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黄精属植物DNA分子鉴定技术应用研究进展
被引量：
22
1
作者
石乃星
文国松
赵明富
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1209-1218,共10页
黄精属植物分布广泛、资源丰富、类群复杂、栽培历史悠久,具有重要的药用、经济、观赏与文化价值。在大健康的时代背景下,黄精作为中国传统中药材,其潜在市场和广泛用途不断受到人们的重视与发掘。随着分子生物学科研究的完善与深入,先...
黄精属植物分布广泛、资源丰富、类群复杂、栽培历史悠久,具有重要的药用、经济、观赏与文化价值。在大健康的时代背景下,黄精作为中国传统中药材,其潜在市场和广泛用途不断受到人们的重视与发掘。随着分子生物学科研究的完善与深入,先后出现了多种基于DNA水平的分子鉴定技术,加速黄精属相关领域的研究并取得了较为丰硕的成果。本文对近年来有关DNA分子鉴定技术(分子标记和DNA条形码)在黄精属植物的应用现状与进展进行了综述,着重综述遗传多样性、种质鉴定、系统发育、分子标记辅助育种等方面的研究进展,并对分子标记技术在黄精属应用中存在的问题及前景进行了讨论,以期在相关领域为今后黄精属的分子标记研究提供参考和对照,并对其资源保护及开发利用提供一定借鉴。
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关键词
黄精属
分子鉴定
分子标记
DNA条形码
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职称材料
滇黄精叶绿体全基因组序列及其密码子使用偏性分析
2
作者
石乃星
谢平选
+1 位作者
李立
文国松
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期336-348,共13页
为探究滇黄精(Polygonatum kingianum)叶绿体全基因组特征和密码子使用偏性,利用第二代测序技术对滇黄精嫩叶进行测序,再经组装与注释后得到其叶绿体基因组全序列,通过MISA、EMBOSS和CodonW等软件对滇黄精叶绿体全基因组的SSR位点、系...
为探究滇黄精(Polygonatum kingianum)叶绿体全基因组特征和密码子使用偏性,利用第二代测序技术对滇黄精嫩叶进行测序,再经组装与注释后得到其叶绿体基因组全序列,通过MISA、EMBOSS和CodonW等软件对滇黄精叶绿体全基因组的SSR位点、系统发育及密码子偏好性进行分析。结果表明,滇黄精完整叶绿体基因组长度为155852 bp,基因组平均GC含量为37.7%,其大、小单拷贝区(LSC)长度分别为84633和18525 bp,反向重复区长度为26347 bp,注释了132个基因,包括86个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个核糖rRNA基因。叶绿体基因组中共有69个SSR位点,绝大多数属于单碱基重复的A/T类型。系统发育分析表明滇黄精与格脉黄精(P.tessellatum)亲缘关系近,可能与分布地域有关。密码子偏好性分析表明,滇黄精叶绿体基因组密码子使用模式受到自然选择影响大于突变因素,最终确定9个最优密码子。因此,滇黄精叶绿体基因组遗传结构和系统发育位置及其密码子偏倚的分析,为叶绿体基因工程研究提供理论依据。
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关键词
滇黄精
叶绿体基因组
密码子使用偏性
最优密码子
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职称材料
题名
黄精属植物DNA分子鉴定技术应用研究进展
被引量：
22
1
作者
石乃星
文国松
赵明富
机构
云南农业大学农学与生物技术学院
云南农业大学植物保护学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1209-1218,共10页
基金
国家自然科学基金(81360611)~~。
文摘
黄精属植物分布广泛、资源丰富、类群复杂、栽培历史悠久,具有重要的药用、经济、观赏与文化价值。在大健康的时代背景下,黄精作为中国传统中药材,其潜在市场和广泛用途不断受到人们的重视与发掘。随着分子生物学科研究的完善与深入,先后出现了多种基于DNA水平的分子鉴定技术,加速黄精属相关领域的研究并取得了较为丰硕的成果。本文对近年来有关DNA分子鉴定技术(分子标记和DNA条形码)在黄精属植物的应用现状与进展进行了综述,着重综述遗传多样性、种质鉴定、系统发育、分子标记辅助育种等方面的研究进展,并对分子标记技术在黄精属应用中存在的问题及前景进行了讨论,以期在相关领域为今后黄精属的分子标记研究提供参考和对照,并对其资源保护及开发利用提供一定借鉴。
关键词
黄精属
分子鉴定
分子标记
DNA条形码
Keywords
Polygonatum Mill.
molecular identiication
molecular markers
DNA barcode
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
滇黄精叶绿体全基因组序列及其密码子使用偏性分析
2
作者
石乃星
谢平选
李立
文国松
机构
云南农业大学农学与生物技术学院
广东药科大学中药学院
西北大学生命科学学院
出处
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期336-348,共13页
基金
supported by the National Natural Sciences Foundation of China (Grant No. 81360611)
文摘
为探究滇黄精(Polygonatum kingianum)叶绿体全基因组特征和密码子使用偏性,利用第二代测序技术对滇黄精嫩叶进行测序,再经组装与注释后得到其叶绿体基因组全序列,通过MISA、EMBOSS和CodonW等软件对滇黄精叶绿体全基因组的SSR位点、系统发育及密码子偏好性进行分析。结果表明,滇黄精完整叶绿体基因组长度为155852 bp,基因组平均GC含量为37.7%,其大、小单拷贝区(LSC)长度分别为84633和18525 bp,反向重复区长度为26347 bp,注释了132个基因,包括86个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个核糖rRNA基因。叶绿体基因组中共有69个SSR位点,绝大多数属于单碱基重复的A/T类型。系统发育分析表明滇黄精与格脉黄精(P.tessellatum)亲缘关系近,可能与分布地域有关。密码子偏好性分析表明,滇黄精叶绿体基因组密码子使用模式受到自然选择影响大于突变因素,最终确定9个最优密码子。因此,滇黄精叶绿体基因组遗传结构和系统发育位置及其密码子偏倚的分析,为叶绿体基因工程研究提供理论依据。
关键词
滇黄精
叶绿体基因组
密码子使用偏性
最优密码子
Keywords
Polygonatum kingianum
Chloroplast genome
Codon usage bias
Optimal codon
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄精属植物DNA分子鉴定技术应用研究进展
石乃星
文国松
赵明富
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
22
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
滇黄精叶绿体全基因组序列及其密码子使用偏性分析
石乃星
谢平选
李立
文国松
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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职称材料
已选择
0
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