-
题名狗尾草ARF基因家族的鉴定与表达分析
被引量：1
- 1
-
-
作者
王其昕
张凌馨
钟妮娜
熊王丹
-
机构
青岛农业大学草业学院
黄河三角洲草地资源与生态国家林业和草原局重点实验室
-
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期227-235,共9页
-
基金
国家自然科学基金项目(31872879)
山东省自然科学基金项目(ZR2023MC071)
山东省大学生创新创业项目(S202310435231)。
-
文摘
【目的】生长素响应因子ARF(auxin response factor)可以调控生长素响应基因的表达,在植物生长发育中发挥着重要作用。从狗尾草全基因组范围内鉴定出SvARF基因家族成员,分析相关基因表达特征,为后续深入研究其与狗尾草生长发育的关系提供支撑。【方法】利用生物信息学方法从狗尾草基因组中鉴定了ARF转录因子成员,分析其系统进化、染色体定位和基因结构等情况。利用RT-qPCR(quantitative real-time polymerase chain reaction)分析该家族成员在生长素类除草剂2,4-D异辛酯处理后的表达响应情况。【结果】共鉴定到24个狗尾草SvARF基因家族成员,可分成4个亚家族,同一亚家族SvARF基因的结构相似且基因表达模式相近。不同SvARF基因的表达模式存在差异,且有组织特异性,III亚家族的SvARF基因在根茎分蘖处的表达量均较高。2,4-D异辛酯处理后,有9个SvARF基因的相对表达量发生显著变化,其中SvARF5、SvARF6、SvARF9、SvARF10、SvARF17和SvARF18表达量显著上调,SvARF14、SvARF22和SvARF24表达量显著下调。【结论】狗尾草SvARF基因家族有24个成员。生长素类除草剂影响SvARF基因的表达,暗示SvARF基因在抑制狗尾草植株分蘖中发挥重要作用。
-
关键词
ARF转录因子
狗尾草
系统进化
结构特征
表达分析
分蘖
2
4-D异辛酯
-
Keywords
ARF transcription factor
Setaria viridis
phylogenetic evolution
structure characteristics
gene expression
tillering
2,4-D isooctyl ester
-
分类号
Q943.2
[生物学—植物学]
-
