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龙眼DlSWI3、DlARP、DlSWC和DlBSH亚基的分子特性及其在体胚发生早期的基因表达模式
被引量：
1
1
作者
申序
牟东岭
+6 位作者
黄健华
郭萍
孙川川
王慧
唐鹏
葛琴
赖钟雄
《园艺与种苗》
CAS
2023年第2期53-59,共7页
[目的]探究龙眼Switching 3(SWI3)、Actin-related protein(ARP)、SWR1 complex(SWC)和Bushy(BSH)亚基的潜在功能。[方法]利用生物信息学分析其分子进化特性,用转录组和实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,q RT-PCR)分析基因...
[目的]探究龙眼Switching 3(SWI3)、Actin-related protein(ARP)、SWR1 complex(SWC)和Bushy(BSH)亚基的潜在功能。[方法]利用生物信息学分析其分子进化特性,用转录组和实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,q RT-PCR)分析基因在体胚发生早期胚性愈伤组织(embryogenic callus,EC)、不完全胚性紧实结构(incomplete embryogenic compact structures,ICpEC)和球形胚(globular embryos,GE)阶段及在EC中响应激素的表达模式。[结果]龙眼含4个DlS WI3、10个DlA RP、4个DlS WC和1个DlB SH蛋白,它们大多不稳定且主要定位在细胞核、细胞质和叶绿体上。DlS WI3和DlA RP家族扩张受基因复制驱动,而4个DlSWC和1个DlBSH基因由单拷贝产生。DlS WI3、DlA RP、DlS WC和DlB SH结构域各异,进化上与拟南芥、水稻和甜橙一致。启动子预测表明,DlSWI3、DlARP、DlSWC和DlBSH亚基的基因含多种激素、胁迫、光和生长发育相关元件。q RT-PCR分析显示,从EC分化到GE,DlARP4、DlARP5-3、DlARP9和DlBSH逐渐下调,而DlSWI3C、DlARP8和DlSWC2逐渐上调,且DlSWI3D在GE特异高表达;DlARP5-3、DlSWC2、DlSWI3D和DlBSH在脱落酸(abscisic acid,ABA)处理12 h时被显著上调,DlARP4、DlARP5-3、DlSWC2、DlSWI3D和DlBSH在茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJ A)处理4 h时被显著上调,5个基因被赤霉素(gibberellin A3,GA3)或水杨酸(salicylic acid,SA)下调,DlARP4被ABA下调。[结论]DlS WI3、DlA RP、DlS WC、DlB SH亚基在进化上高度保守,它们可能通过响应激素诱导影响染色质重塑活性,调控龙眼早期体胚发育。
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关键词
龙眼
体胚发生
激素
染色质重塑
生物信息学
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职称材料
题名
龙眼DlSWI3、DlARP、DlSWC和DlBSH亚基的分子特性及其在体胚发生早期的基因表达模式
被引量：
1
1
作者
申序
牟东岭
黄健华
郭萍
孙川川
王慧
唐鹏
葛琴
赖钟雄
机构
毕节市经济作物工作站
福建农林大学园艺植物研究所
出处
《园艺与种苗》
CAS
2023年第2期53-59,共7页
基金
国家自然科学基金(No.31572088,No.31672127)
福建省高原学科建设经费项目(No.102/71201801101)
福建农林大学科技创新基金项目(No.CXZX2020027A)。
文摘
[目的]探究龙眼Switching 3(SWI3)、Actin-related protein(ARP)、SWR1 complex(SWC)和Bushy(BSH)亚基的潜在功能。[方法]利用生物信息学分析其分子进化特性,用转录组和实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,q RT-PCR)分析基因在体胚发生早期胚性愈伤组织(embryogenic callus,EC)、不完全胚性紧实结构(incomplete embryogenic compact structures,ICpEC)和球形胚(globular embryos,GE)阶段及在EC中响应激素的表达模式。[结果]龙眼含4个DlS WI3、10个DlA RP、4个DlS WC和1个DlB SH蛋白,它们大多不稳定且主要定位在细胞核、细胞质和叶绿体上。DlS WI3和DlA RP家族扩张受基因复制驱动,而4个DlSWC和1个DlBSH基因由单拷贝产生。DlS WI3、DlA RP、DlS WC和DlB SH结构域各异,进化上与拟南芥、水稻和甜橙一致。启动子预测表明,DlSWI3、DlARP、DlSWC和DlBSH亚基的基因含多种激素、胁迫、光和生长发育相关元件。q RT-PCR分析显示,从EC分化到GE,DlARP4、DlARP5-3、DlARP9和DlBSH逐渐下调,而DlSWI3C、DlARP8和DlSWC2逐渐上调,且DlSWI3D在GE特异高表达;DlARP5-3、DlSWC2、DlSWI3D和DlBSH在脱落酸(abscisic acid,ABA)处理12 h时被显著上调,DlARP4、DlARP5-3、DlSWC2、DlSWI3D和DlBSH在茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJ A)处理4 h时被显著上调,5个基因被赤霉素(gibberellin A3,GA3)或水杨酸(salicylic acid,SA)下调,DlARP4被ABA下调。[结论]DlS WI3、DlA RP、DlS WC、DlB SH亚基在进化上高度保守,它们可能通过响应激素诱导影响染色质重塑活性,调控龙眼早期体胚发育。
关键词
龙眼
体胚发生
激素
染色质重塑
生物信息学
Keywords
Dimocarpus longan Lour.
Somatic embryogenesis
Hormone
Chromatin remodeling
Bioinformatics
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
S667.2 [农业科学—果树学]
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出处
发文年
被引量
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1
龙眼DlSWI3、DlARP、DlSWC和DlBSH亚基的分子特性及其在体胚发生早期的基因表达模式
申序
牟东岭
黄健华
郭萍
孙川川
王慧
唐鹏
葛琴
赖钟雄
《园艺与种苗》
CAS
2023
1
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