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题名马尾松蔗糖磷酸合酶基因的克隆和表达分析
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作者
吴荣菊
文晓鹏
李正春
梅利那
申洛男
吴泽英
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机构
贵州大学生命科学学院
贵州大学农业生物工程研究院
贵州大学林学院
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出处
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2022年第2期199-207,共9页
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基金
国家重点研发计划项目“马尾松大径材定向培育技术研究”(2017YFD0600302)。
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文摘
通过挖掘4个马尾松蔗糖磷酸合酶基因(PmSPS1~PmSPS4),探究SPS基因在马尾松中的表达特性及功能。利用马尾松转录组数据挖掘SPS基因,对基因进行克隆及生物信息学分析,用实时荧光定量PCR检测其在马尾松不同组织、高低产脂种质和低磷胁迫中的相对表达量。结果从马尾松针叶中克隆获得4个SPS基因,开放阅读框(open reading frame, ORF)长度为1 701~3 243 bp,编码566~1 080个氨基酸。进化分析表明,PmSPS1和PmSPS3同属A亚族,PmSPS2和PmSPS4同属B亚族。组织特异性分析发现,PmSPS2和PmSPS4在针叶中表达量最高,PmSPS1和PmSPS3在树皮中表达量最高;PmSPS1和PmSPS3在幼嫩组织和成熟组织表达差异不显著,PmSPS2和PmSPS4在成熟针叶中的表达量显著高于嫩叶(P<0.05),在嫩茎和成熟茎间差异不显著。PmSPS1和PmSPS3的表达量在高、低产脂种质中差异不显著,PmSPS2和PmSPS4在高产脂种质针叶中的表达水平高于低产脂,在高产脂木质部中低于低产脂。低磷胁迫处理后,4个PmSPS基因在针叶中的表达水平均为上调,其中PmSPS2基因表达量最高,达到对照组的3.18倍。综合以上分析结果,克隆得到的4个马尾松SPS基因分布于A、 B亚族中,不同亚族基因呈现出不同的表达特性,为后续深入研究SPS家族基因在马尾松中的功能提供了理论依据。
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关键词
马尾松
蔗糖合成
蔗糖磷酸合酶
组织
低磷胁迫
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Keywords
Pinus massoniana Lamb.
sucrose synthesis
sucrose phosphate synthase(SPS)
tissue
low phosphorus stress
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分类号
Q786
[生物学—分子生物学]
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题名甜樱桃扩展蛋白PavEXPA2基因克隆与表达分析
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作者
张焱
仇志浪
申洛男
文晓鹏
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机构
贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室
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出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期27-33,共7页
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基金
国家自然科学基金项目(32272649)
贵州省教育厅重点项目(黔科合KY字[2021]038)。
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文摘
为揭示甜樱桃中扩展蛋白基因的结构与功能,克隆了甜樱桃PavEXPA2基因,并分析了该基因在不同组织(茎、花芽、盛开花朵、幼叶、老叶、幼叶叶柄、老叶叶柄、2个脱落高峰期正常果柄与即将脱落果柄、2个脱落高峰期正常果实与脱落果实)及逆境胁迫(使用20%PEG6000和20 mmol/L NaCl溶液分别模拟干旱和盐胁迫,分别处理0、2、4、6、8 h)下的表达情况。结果显示:PavEXPA2基因cDNA全长序列为1 035 bp,开放阅读框(ORF)为852 bp,编码283 aa,蛋白等电点为8.90,分子质量约为30.81 ku,含有2个跨膜螺旋结构和1个信号肽,亚细胞定位预测PavEXPA2定位于细胞壁;组织表达分析显示,PavEXPA2基因在甜樱桃易脱落组织中表达量较高,如盛开花瓣,即将脱落的果柄、果实、叶柄等,其中在即将脱落叶柄中表达量最高;相对于未处理样品,干旱处理样本PavEXPA2表达量上升,在处理6 h时表达量达到最高,随后降低;盐胁迫条件下,PavEXPA2表达量呈先下降后上升再下降的趋势,其中在处理6 h时表达量达到最高。结果表明,甜樱桃可能通过PavEXPA2基因上调促进脱落而抵御逆境胁迫。
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关键词
甜樱桃
PavEXPA2
基因克隆
生物信息学
逆境胁迫
器官脱落
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Keywords
sweet cherry
pavEXPA2
gene cloning
bioinformatics
abiotic stress
organ abscission
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分类号
S662.5
[农业科学—果树学]
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题名火龙果HpGST基因克隆及表达分析
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作者
屠凯
文晓鹏
张惠敏
申洛男
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机构
贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室
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出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期34-41,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(32060663)
贵州省教育厅普通高等学校科技拔尖人才项目(黔教合KY字[2021]028)。
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文摘
为探究火龙果(Hylocereus)谷胱甘肽S-转移酶基因(HpGST)的功能,克隆了HpGST基因的cDNA序列,并进行生物信息学及表达分析。结果显示:HpGST序列全长为666 bp,编码221个氨基酸,编码蛋白属于非分泌型不稳定亲水性蛋白,亚细胞定位预测其于细胞质中发挥作用;系统进化树显示其与藜麦亲缘关系较近,属谷胱甘肽转移酶Tau家族;实时荧光定量PCR分析结果显示,HpGST在火龙果不同色泽类型品种果肉中均有表达,在有色素累积的紫肉和粉肉类型中表达量均显著高于无色素累积的白肉类型,表达趋势均为先上升后下降,其表达量与甜菜素含量呈现正相关,且在不同色泽类型品种中表达趋势与甜菜素累积趋势高度一致,推测HpGST基因在火龙果甜菜素合成与分布中发挥重要作用。
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关键词
火龙果
谷胱甘肽S-转移酶基因(HpGST)
甜菜素
生物信息学
基因克隆
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Keywords
Hylocereus
HpGST
betaine
bioinformatics
gene cloning
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分类号
S667.903
[农业科学—果树学]
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