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玉米籽粒发育相关基因ZmMADS-RIN的克隆及表达分析
被引量：
1
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作者
夏雪
马晨雨
+5 位作者
白青河
冯园园
王顺友
王喜
周青利
席章营
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第11期1656-1665,共10页
玉米籽粒发育及产量是玉米重要的经济性状。本研究以玉米骨干自交系郑58为试材,采用同源克隆法得到一个与玉米籽粒发育相关的基因ZmMADS-RIN。该基因的c DNA全长859 bp,开放阅读框为768 bp,编码255个氨基酸,与玉米B73中所对应的cDNA的...
玉米籽粒发育及产量是玉米重要的经济性状。本研究以玉米骨干自交系郑58为试材,采用同源克隆法得到一个与玉米籽粒发育相关的基因ZmMADS-RIN。该基因的c DNA全长859 bp,开放阅读框为768 bp,编码255个氨基酸,与玉米B73中所对应的cDNA的编码区序列相比,共有6个SNP位点的差异,3个氨基酸残基发生了变化。生物信息学分析表明,ZmMADS-RIN蛋白的相对分子量为29.23 k D,理论等电点为8.84,是一种亲水性蛋白,不含信号肽序列,也不含跨膜结构;具有5个磷酸化位点;二级结构中含有50.20%的α-螺旋（alpha helix）、27.45%的无规则卷曲（random coil）、14.51%的延伸链（extended strand）和7.84%的β-转角（beta turn）。该蛋白位于细胞核内;其氨基酸序列中含有高度保守的MADS结构域、相对保守的K结构域、低保守的I结构域和最不稳定的C结构域,是典型的MIKC型MADS-box蛋白;系统进化树分析表明,ZmMADS-RIN蛋白属于AGL6分支,与水稻基因Os MADS6的相似性最高,为89%。ZmMADS-RIN基因在玉米自交系郑58的籽粒中特异表达,在根及不同时期的叶片中没有检测到表达信号。荧光定量PCR结果显示,ZmMADS-RIN基因的表达量在玉米籽粒发育的不同阶段呈一定规律的变化,在授粉后0~20d,呈上调表达趋势,授粉后25 d表达量迅速下降至较低水平,而在授粉后30~40 d则检测不到其表达。推测该基因可能与玉米籽粒的发育有关。
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关键词
玉米
籽粒发育
ZmMADS-RIN
基因克隆
RT-PCR
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职称材料
题名
玉米籽粒发育相关基因ZmMADS-RIN的克隆及表达分析
被引量：
1
1
作者
夏雪
马晨雨
白青河
冯园园
王顺友
王喜
周青利
席章营
机构
河南农业大学农学院/小麦玉米作物学国家重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第11期1656-1665,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31371629)资助~~
文摘
玉米籽粒发育及产量是玉米重要的经济性状。本研究以玉米骨干自交系郑58为试材,采用同源克隆法得到一个与玉米籽粒发育相关的基因ZmMADS-RIN。该基因的c DNA全长859 bp,开放阅读框为768 bp,编码255个氨基酸,与玉米B73中所对应的cDNA的编码区序列相比,共有6个SNP位点的差异,3个氨基酸残基发生了变化。生物信息学分析表明,ZmMADS-RIN蛋白的相对分子量为29.23 k D,理论等电点为8.84,是一种亲水性蛋白,不含信号肽序列,也不含跨膜结构;具有5个磷酸化位点;二级结构中含有50.20%的α-螺旋（alpha helix）、27.45%的无规则卷曲（random coil）、14.51%的延伸链（extended strand）和7.84%的β-转角（beta turn）。该蛋白位于细胞核内;其氨基酸序列中含有高度保守的MADS结构域、相对保守的K结构域、低保守的I结构域和最不稳定的C结构域,是典型的MIKC型MADS-box蛋白;系统进化树分析表明,ZmMADS-RIN蛋白属于AGL6分支,与水稻基因Os MADS6的相似性最高,为89%。ZmMADS-RIN基因在玉米自交系郑58的籽粒中特异表达,在根及不同时期的叶片中没有检测到表达信号。荧光定量PCR结果显示,ZmMADS-RIN基因的表达量在玉米籽粒发育的不同阶段呈一定规律的变化,在授粉后0~20d,呈上调表达趋势,授粉后25 d表达量迅速下降至较低水平,而在授粉后30~40 d则检测不到其表达。推测该基因可能与玉米籽粒的发育有关。
关键词
玉米
籽粒发育
ZmMADS-RIN
基因克隆
RT-PCR
Keywords
Maize
Kernel development
ZmMADS-RIN
Gene cloning
RT-PCR
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米籽粒发育相关基因ZmMADS-RIN的克隆及表达分析
夏雪
马晨雨
白青河
冯园园
王顺友
王喜
周青利
席章营
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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