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水曲柳TCP4转录因子克隆及胁迫和激素下的表达分析
被引量：
23
1
作者
刘春浩
梁楠松
+5 位作者
于磊
赵兴堂
刘颖
孙爽
王紫晴
詹亚光
《北京林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期22-31,共10页
TCP转录因子家族是植物特异的一类调控生长发育和逆境胁迫的重要转录因子。本文揭示了水曲柳FmTCP4在非生物胁迫及激素信号诱导调控的表达特征,为该基因在水曲柳中调控生长发育以及逆境胁迫响应功能的研究奠定基础。通过前期研究克隆获...
TCP转录因子家族是植物特异的一类调控生长发育和逆境胁迫的重要转录因子。本文揭示了水曲柳FmTCP4在非生物胁迫及激素信号诱导调控的表达特征,为该基因在水曲柳中调控生长发育以及逆境胁迫响应功能的研究奠定基础。通过前期研究克隆获得了水曲柳TCP4基因序列,并命名为FmTCP4,应用生物信息学软件对水曲柳FmTCP4基因的分子结构特征进行了分析,利用4℃低温、盐(Na Cl)以及干旱(PEG6000)进行非生物胁迫处理,利用脱落酸(ABA)和赤霉素(GA3)进行激素信号诱导,分析FmTCP4基因的表达特征。生物信息学分析表明该基因全长1 251 bp,具有完整的开放阅读框,编码416个氨基酸。FmTCP4具有螺旋-环-螺旋结构,为亲水性的不稳定蛋白,不存在信号肽,具有跨膜能力,亚细胞定位预测存在于细胞核中,并在细胞质到细胞核的调控中起作用。同源序列比对结果表明,FmTCP4与芝麻、烟草等物种的同源蛋白序列相比具有很高的同源性。非生物胁迫处理后,FmTCP4的表达量随处理时间而改变,但其变化趋势不同,表明FmTCP4明显响应了这3种非生物胁迫。激素信号诱导结果表明,外源植物激素调控了FmTCP4基因的表达,基因表达量相对于对照组具有显著性差异。非生物胁迫和激素信号诱导下的基因表达分析表明,FmTCP4响应了寒冷、盐、干旱等非生物胁迫以及激素信号,说明其参与了植物的生长发育和逆境胁迫的平衡。
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关键词
水曲柳
TCP转录因子
基因克隆
生物信息分析
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题名
水曲柳TCP4转录因子克隆及胁迫和激素下的表达分析
被引量：
23
1
作者
刘春浩
梁楠松
于磊
赵兴堂
刘颖
孙爽
王紫晴
詹亚光
机构
东北林业大学生命科学学院
东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室
出处
《北京林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期22-31,共10页
基金
"十二五"国家科技支撑计划项目(2012BAD21B020106)
国家自然科学基金项目(31270697)
东北林业大学大学生创新创业训练计划项目(201610225233)
文摘
TCP转录因子家族是植物特异的一类调控生长发育和逆境胁迫的重要转录因子。本文揭示了水曲柳FmTCP4在非生物胁迫及激素信号诱导调控的表达特征,为该基因在水曲柳中调控生长发育以及逆境胁迫响应功能的研究奠定基础。通过前期研究克隆获得了水曲柳TCP4基因序列,并命名为FmTCP4,应用生物信息学软件对水曲柳FmTCP4基因的分子结构特征进行了分析,利用4℃低温、盐(Na Cl)以及干旱(PEG6000)进行非生物胁迫处理,利用脱落酸(ABA)和赤霉素(GA3)进行激素信号诱导,分析FmTCP4基因的表达特征。生物信息学分析表明该基因全长1 251 bp,具有完整的开放阅读框,编码416个氨基酸。FmTCP4具有螺旋-环-螺旋结构,为亲水性的不稳定蛋白,不存在信号肽,具有跨膜能力,亚细胞定位预测存在于细胞核中,并在细胞质到细胞核的调控中起作用。同源序列比对结果表明,FmTCP4与芝麻、烟草等物种的同源蛋白序列相比具有很高的同源性。非生物胁迫处理后,FmTCP4的表达量随处理时间而改变,但其变化趋势不同,表明FmTCP4明显响应了这3种非生物胁迫。激素信号诱导结果表明,外源植物激素调控了FmTCP4基因的表达,基因表达量相对于对照组具有显著性差异。非生物胁迫和激素信号诱导下的基因表达分析表明,FmTCP4响应了寒冷、盐、干旱等非生物胁迫以及激素信号,说明其参与了植物的生长发育和逆境胁迫的平衡。
关键词
水曲柳
TCP转录因子
基因克隆
生物信息分析
Keywords
Fraxinus mandschurica
TCP transcription factor
gene clone
bioinformatics analysis
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
S792.41 [农业科学—林木遗传育种]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水曲柳TCP4转录因子克隆及胁迫和激素下的表达分析
刘春浩
梁楠松
于磊
赵兴堂
刘颖
孙爽
王紫晴
詹亚光
《北京林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
23
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