区CPV遗传进化特点与VP2抗原的变异情况。遗传进化分析发现,安徽地区分离的10株CPV主要以CPV-2c亚型为...
为掌握安徽地区犬细小病毒(CPV)的遗传变异情况,采用PCR法扩增2018—2019年安徽地区收集的10株CPV全基因组,采用生物信息学分析安徽地区CPV遗传进化特点与VP2抗原的变异情况。遗传进化分析发现,安徽地区分离的10株CPV主要以CPV-2c亚型为主,起源于CPV-2aB004(EF011664)和CPV-LZ1(JQ268283)株,正在形成一个独立的分支;NS1基因和VP2基因在遗传进化分支中出现不同步现象,为CPV基因重组提供了依据。VP2蛋白保守性分析发现,安徽分离的CPV毒株的VP2蛋白存在部分氨基酸位点的突变,是否对VP2蛋白的结构和功能产生影响需进一步探究。本研究通过分析安徽地区CPV的遗传进化特点与VP2蛋白氨基酸位点突变特征,为CPV的研究提供了参考。
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关键词
犬细小病毒
全基因组
遗传进化
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题名
安徽合肥地区2018—2019年犬细小病毒遗传进化分析
被引量：
4
1
作者
姬凯元
邱月阳
程敖
蒋书东
彭梦玲
机构
安徽农业大学安徽省畜禽遗传资源保护与生物育种重点实验室
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第10期1817-1825,共9页
基金
安徽农业大学校青年基金(03087060)
安徽省教育厅自然科学基金(KJ2019A0165)。
文摘
为掌握安徽地区犬细小病毒(CPV)的遗传变异情况,采用PCR法扩增2018—2019年安徽地区收集的10株CPV全基因组,采用生物信息学分析安徽地区CPV遗传进化特点与VP2抗原的变异情况。遗传进化分析发现,安徽地区分离的10株CPV主要以CPV-2c亚型为主,起源于CPV-2aB004(EF011664)和CPV-LZ1(JQ268283)株,正在形成一个独立的分支;NS1基因和VP2基因在遗传进化分支中出现不同步现象,为CPV基因重组提供了依据。VP2蛋白保守性分析发现,安徽分离的CPV毒株的VP2蛋白存在部分氨基酸位点的突变,是否对VP2蛋白的结构和功能产生影响需进一步探究。本研究通过分析安徽地区CPV的遗传进化特点与VP2蛋白氨基酸位点突变特征,为CPV的研究提供了参考。
关键词
犬细小病毒
全基因组
遗传进化
Keywords
Canine parvovirus
whole genome
genetic evolution
分类号
S851.3 [农业科学—预防兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
安徽合肥地区2018—2019年犬细小病毒遗传进化分析
姬凯元
邱月阳
程敖
蒋书东
彭梦玲
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2021
4
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