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牛TARDBP基因核心启动子鉴定与转录调控分析
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作者 张清兰 张亚冉 +7 位作者 鞠志花 王秀革 肖遥 王金鹏 魏晓超 高亚平 白福恒 王洪程 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期306-318,共13页
【目的】为了解牛TARDBP基因结构、功能及启动子活性区域,分析该基因的转录调控机制。【方法】通过PCR技术克隆牛TARDBP基因编码区全长序列。应用生物信息学软件对牛TARDBP蛋白性质和结构进行分析。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检... 【目的】为了解牛TARDBP基因结构、功能及启动子活性区域,分析该基因的转录调控机制。【方法】通过PCR技术克隆牛TARDBP基因编码区全长序列。应用生物信息学软件对牛TARDBP蛋白性质和结构进行分析。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测TARDBP基因在泌乳期荷斯坦奶牛不同组织中的表达情况。应用5'RACE技术确定牛TARDBP基因的转录起始位点,PCR技术克隆牛TARDBP基因启动子区和5'端系列缺失片段,并运用生物信息学软件对牛TARDBP基因启动子区域CpG岛和潜在转录因子结合位点进行预测,双荧光素酶报告系统确定该基因的核心启动子区域。【结果】牛TARDBP基因在包括乳腺在内的多个组织中均有表达。TARDBP蛋白是一种水溶性非分泌蛋白,存在RNA识别结构域和DNA结合位点。TARDBP基因启动子区存在2个CpG岛和大量转录因子结合位点包括SP1、PPARA、PPARD、PPARG、SREBF1等。双荧光素酶活性分析结果显示牛TARDBP的核心启动子区位于-476--149之间,该区域包含Sp1、PPARG、PPARD、SREBF1结合元件,但不存在TATA-box。【结论】牛TARDBP基因在奶牛多个组织中均有表达。-476--149片段为牛TARDBP基因的核心启动子区,且该区域中存在与乳脂合成和分泌相关的转录因子结合位点。 展开更多
关键词 荷斯坦奶牛 TARDBP基因 生物信息学 启动子
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日本三角涡虫全能干细胞的分离培养与鉴定
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作者 王秀革 刘旭东 +3 位作者 于倩 黄金明 王长法 袁金铎 《山东农业科学》 2013年第2期34-37,共4页
涡虫具有极强的再生能力,并且认为涡虫体内存在一类具有增殖分化潜能被称为neoblasts的全能干细胞。这种细胞在涡虫体内可发生迁移、增殖和分化,对其个体组织器官损伤的修复具有重要作用。本实验中,三角涡虫经过饥饿处理后切取特定的组... 涡虫具有极强的再生能力,并且认为涡虫体内存在一类具有增殖分化潜能被称为neoblasts的全能干细胞。这种细胞在涡虫体内可发生迁移、增殖和分化,对其个体组织器官损伤的修复具有重要作用。本实验中,三角涡虫经过饥饿处理后切取特定的组织块,然后再经过处理使组织块中的细胞分离出来。分离的细胞继续培养并通过碱性磷酸酶检测最终鉴定为neoblasts干细胞。 展开更多
关键词 三角涡虫 全能干细胞 分离 培养 鉴定
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SPEF2基因可变剪切体和功能性SNP鉴定及其与公牛精液性状的相关性研究 被引量:3
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作者 郭芳 罗国静 +3 位作者 鞠志花 王秀革 黄金明 徐银学 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期119-125,共7页
为研究牛精子鞭毛2(SPEF2)基因在中国荷斯坦公牛各组织中的表达调控机制及其与精液品质的相关性,利用RTPCR和克隆测序技术分析SPEF2基因的可变剪切体,同时利用PCR-RFLP(PCR-restriction fragment length polymorphism)技术对中国荷斯坦... 为研究牛精子鞭毛2(SPEF2)基因在中国荷斯坦公牛各组织中的表达调控机制及其与精液品质的相关性,利用RTPCR和克隆测序技术分析SPEF2基因的可变剪切体,同时利用PCR-RFLP(PCR-restriction fragment length polymorphism)技术对中国荷斯坦公牛群体进行基因型检测分析。结果表明:鉴定到1个新转录本,命名为SPEF2-splice variant(SPEF2-SV),此转录本是从外显子2到外显子5之间缺失459 bp的新序列,预测编码1个含有1 618个氨基酸的蛋白。SPEF2基因的参考转录本在睾丸中高表达,而SPEF2-SV呈现低表达。在SPEF2基因第1内含子(邻近剪切位点附近140 bp)筛选到1个单核苷酸多态(SNP)突变位点(g.11043C>T),经ESEfinder 3.0软件预测发现该SNP改变了剪切因子结合蛋白SC35与靶序列的结合,它可能是产生异常转录本的重要原因。此SNP位点与中国荷斯坦公牛精液品质的相关性分析结果表明,其与射精量、精子密度和精子活力无显著相关,而与精子畸形率显著相关(P<0.05),其中等位基因对精子畸形的加性效应、显性和替代效应分别是-1.24%、-2.99%、-0.76%。结论:SPEF2基因表达受可变剪切机制的调控,而且其g.11043C>T突变位点可作为中国荷斯坦公牛精液品质选择的潜在功能性分子标记。 展开更多
关键词 精子鞭毛2基因 剪切增强子 单核苷酸多态性 公牛 精液品质
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粘着斑激酶FAK基因功能研究进展 被引量:5
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作者 马勇 鞠志花 +3 位作者 王秀革 张燕 王长法 刘树真 《家畜生态学报》 北大核心 2015年第2期1-8,共8页
粘着斑激酶FAK是一类胞质非受体蛋白酪氨酸激酶,有细胞粘附、凋亡、分化、迁移/移动、细胞周期进程及连接重建等功能。论文概述了FAK的结构、蛋白定位和FAK的几种可变剪切体的形式,重点阐述了FAK与肿瘤的关系,FAK在生殖和早期发育方面... 粘着斑激酶FAK是一类胞质非受体蛋白酪氨酸激酶,有细胞粘附、凋亡、分化、迁移/移动、细胞周期进程及连接重建等功能。论文概述了FAK的结构、蛋白定位和FAK的几种可变剪切体的形式,重点阐述了FAK与肿瘤的关系,FAK在生殖和早期发育方面的作用,对FAK在肿瘤研究以及生殖方面研究提出了有意义的方向。 展开更多
关键词 FAK 肿瘤促进 生殖
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钙蛋白酶1与动物雄性生殖
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作者 崔晓慧 王秀革 +5 位作者 李虹 杨春红 仲跻峰 侯明海 尹苗 王长法 《家畜生态学报》 北大核心 2015年第11期1-5,11,共6页
钙蛋白酶1(calpain1,CAPN1)在动物各组织中普遍表达,广泛参与机体的信号传导、细胞凋亡和细胞周期调控等生理过程。钙蛋白酶1存在于精子的头部,参与精子发生和顶体反应等生理过程,对精子发挥正常功能具有重要的作用。本文主要阐述了钙... 钙蛋白酶1(calpain1,CAPN1)在动物各组织中普遍表达,广泛参与机体的信号传导、细胞凋亡和细胞周期调控等生理过程。钙蛋白酶1存在于精子的头部,参与精子发生和顶体反应等生理过程,对精子发挥正常功能具有重要的作用。本文主要阐述了钙蛋白酶1的结构、功能以及与雄性生殖相关性研究进展,为人们进一步研究该基因奠定基础。 展开更多
关键词 钙蛋白酶1 精子发生 遗传变异 分子调控
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牛补体C6基因SNPs与奶牛乳腺炎的关联性
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作者 周雷 鞠志花 +6 位作者 张燕 黄金明 齐超 王秀革 安利国 仲跻峰 王长法 《济南大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2014年第2期133-137,共5页
以469头中国荷斯坦奶牛为样本,利用DNA测序及多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术等方法检测牛C6基因中单核苷酸多态性(SNP)位点。经序列比对发现4个单核苷酸多态性位点(SNPs):第2外显子上g.+2235G>A(G突变为A),第8外显子上g.+32881C&g... 以469头中国荷斯坦奶牛为样本,利用DNA测序及多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术等方法检测牛C6基因中单核苷酸多态性(SNP)位点。经序列比对发现4个单核苷酸多态性位点(SNPs):第2外显子上g.+2235G>A(G突变为A),第8外显子上g.+32881C>A(C突变为A)和g.+32925C>T(C突变为T),第17外显子上g.+69060T>C(T突变为C)。经SAS软件统计分析发现:g.+32881C>A突变的群体,CA基因型的个体体细胞评分显著高于CC基因型的个体(p<0.05),且其产奶量显著低于CC个体(p<0.05);发生g.+69060T>C突变的个体,CC基因型的个体产奶量极显著高于TT基因型个体(p<0.01),同时其乳蛋白率显著高于TT基因型个体(p<0.05)。 展开更多
关键词 奶牛乳腺炎 补体C6基因 单核苷酸多态性
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奶牛β-酪蛋白基因分型及A2型牛群培育技术研究进展 被引量:16
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作者 李建斌 刘文娇 +5 位作者 王秀革 侯磊 李荣岭 张汝美 王玲玲 仲跻峰 《中国奶牛》 2017年第6期31-33,共3页
牛乳是重要的营养物质,酪蛋白是乳蛋白的主要存在形式。酪蛋白不仅是一种全价蛋白,而且在工业方面还有重要的应用。A1和A2是奶牛β-酪蛋白的两种存在形式,其中A2型是野生型。本文从β-酪蛋白的营养作用、分类及特性、β-酪蛋白基因分型... 牛乳是重要的营养物质,酪蛋白是乳蛋白的主要存在形式。酪蛋白不仅是一种全价蛋白,而且在工业方面还有重要的应用。A1和A2是奶牛β-酪蛋白的两种存在形式,其中A2型是野生型。本文从β-酪蛋白的营养作用、分类及特性、β-酪蛋白基因分型方法及A2型牛群培育等方面进行了综述。 展开更多
关键词 奶牛 A2-β-酪蛋白 牛群培育
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