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苦荞蔗糖合酶基因克隆及序列分析
被引量：
4
1
作者
燕雪芬
李玉萍
+1 位作者
张海纳
陈鹏
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期80-86,共7页
以苦荞基因组DNA为模板，根据已构建的苦荞eDNA文库中蔗糖合酶（Sucrose synthase，SuSy）的部分eDNA序列设计引物，PCR扩增SuSy基因的核心片段，结合Genomic walking技术获得SuSy基因的完整序列。生物信息学分析表明，该基因序列全长44...
以苦荞基因组DNA为模板，根据已构建的苦荞eDNA文库中蔗糖合酶（Sucrose synthase，SuSy）的部分eDNA序列设计引物，PCR扩增SuSy基因的核心片段，结合Genomic walking技术获得SuSy基因的完整序列。生物信息学分析表明，该基因序列全长4428bp，含有12个外显子和11个内含子，剪接位点均符合经典GU—AG法则，ORF长度为2412bp，共编码803个氨基酸。其氨基酸序列与籽粒苋（Amaranthus hypo—chondriacus）、甜菜（Beta vulgaris）、红叶藜（Chenopodium rubrumL）和大豆（Glycine max）的相似性分别为86％、86％、85％和83％。保守结构域分析表明，SuSy含有1个GT1糖基化酶功能结构域（275～760）和4个ADP结合位点，能够催化果糖-6-磷酸和尿苷5L二磷酸葡萄糖形成蔗糖-6-磷酸。
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关键词
苦荞
蔗糖合酶
基因克隆
生物信息学分析
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职称材料
题名
苦荞蔗糖合酶基因克隆及序列分析
被引量：
4
1
作者
燕雪芬
李玉萍
张海纳
陈鹏
机构
西北农林科技大学生命学院
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期80-86,共7页
基金
国家自然科学基金(31171606)~~
文摘
以苦荞基因组DNA为模板，根据已构建的苦荞eDNA文库中蔗糖合酶（Sucrose synthase，SuSy）的部分eDNA序列设计引物，PCR扩增SuSy基因的核心片段，结合Genomic walking技术获得SuSy基因的完整序列。生物信息学分析表明，该基因序列全长4428bp，含有12个外显子和11个内含子，剪接位点均符合经典GU—AG法则，ORF长度为2412bp，共编码803个氨基酸。其氨基酸序列与籽粒苋（Amaranthus hypo—chondriacus）、甜菜（Beta vulgaris）、红叶藜（Chenopodium rubrumL）和大豆（Glycine max）的相似性分别为86％、86％、85％和83％。保守结构域分析表明，SuSy含有1个GT1糖基化酶功能结构域（275～760）和4个ADP结合位点，能够催化果糖-6-磷酸和尿苷5L二磷酸葡萄糖形成蔗糖-6-磷酸。
关键词
苦荞
蔗糖合酶
基因克隆
生物信息学分析
Keywords
Fagopyrum tatarium
Sucrose synthase
Gene cloning
Bioinformatics analysis
分类号
S517 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苦荞蔗糖合酶基因克隆及序列分析
燕雪芬
李玉萍
张海纳
陈鹏
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
4
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