目的:利用网络药理学和分子对接探讨白头翁汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis UC)的活性化合物,研究其治疗UC的机制。方法:从中药系统药理学数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis plat...目的:利用网络药理学和分子对接探讨白头翁汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis UC)的活性化合物,研究其治疗UC的机制。方法:从中药系统药理学数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)中检索白头翁汤的有效成分及相关靶点,从OMIM、DrugBank数据库获得UC相关靶点。利用Cytoscape构建中药复方目标网络,利用STRING数据库构建目标蛋白-蛋白质相互作用网络。基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析核心基因,获得相关的靶点通路。将白头翁汤的主要活性化合物与白细胞介素4(interleukin-4,IL-4)和环氧合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)进行分子对接。结果:目标-靶点网络包括43个主要化合物和66个靶点,包括PTGS2、IL-4、IL-17、IL-8、胱天蛋白酶3(caspase-3,CASP3)、肿瘤蛋白P53(tumor protein 53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase 9,MMP9)等,GO和KEGG富集分析结果显示主要富集在AKT、IL-4、IL-17、RGE-RAGE等信号通路。对接结果表明槲皮素和黄柏碱是主要成分,分别与PTGS2和IL-4有较高的亲和力。结论:白头翁汤治疗UC的主要机制可能是通过槲皮素和黄柏碱对PTGS2和IL-2多条信号通路进行调节,如IL-4、IL-17、AKT信号通路等。该研究对进一步挖掘白头翁汤治疗UC的临床疗效和作用机制奠定了一定的基础。展开更多
文摘目的:利用网络药理学和分子对接探讨白头翁汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis UC)的活性化合物,研究其治疗UC的机制。方法:从中药系统药理学数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)中检索白头翁汤的有效成分及相关靶点,从OMIM、DrugBank数据库获得UC相关靶点。利用Cytoscape构建中药复方目标网络,利用STRING数据库构建目标蛋白-蛋白质相互作用网络。基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析核心基因,获得相关的靶点通路。将白头翁汤的主要活性化合物与白细胞介素4(interleukin-4,IL-4)和环氧合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)进行分子对接。结果:目标-靶点网络包括43个主要化合物和66个靶点,包括PTGS2、IL-4、IL-17、IL-8、胱天蛋白酶3(caspase-3,CASP3)、肿瘤蛋白P53(tumor protein 53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase 9,MMP9)等,GO和KEGG富集分析结果显示主要富集在AKT、IL-4、IL-17、RGE-RAGE等信号通路。对接结果表明槲皮素和黄柏碱是主要成分,分别与PTGS2和IL-4有较高的亲和力。结论:白头翁汤治疗UC的主要机制可能是通过槲皮素和黄柏碱对PTGS2和IL-2多条信号通路进行调节,如IL-4、IL-17、AKT信号通路等。该研究对进一步挖掘白头翁汤治疗UC的临床疗效和作用机制奠定了一定的基础。
