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牛TARDBP基因核心启动子鉴定与转录调控分析
1
作者
张清兰
张亚冉
+7 位作者
鞠志花
王秀革
肖遥
王金鹏
魏晓超
高亚平
白福恒
王洪程
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期306-318,共13页
【目的】为了解牛TARDBP基因结构、功能及启动子活性区域,分析该基因的转录调控机制。【方法】通过PCR技术克隆牛TARDBP基因编码区全长序列。应用生物信息学软件对牛TARDBP蛋白性质和结构进行分析。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检...
【目的】为了解牛TARDBP基因结构、功能及启动子活性区域,分析该基因的转录调控机制。【方法】通过PCR技术克隆牛TARDBP基因编码区全长序列。应用生物信息学软件对牛TARDBP蛋白性质和结构进行分析。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测TARDBP基因在泌乳期荷斯坦奶牛不同组织中的表达情况。应用5'RACE技术确定牛TARDBP基因的转录起始位点,PCR技术克隆牛TARDBP基因启动子区和5'端系列缺失片段,并运用生物信息学软件对牛TARDBP基因启动子区域CpG岛和潜在转录因子结合位点进行预测,双荧光素酶报告系统确定该基因的核心启动子区域。【结果】牛TARDBP基因在包括乳腺在内的多个组织中均有表达。TARDBP蛋白是一种水溶性非分泌蛋白,存在RNA识别结构域和DNA结合位点。TARDBP基因启动子区存在2个CpG岛和大量转录因子结合位点包括SP1、PPARA、PPARD、PPARG、SREBF1等。双荧光素酶活性分析结果显示牛TARDBP的核心启动子区位于-476--149之间,该区域包含Sp1、PPARG、PPARD、SREBF1结合元件,但不存在TATA-box。【结论】牛TARDBP基因在奶牛多个组织中均有表达。-476--149片段为牛TARDBP基因的核心启动子区,且该区域中存在与乳脂合成和分泌相关的转录因子结合位点。
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关键词
荷斯坦奶牛
TARDBP基因
生物信息学
启动子
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职称材料
蛋氨酸调控畜禽氧化应激的研究进展
被引量：
5
2
作者
刘融
崔凯
+1 位作者
白福恒
刁其玉
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期207-214,共8页
蛋氨酸是畜禽必需的氨基酸,在机体中具有广泛而重要的生物学功能。近年来研究表明,限制饮食中的蛋氨酸(MetR)可产生许多生理效应,如延长寿命、预防代谢性疾病和参与调节炎症性疾病。作为评价机体健康水平的重要指标,氧化应激得到越来越...
蛋氨酸是畜禽必需的氨基酸,在机体中具有广泛而重要的生物学功能。近年来研究表明,限制饮食中的蛋氨酸(MetR)可产生许多生理效应,如延长寿命、预防代谢性疾病和参与调节炎症性疾病。作为评价机体健康水平的重要指标,氧化应激得到越来越多的关注。大量研究证实了MetR对机体氧化应激的正面效应,MetR可通过减少线粒体活性氧产生、调控关键信号通路以及改变miRNAs表达等方式参与氧化应激的调控,从而对畜禽健康产生广泛的影响。围绕MetR对畜禽氧化应激的影响,重点阐述了MetR与氧化应激相关的分子机制。
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关键词
蛋氨酸限制
氧化应激
线粒体活性氧
NRF2
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职称材料
题名
牛TARDBP基因核心启动子鉴定与转录调控分析
1
作者
张清兰
张亚冉
鞠志花
王秀革
肖遥
王金鹏
魏晓超
高亚平
白福恒
王洪程
机构
贵州师范大学生命科学学院
山东省农业科学院畜牧兽医研究所山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室
农业农村部畜禽生物组学重点实验室
山东鲁润畜产品有限公司
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期306-318,共13页
基金
国家自然科学基金项目(32202648)
山东省重点研发计划(竞争性创新平台)项目(2022CXPT_(0)10)
山东省农业科学院农业科技创新工程(CXGC2023F10,CXGC2023A23)。
文摘
【目的】为了解牛TARDBP基因结构、功能及启动子活性区域,分析该基因的转录调控机制。【方法】通过PCR技术克隆牛TARDBP基因编码区全长序列。应用生物信息学软件对牛TARDBP蛋白性质和结构进行分析。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测TARDBP基因在泌乳期荷斯坦奶牛不同组织中的表达情况。应用5'RACE技术确定牛TARDBP基因的转录起始位点,PCR技术克隆牛TARDBP基因启动子区和5'端系列缺失片段,并运用生物信息学软件对牛TARDBP基因启动子区域CpG岛和潜在转录因子结合位点进行预测,双荧光素酶报告系统确定该基因的核心启动子区域。【结果】牛TARDBP基因在包括乳腺在内的多个组织中均有表达。TARDBP蛋白是一种水溶性非分泌蛋白,存在RNA识别结构域和DNA结合位点。TARDBP基因启动子区存在2个CpG岛和大量转录因子结合位点包括SP1、PPARA、PPARD、PPARG、SREBF1等。双荧光素酶活性分析结果显示牛TARDBP的核心启动子区位于-476--149之间,该区域包含Sp1、PPARG、PPARD、SREBF1结合元件,但不存在TATA-box。【结论】牛TARDBP基因在奶牛多个组织中均有表达。-476--149片段为牛TARDBP基因的核心启动子区,且该区域中存在与乳脂合成和分泌相关的转录因子结合位点。
关键词
荷斯坦奶牛
TARDBP基因
生物信息学
启动子
Keywords
Holstein dairy cows
TARDBP gene
bioinformatics
promoter
分类号
S823.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
蛋氨酸调控畜禽氧化应激的研究进展
被引量：
5
2
作者
刘融
崔凯
白福恒
刁其玉
机构
兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院
中国农业科学院饲料研究所农业农村部饲料生物技术重点实验室
德州市陵城区白富恒养殖场
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期207-214,共8页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(31802088)
国家肉羊产业技术体系建设专项资金(CARS-38)。
文摘
蛋氨酸是畜禽必需的氨基酸,在机体中具有广泛而重要的生物学功能。近年来研究表明,限制饮食中的蛋氨酸(MetR)可产生许多生理效应,如延长寿命、预防代谢性疾病和参与调节炎症性疾病。作为评价机体健康水平的重要指标,氧化应激得到越来越多的关注。大量研究证实了MetR对机体氧化应激的正面效应,MetR可通过减少线粒体活性氧产生、调控关键信号通路以及改变miRNAs表达等方式参与氧化应激的调控,从而对畜禽健康产生广泛的影响。围绕MetR对畜禽氧化应激的影响,重点阐述了MetR与氧化应激相关的分子机制。
关键词
蛋氨酸限制
氧化应激
线粒体活性氧
NRF2
Keywords
methionine restriction
oxidative stress
mitochondrial reactive oxygen species
Nrf2
分类号
S852.2 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牛TARDBP基因核心启动子鉴定与转录调控分析
张清兰
张亚冉
鞠志花
王秀革
肖遥
王金鹏
魏晓超
高亚平
白福恒
王洪程
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
2
蛋氨酸调控畜禽氧化应激的研究进展
刘融
崔凯
白福恒
刁其玉
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
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职称材料
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