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灰毡毛忍冬bHLH转录基因家族的鉴定与表达分析
1
作者
瞿美玲
周思敏
+6 位作者
张惊宇
何佳蔚
朱佳源
刘笑蓉
童巧珍
周日宝
刘湘丹
《生物技术通报》
北大核心
2025年第6期256-268,共13页
【目的】研究灰毡毛忍冬bHLH转录因子家族成员的结构和功能,分析其表达特征,为后续深入研究灰毡毛忍冬bHLH基因家族在花发育过程中的功能奠定基础。【方法】基于灰毡毛忍冬两品种花转录组数据,筛选bHLH基因家族成员,利用在线工具进行生...
【目的】研究灰毡毛忍冬bHLH转录因子家族成员的结构和功能,分析其表达特征,为后续深入研究灰毡毛忍冬bHLH基因家族在花发育过程中的功能奠定基础。【方法】基于灰毡毛忍冬两品种花转录组数据,筛选bHLH基因家族成员,利用在线工具进行生物信息学分析,获得灰毡毛忍冬两品种显著表达差异的基因,通过RT-qPCR验证bHLH的表达情况。【结果】共鉴定到55个bHLH转录因子家族成员,进化树分析显示灰毡毛忍冬bHLH蛋白与拟南芥有较高保守性,并基于进化树对部分bHLH蛋白的功能进行了预测。表达分析显示灰毡毛忍冬两品种bHLH基因存在显著差异,LmbHLH4/21/35在‘常规’中高表达,LmbHLH25在‘湘蕾’花期5-7中高表达。RT-qPCR结果显示,其相对表达量与转录组测序数据基本一致,证实了转录组测序结果的可靠性。【结论】推测LmbHLH4/21/15/25/35可能为参与调控灰毡毛忍冬花生长发育的关键转录因子,其为解析灰毡毛忍冬两品种花差异表型的分子机制提供了参考。
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关键词
灰毡毛忍冬
bHLH基因家族
生物信息学
表达分析
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职称材料
题名
灰毡毛忍冬bHLH转录基因家族的鉴定与表达分析
1
作者
瞿美玲
周思敏
张惊宇
何佳蔚
朱佳源
刘笑蓉
童巧珍
周日宝
刘湘丹
机构
湖南中医药大学药学院
湘产大宗道地药材种质资源及规范化种植重点研究室
湖南省普通高等学校中药现代化研究重点实验室
湖南省中药饮片标准化及功能工程技术研究中心
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第6期256-268,共13页
基金
国家自然科学基金项目(82373992)
国家现代农业产业技术体系(CARS-21)
+4 种基金
湖南省中药材产业技术体系专项(HARS-11)
湖南省自然科学基金(2023JJ60477)
2020年湖南省一流专业建设点:中药资源与开发,湖南中医药大学重点学科中药学科(校行发规字[2023]2号)
2024年湖南省研究生科研创新项目(CX20240739)
湖南中医药大学校级科研课题(2022YYZK003)。
文摘
【目的】研究灰毡毛忍冬bHLH转录因子家族成员的结构和功能,分析其表达特征,为后续深入研究灰毡毛忍冬bHLH基因家族在花发育过程中的功能奠定基础。【方法】基于灰毡毛忍冬两品种花转录组数据,筛选bHLH基因家族成员,利用在线工具进行生物信息学分析,获得灰毡毛忍冬两品种显著表达差异的基因,通过RT-qPCR验证bHLH的表达情况。【结果】共鉴定到55个bHLH转录因子家族成员,进化树分析显示灰毡毛忍冬bHLH蛋白与拟南芥有较高保守性,并基于进化树对部分bHLH蛋白的功能进行了预测。表达分析显示灰毡毛忍冬两品种bHLH基因存在显著差异,LmbHLH4/21/35在‘常规’中高表达,LmbHLH25在‘湘蕾’花期5-7中高表达。RT-qPCR结果显示,其相对表达量与转录组测序数据基本一致,证实了转录组测序结果的可靠性。【结论】推测LmbHLH4/21/15/25/35可能为参与调控灰毡毛忍冬花生长发育的关键转录因子,其为解析灰毡毛忍冬两品种花差异表型的分子机制提供了参考。
关键词
灰毡毛忍冬
bHLH基因家族
生物信息学
表达分析
Keywords
Lonicera macranthoides
bHLH gene family
bioinformatics
expression analysis
分类号
S565.9 [农业科学—作物学]
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作者
出处
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1
灰毡毛忍冬bHLH转录基因家族的鉴定与表达分析
瞿美玲
周思敏
张惊宇
何佳蔚
朱佳源
刘笑蓉
童巧珍
周日宝
刘湘丹
《生物技术通报》
北大核心
2025
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