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SNPs在水产动物中的研究进展
被引量:
10
1
作者
张晓萌
马普
+1 位作者
王洪迪
王秀利
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期7-11,共5页
单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)是在基因组上分布最为广泛的分子标记,已成为分子生物学的研究热点。综述SNPs在水产动物疾病、生长性状和繁殖性能等方面的研究进展,以期为水产动物养殖及分子标记辅助育种提供参考。
关键词
SNPS
分子标记
水产动物
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职称材料
光棘球海胆CYP17基因的SNPs标记筛选及遗传分析
被引量:
1
2
作者
朱琳琳
王秀利
+4 位作者
王洪迪
郭晓黎
常亚青
刘洋
仇雪梅
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期373-377,共5页
采用聚合酶链式反应、单链构象多态性(PCR-SSCP)技术和基因测序方法筛选光棘球海胆Strongylocentrotus nudus细胞色素17α羟化酶/17,20裂解酶(17α-hydroxylase/17,20-lyase,CYP17)基因编码区单核苷酸多态性(SNPs),并进行了基于SNPs的...
采用聚合酶链式反应、单链构象多态性(PCR-SSCP)技术和基因测序方法筛选光棘球海胆Strongylocentrotus nudus细胞色素17α羟化酶/17,20裂解酶(17α-hydroxylase/17,20-lyase,CYP17)基因编码区单核苷酸多态性(SNPs),并进行了基于SNPs的遗传分析。结果表明:在CYP17基因的270、417、666 nt处均发生了碱基的点突变,即G270A、A417G和C666T,前两个突变位点位于引物对BF/BR的扩增产物中,后一个突变位点位于引物对CF/CR的扩增产物中;引物对BF/BR的扩增产物可形成3种基因型,即AA、BB和AB基因型,A和B等位基因频率分别为0.54和0.46,AA、AB和BB基因型频率分别为0.30、0.48和0.22,该座位的杂合度(He)、纯合度(Ho)、多态性信息含量(PIC)和有效等位基因数(Na)分别为0.496 8、0.503 2、0.373 4和1.987 3;引物对CF/CR的扩增产物形成了两种基因型,即CC和CD基因型,C和D等位基因频率分别为0.68和0.32,CC和CD基因型频率分别为0.84和0.16,该座位的He、Ho、PIC和Na分别为0.268 8、0.731 2、0.232 7和1.367 6。遗传变异分析结果表明:两个座位均属于低度多态性,而且群体遗传杂合度较低,这反映了该群体的遗传一致性较高。本研究筛选的3个SNPs为今后CYP17基因在光棘球海胆性腺生长发育研究上提供了前期科研基础。
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关键词
光棘球海胆
CYP17基因
单核苷酸多态性
遗传分析
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职称材料
题名
SNPs在水产动物中的研究进展
被引量:
10
1
作者
张晓萌
马普
王洪迪
王秀利
机构
大连海洋大学水产与生命学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期7-11,共5页
基金
辽宁省自然科学基金项目(20102043)
辽宁省"百千万人才工程"项目(2010921093)
文摘
单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)是在基因组上分布最为广泛的分子标记,已成为分子生物学的研究热点。综述SNPs在水产动物疾病、生长性状和繁殖性能等方面的研究进展,以期为水产动物养殖及分子标记辅助育种提供参考。
关键词
SNPS
分子标记
水产动物
Keywords
Single nucleotide polymorphism Molecular marker Aquaculture animals
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
光棘球海胆CYP17基因的SNPs标记筛选及遗传分析
被引量:
1
2
作者
朱琳琳
王秀利
王洪迪
郭晓黎
常亚青
刘洋
仇雪梅
机构
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
大连海洋大学水产与生命学院
出处
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期373-377,共5页
基金
国家“863”计划重大项目(2012AA10A412)
国家自然科学基金资助项目(31101923)
+2 种基金
辽宁省自然科学基金资助项目(20102043)
辽宁省百千万人才工程项目(2010921093)
大连海洋大学科研项目(2012HYDX02)
文摘
采用聚合酶链式反应、单链构象多态性(PCR-SSCP)技术和基因测序方法筛选光棘球海胆Strongylocentrotus nudus细胞色素17α羟化酶/17,20裂解酶(17α-hydroxylase/17,20-lyase,CYP17)基因编码区单核苷酸多态性(SNPs),并进行了基于SNPs的遗传分析。结果表明:在CYP17基因的270、417、666 nt处均发生了碱基的点突变,即G270A、A417G和C666T,前两个突变位点位于引物对BF/BR的扩增产物中,后一个突变位点位于引物对CF/CR的扩增产物中;引物对BF/BR的扩增产物可形成3种基因型,即AA、BB和AB基因型,A和B等位基因频率分别为0.54和0.46,AA、AB和BB基因型频率分别为0.30、0.48和0.22,该座位的杂合度(He)、纯合度(Ho)、多态性信息含量(PIC)和有效等位基因数(Na)分别为0.496 8、0.503 2、0.373 4和1.987 3;引物对CF/CR的扩增产物形成了两种基因型,即CC和CD基因型,C和D等位基因频率分别为0.68和0.32,CC和CD基因型频率分别为0.84和0.16,该座位的He、Ho、PIC和Na分别为0.268 8、0.731 2、0.232 7和1.367 6。遗传变异分析结果表明:两个座位均属于低度多态性,而且群体遗传杂合度较低,这反映了该群体的遗传一致性较高。本研究筛选的3个SNPs为今后CYP17基因在光棘球海胆性腺生长发育研究上提供了前期科研基础。
关键词
光棘球海胆
CYP17基因
单核苷酸多态性
遗传分析
Keywords
Strongylocentrotus nudus
17a-hydroxylase/17,20-1yase gene
single nucleotide polymorphisms
genetic analysis
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
SNPs在水产动物中的研究进展
张晓萌
马普
王洪迪
王秀利
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
光棘球海胆CYP17基因的SNPs标记筛选及遗传分析
朱琳琳
王秀利
王洪迪
郭晓黎
常亚青
刘洋
仇雪梅
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
1
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职称材料
已选择
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