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基于重测序的BBLa过表达烟草雄性不育变异检测分析
1
作者
王麟麒
罗徐
+3 位作者
万克
石远帅
崔杨子力
刘洋
《种子》
北大核心
2024年第2期37-43,共7页
BBLa基因编码小檗碱桥状酶(Berberine bridge enzyme-like, BBLa),烟草小檗碱桥状酶参与烟碱生物合成的最终催化步骤。课题组前期研究发现,BBLa过表达烟草T0代植株中出现雄蕊败育表型。为进一步了解该雄性不育表型的遗传机制,本研究以...
BBLa基因编码小檗碱桥状酶(Berberine bridge enzyme-like, BBLa),烟草小檗碱桥状酶参与烟碱生物合成的最终催化步骤。课题组前期研究发现,BBLa过表达烟草T0代植株中出现雄蕊败育表型。为进一步了解该雄性不育表型的遗传机制,本研究以过表达BBLa烟草雄性不育表型OE1和野生型烟草WT为材料,基于全基因组重测序技术,对单核苷酸多态性(SNP)、插入-缺失(InDel)及染色体结构变异(SV)3种变异类型进行标记注释,平均测序深度≥14×,平均覆盖率≥95%。结果表明,在2个样本中共检测到7 505 620个SNP、628 034个InDel、79 576个SV。通过2个样本的SNP差异比对筛选,最终得到174个候选基因。
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关键词
烟草
重测序
BBLa基因
雄性不育
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职称材料
烟草NtCYP734A1基因的克隆及表达分析
2
作者
万克
段丽丽
+3 位作者
王麟麒
石远帅
罗徐
刘洋
《种子》
北大核心
2024年第3期102-109,共8页
油菜素内酯是一种参与胁迫响应的甾醇类植物激素,CYP734A1基因是油菜素内酯代谢通路上的关键基因。为探索CYP734A1基因在烟草响应非生物胁迫时发挥的功能,本研究以普通烟草品种K326为材料,克隆CYP734A1基因,通过生物信息学技术分析NtCYP...
油菜素内酯是一种参与胁迫响应的甾醇类植物激素,CYP734A1基因是油菜素内酯代谢通路上的关键基因。为探索CYP734A1基因在烟草响应非生物胁迫时发挥的功能,本研究以普通烟草品种K326为材料,克隆CYP734A1基因,通过生物信息学技术分析NtCYP734A1蛋白的理化性质及进化关系,运用实时荧光定量法分析CYP734A1基因在不同组织、不同非生物胁迫处理下的基因表达模式。结果表明,CYP734A1基因全长1638 bp,编码545个氨基酸;亚细胞定位预测NtCYP734A1蛋白存在于内质网。qRT-PCR分析表明,烟草CYP734A1基因在不同组织均有表达,叶中表达量最高,茎中的表达量最低。非生物胁迫处理下,CYP734A1基因在各组织的表达量显著改变,在干旱、盐和低温胁迫下根的CYP734A1基因表达上调;在干旱、盐、高温和低温共4种胁迫下,叶中CYP734A1基因表达下调。
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关键词
烟草
CYP734A1基因
油菜素内酯
表达分析
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职称材料
烟草BBLc基因CRISPR/Cas 9载体构建与遗传转化
被引量:
1
3
作者
苏龙
仆田秀南
+3 位作者
杨竞
万克
王麟麒
刘洋
《种子》
北大核心
2022年第7期21-26,共6页
小檗碱桥状酶在烟碱生物合成的最后一步起到关键催化作用。本研究对小檗碱桥状酶基因家族中的BBLc基因进行研究,利用CRISPR/Cas 9技术构建BBLc基因的编辑载体,通过农杆菌介导法遗传转化烟草,经卡那霉素抗性筛选获得35株抗性苗,利用PCR和...
小檗碱桥状酶在烟碱生物合成的最后一步起到关键催化作用。本研究对小檗碱桥状酶基因家族中的BBLc基因进行研究,利用CRISPR/Cas 9技术构建BBLc基因的编辑载体,通过农杆菌介导法遗传转化烟草,经卡那霉素抗性筛选获得35株抗性苗,利用PCR和RT-qPCR技术鉴定获得7株突变株。观察发现,突变株烟叶褶皱程度较野生型增大,其余农艺性状与野生型相比差别不大。利用HPLC法测定盛花期叶片烟碱含量,突变株烟碱含量较对照平均降低了24.2%;其中突变烟株CB 10的烟碱含量为0.88%,降幅最大(37.6%)。研究表明,BBLc基因在烟草中表达量的降低引起烟碱含量的降低。
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关键词
栽培烟草
BBLc基因
遗传转化
烟碱
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职称材料
题名
基于重测序的BBLa过表达烟草雄性不育变异检测分析
1
作者
王麟麒
罗徐
万克
石远帅
崔杨子力
刘洋
机构
贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室
出处
《种子》
北大核心
2024年第2期37-43,共7页
基金
中国烟草总公司贵州省公司重点研发项目(2021XM04)。
文摘
BBLa基因编码小檗碱桥状酶(Berberine bridge enzyme-like, BBLa),烟草小檗碱桥状酶参与烟碱生物合成的最终催化步骤。课题组前期研究发现,BBLa过表达烟草T0代植株中出现雄蕊败育表型。为进一步了解该雄性不育表型的遗传机制,本研究以过表达BBLa烟草雄性不育表型OE1和野生型烟草WT为材料,基于全基因组重测序技术,对单核苷酸多态性(SNP)、插入-缺失(InDel)及染色体结构变异(SV)3种变异类型进行标记注释,平均测序深度≥14×,平均覆盖率≥95%。结果表明,在2个样本中共检测到7 505 620个SNP、628 034个InDel、79 576个SV。通过2个样本的SNP差异比对筛选,最终得到174个候选基因。
关键词
烟草
重测序
BBLa基因
雄性不育
Keywords
tobacco
re-sequencing
BBLa gene
male sterility
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
烟草NtCYP734A1基因的克隆及表达分析
2
作者
万克
段丽丽
王麟麒
石远帅
罗徐
刘洋
机构
贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室
贵州大学农学院/贵州省烟草品质研究重点实验室
出处
《种子》
北大核心
2024年第3期102-109,共8页
基金
中国烟草总公司贵州省公司重点研发项目(2021XM04)
烟草T-DNA激活插入突变体库创建及重要性状突变体筛选(贵大人基合字[2013]50号)。
文摘
油菜素内酯是一种参与胁迫响应的甾醇类植物激素,CYP734A1基因是油菜素内酯代谢通路上的关键基因。为探索CYP734A1基因在烟草响应非生物胁迫时发挥的功能,本研究以普通烟草品种K326为材料,克隆CYP734A1基因,通过生物信息学技术分析NtCYP734A1蛋白的理化性质及进化关系,运用实时荧光定量法分析CYP734A1基因在不同组织、不同非生物胁迫处理下的基因表达模式。结果表明,CYP734A1基因全长1638 bp,编码545个氨基酸;亚细胞定位预测NtCYP734A1蛋白存在于内质网。qRT-PCR分析表明,烟草CYP734A1基因在不同组织均有表达,叶中表达量最高,茎中的表达量最低。非生物胁迫处理下,CYP734A1基因在各组织的表达量显著改变,在干旱、盐和低温胁迫下根的CYP734A1基因表达上调;在干旱、盐、高温和低温共4种胁迫下,叶中CYP734A1基因表达下调。
关键词
烟草
CYP734A1基因
油菜素内酯
表达分析
Keywords
Nicotiana tabacum
CYP734A1 gene
brassinosteroid
expression analysis
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
烟草BBLc基因CRISPR/Cas 9载体构建与遗传转化
被引量:
1
3
作者
苏龙
仆田秀南
杨竞
万克
王麟麒
刘洋
机构
贵州大学烟草学院
出处
《种子》
北大核心
2022年第7期21-26,共6页
基金
中国烟草总公司贵州省公司重点研发项目(2021 XM 04)。
文摘
小檗碱桥状酶在烟碱生物合成的最后一步起到关键催化作用。本研究对小檗碱桥状酶基因家族中的BBLc基因进行研究,利用CRISPR/Cas 9技术构建BBLc基因的编辑载体,通过农杆菌介导法遗传转化烟草,经卡那霉素抗性筛选获得35株抗性苗,利用PCR和RT-qPCR技术鉴定获得7株突变株。观察发现,突变株烟叶褶皱程度较野生型增大,其余农艺性状与野生型相比差别不大。利用HPLC法测定盛花期叶片烟碱含量,突变株烟碱含量较对照平均降低了24.2%;其中突变烟株CB 10的烟碱含量为0.88%,降幅最大(37.6%)。研究表明,BBLc基因在烟草中表达量的降低引起烟碱含量的降低。
关键词
栽培烟草
BBLc基因
遗传转化
烟碱
Keywords
tobacco cultivation
BBLc gene
genetic transformation
nicotine
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于重测序的BBLa过表达烟草雄性不育变异检测分析
王麟麒
罗徐
万克
石远帅
崔杨子力
刘洋
《种子》
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
烟草NtCYP734A1基因的克隆及表达分析
万克
段丽丽
王麟麒
石远帅
罗徐
刘洋
《种子》
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
烟草BBLc基因CRISPR/Cas 9载体构建与遗传转化
苏龙
仆田秀南
杨竞
万克
王麟麒
刘洋
《种子》
北大核心
2022
1
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职称材料
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