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基于CRISPR/Cas系统的生物传感策略研究进展
被引量：
5
1
作者
胡孝林
王良婷
+1 位作者
顾玮
罗阳
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期69-77,共9页
CRISPR/Cas9系统是继锌指核酸内切酶、类转录激活因子效应物核酸酶之后的第三代基因组定点编辑工具,因其具有特异性切割双链DNA的能力,被广泛应用于基因编辑、生物传感等领域。Cas12a(Cpf1)、Cas13a(C2c2)等蛋白"附属切割"活...
CRISPR/Cas9系统是继锌指核酸内切酶、类转录激活因子效应物核酸酶之后的第三代基因组定点编辑工具,因其具有特异性切割双链DNA的能力,被广泛应用于基因编辑、生物传感等领域。Cas12a(Cpf1)、Cas13a(C2c2)等蛋白"附属切割"活性的发现,拓展了CRISPR/Cas系统在生物传感中的应用。近年来,研究人员开发出一系列快速、超敏、高特异性的生物传感系统用于分子检测,如SHERLOCK,DETECTR等。本文主要综述了基于CRISPR/Cas系统的生物传感策略的研究进展,并展望了其未来发展的方向。
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关键词
CRISPR/Cas系统
等温扩增
生物传感
超敏检测
单碱基特异性
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职称材料
贵州朱砂根种质的表型性状及DNA条形码多样性分析
2
作者
王良婷
丁晓霞
+2 位作者
徐金智
谭睿
唐新
《世界中医药》
2025年第12期2042-2049,共8页
目的:研究贵州省野生朱砂根种质资源遗传多样性,辅助种质资源评价与良种选育。方法:对20个居群的60份野生朱砂根样本的株高、叶长、果径、果柄、果色、叶缘、叶形7个表型性状进行Shannon-Wiener多样性指数(H)、变异系数、相关性和聚类...
目的:研究贵州省野生朱砂根种质资源遗传多样性,辅助种质资源评价与良种选育。方法:对20个居群的60份野生朱砂根样本的株高、叶长、果径、果柄、果色、叶缘、叶形7个表型性状进行Shannon-Wiener多样性指数(H)、变异系数、相关性和聚类分析。结合内转录间隔区(ITS)、内转录间隔区2(ITS2)、叶绿体psbA-trnH间隔区(psbA-trnH)、成熟酶K基因(matK)、1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/氧化酶大亚基(rbcL)引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序,构建系统发育树,开展DNA多态性分析。结果:朱砂根4个数量性状的H值为1.6372~1.9683,变异系数为5.20%~19.81%,3个质量性状的H值为0.2175~0.9290。系统聚类分析,在欧氏距离25处,朱砂根资源分为2大类群。ITS2、psbA-trnH和ITS序列变异位点数分别为4、3、8,平均遗传距离分别为0.0029、0.0027、0.0030,单倍型多样性分别为0.563、0.748、0.548,表明朱砂根在野生居群间具有较高的遗传变异和多样性。基于ITS、ITS2、psbA-trnH序列的系统发育树将种群分为3、4、4支,其中psbA-trnH序列构建的系统发育树与表型聚类结果存在部分交集。结论:psbA-trnH序列变异丰富,适合朱砂根遗传多样性评价。结合DNA条形码与形态学分析,可以为种植资源筛选与育种提供参考。
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关键词
朱砂根
表型性状
DNA条形码
变异
遗传多样性
资源评价
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职称材料
题名
基于CRISPR/Cas系统的生物传感策略研究进展
被引量：
5
1
作者
胡孝林
王良婷
顾玮
罗阳
机构
重庆大学生物工程学院
重庆大学医学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期69-77,共9页
基金
国家自然科学基金面上项目(81871733,81572079,81772061)
重庆市技术创新与应用示范(社会民生类)项目(CSCT2018JSCX-MSYBX0146)
重庆大学中央高校基本科研业务专项(2018CDGFSG0017,2019CDYGZD005,2019CDYGZD007,2019CDXYSG0004)
文摘
CRISPR/Cas9系统是继锌指核酸内切酶、类转录激活因子效应物核酸酶之后的第三代基因组定点编辑工具,因其具有特异性切割双链DNA的能力,被广泛应用于基因编辑、生物传感等领域。Cas12a(Cpf1)、Cas13a(C2c2)等蛋白"附属切割"活性的发现,拓展了CRISPR/Cas系统在生物传感中的应用。近年来,研究人员开发出一系列快速、超敏、高特异性的生物传感系统用于分子检测,如SHERLOCK,DETECTR等。本文主要综述了基于CRISPR/Cas系统的生物传感策略的研究进展,并展望了其未来发展的方向。
关键词
CRISPR/Cas系统
等温扩增
生物传感
超敏检测
单碱基特异性
Keywords
CRISPR/Cas system
isothermal amplification
biosensing
ultrasensitive detection
single base specificity
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
贵州朱砂根种质的表型性状及DNA条形码多样性分析
2
作者
王良婷
丁晓霞
徐金智
谭睿
唐新
机构
成都中医药大学药学院
出处
《世界中医药》
2025年第12期2042-2049,共8页
基金
国家重点研发计划项目子课题(2022YFD1201601)
中国博士后科学基金项目(2022MD713704,2022MD723730)
+1 种基金
重庆市自然科学基金博士后科学基金项目(cstc2021jcyj-bshX0222,cstc2021jcyj-bshX0188)
重庆市科研机构绩效激励引导专项(cstc2023jxjl-jbky130009,zzkjjh2022012,cstc2022jxjl120034,zzkjjh2023017)。
文摘
目的:研究贵州省野生朱砂根种质资源遗传多样性,辅助种质资源评价与良种选育。方法:对20个居群的60份野生朱砂根样本的株高、叶长、果径、果柄、果色、叶缘、叶形7个表型性状进行Shannon-Wiener多样性指数(H)、变异系数、相关性和聚类分析。结合内转录间隔区(ITS)、内转录间隔区2(ITS2)、叶绿体psbA-trnH间隔区(psbA-trnH)、成熟酶K基因(matK)、1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/氧化酶大亚基(rbcL)引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序,构建系统发育树,开展DNA多态性分析。结果:朱砂根4个数量性状的H值为1.6372~1.9683,变异系数为5.20%~19.81%,3个质量性状的H值为0.2175~0.9290。系统聚类分析,在欧氏距离25处,朱砂根资源分为2大类群。ITS2、psbA-trnH和ITS序列变异位点数分别为4、3、8,平均遗传距离分别为0.0029、0.0027、0.0030,单倍型多样性分别为0.563、0.748、0.548,表明朱砂根在野生居群间具有较高的遗传变异和多样性。基于ITS、ITS2、psbA-trnH序列的系统发育树将种群分为3、4、4支,其中psbA-trnH序列构建的系统发育树与表型聚类结果存在部分交集。结论:psbA-trnH序列变异丰富,适合朱砂根遗传多样性评价。结合DNA条形码与形态学分析,可以为种植资源筛选与育种提供参考。
关键词
朱砂根
表型性状
DNA条形码
变异
遗传多样性
资源评价
Keywords
Ardisia crenata
Phenotypic traits
DNA barcodes
Variation
Genetic diversity
Resources evaluation
分类号
R282.5 [医药卫生]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于CRISPR/Cas系统的生物传感策略研究进展
胡孝林
王良婷
顾玮
罗阳
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
贵州朱砂根种质的表型性状及DNA条形码多样性分析
王良婷
丁晓霞
徐金智
谭睿
唐新
《世界中医药》
2025
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