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广东从化陈禾洞省级自然保护区兰科植物资源分布
被引量：
2
1
作者
余佩琪
陈焕锦
+3 位作者
钟平生
熊露桥
陈永发
甘新军
《林业与环境科学》
2024年第2期135-141,共7页
为摸清陈禾洞保护区兰科植物资源,通过典型生境路线法进行调查,分析资源分布现状与受威胁因素,提出相应的保护策略。结果表明:陈禾洞兰科植物共有3属65种,种属的成分较为复杂多样;从区系来看,陈禾洞兰科植物分为8类型和1变型,以热带分...
为摸清陈禾洞保护区兰科植物资源,通过典型生境路线法进行调查,分析资源分布现状与受威胁因素,提出相应的保护策略。结果表明:陈禾洞兰科植物共有3属65种,种属的成分较为复杂多样;从区系来看,陈禾洞兰科植物分为8类型和1变型,以热带分布属为主,具有较高的热带属性;有国家二级重点保护野生植物13种,被《IUCN濒危物种红色名录》收录8种;生活型齐全,以地生兰为主,广布种占优势,海拔对物种分布存在一定影响。保护区应加强兰科资源动态监测,综合采取就地保护、迁地保护和回归等技术措施,从而进行有效保护。
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关键词
陈禾洞保护区
兰科植物
资源分布
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职称材料
厚叶木莲(Manglietia pachyphylla)基因组草图
2
作者
甘新军
宾粤
+6 位作者
陈焕锦
朱韦光
熊露桥
余恩萍
王峥峰
徐凤霞
曹洪麟
《广西科学》
CAS
北大核心
2023年第6期1079-1090,共12页
厚叶木莲(Manglietia pachyphylla)为木兰科(Magnoliaceae)木莲属(Manglietia)的木本植物,零星分布于我国广东省和广西壮族自治区,为国家二级重点保护野生植物。了解濒危物种基因组信息及其遗传多样性有助于合理地保护和利用濒危物种,...
厚叶木莲(Manglietia pachyphylla)为木兰科(Magnoliaceae)木莲属(Manglietia)的木本植物,零星分布于我国广东省和广西壮族自治区,为国家二级重点保护野生植物。了解濒危物种基因组信息及其遗传多样性有助于合理地保护和利用濒危物种,实现濒危物种的解濒和复壮。为此,本研究通过高通量测序方法对厚叶木莲基因组进行测序,并利用测序数据开展厚叶木莲基因组草图的组装;之后,基于组装的基因组预测其中的重复序列和基因,进行系统发育和基因家族分析。结果表明,组装的厚叶木莲基因组大小为2092298891 bp,包含676个组装序列,N50(将组装的序列按照长度由大到小进行累加,当累加到某个序列时,累加的值为基因组50%的长度时,此序列的长度即为N50)为7961115 bp;利用BUSCO(Benchmarking Universal Single Copy Orthologs),针对“eudicots”和“embryophyta”这两个BUSCO单拷贝基因库,对基因组组装的完整性进行评估,组装的厚叶木莲基因组完整性分别为96.6%和98.8%。厚叶木莲基因组有76.5%的序列为重复序列,共有37900个基因,这些基因编码了41675个蛋白质序列。系统发育分析发现厚叶木莲与望春玉兰(Magnolia biondii)聚在一起,两者分化时间大致为10500000年前。厚叶木莲中与木质部/韧皮部、肌动蛋白丝、热、光合作用以及多种次生代谢相关的基因家族显著扩张,其中次生代谢相关基因在厚叶木莲基因组上呈串联和近端重复,这些基因的扩张和重复形成方式可能与厚叶木莲适应高海拔环境有关。本研究是国内外木兰科木莲属首个基因组报道,为更好地保护和开发厚叶木莲及木兰科其他物种的种质资源提供了遗传信息和参考。
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关键词
厚叶木莲
木兰科
木莲属
濒危植物
基因组组装
基因预测
基因家族
基因重复
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职称材料
陈禾洞自然保护区珍稀濒危及特有植物资源调查
被引量：
9
3
作者
朱永钊
熊露桥
+2 位作者
黄萧洒
陈焕锦
程楠楠
《绿色科技》
2018年第16期132-135,共4页
采用野外调查以及标本采集等方法,对广东陈禾洞省级自然保护区珍稀濒危植物资源进行了调查,结果表明:陈禾洞自然保护区共有珍稀濒危植物20种,国家重点保护野生植物有10种,IUCN红色名录植物有53种,中国物种红色名录物种(CSRL)有11种,CITE...
采用野外调查以及标本采集等方法,对广东陈禾洞省级自然保护区珍稀濒危植物资源进行了调查,结果表明:陈禾洞自然保护区共有珍稀濒危植物20种,国家重点保护野生植物有10种,IUCN红色名录植物有53种,中国物种红色名录物种(CSRL)有11种,CITES名录附录Ⅱ物种有34种,该区域植物特有成分多,含中国特有植物17种。应用样方法进行了厚叶木莲群落物种多样性分析,结果显示,群落中有维管植物44科75属129种,并且群落中的优势物种不太明显。提出了对区域内珍稀濒危植物应采取多种措施进行有效的保护,在就地保护的基础上,同时要进行迁地保护及其他保育手段,以扩大其种群数量。
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关键词
陈禾洞自然保护区
珍稀濒危植物
国家重点保护野生植物
特有植物
保护对策
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职称材料
题名
广东从化陈禾洞省级自然保护区兰科植物资源分布
被引量：
2
1
作者
余佩琪
陈焕锦
钟平生
熊露桥
陈永发
甘新军
机构
广东从化陈禾洞省级自然保护区
南雄市小流坑青嶂山自然保护区
出处
《林业与环境科学》
2024年第2期135-141,共7页
文摘
为摸清陈禾洞保护区兰科植物资源,通过典型生境路线法进行调查,分析资源分布现状与受威胁因素,提出相应的保护策略。结果表明:陈禾洞兰科植物共有3属65种,种属的成分较为复杂多样;从区系来看,陈禾洞兰科植物分为8类型和1变型,以热带分布属为主,具有较高的热带属性;有国家二级重点保护野生植物13种,被《IUCN濒危物种红色名录》收录8种;生活型齐全,以地生兰为主,广布种占优势,海拔对物种分布存在一定影响。保护区应加强兰科资源动态监测,综合采取就地保护、迁地保护和回归等技术措施,从而进行有效保护。
关键词
陈禾洞保护区
兰科植物
资源分布
Keywords
Chenhedong Provincial Nature Reserve
Orchidaceae
resources distribution
分类号
S757.2 [农业科学—森林经理学]
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职称材料
题名
厚叶木莲(Manglietia pachyphylla)基因组草图
2
作者
甘新军
宾粤
陈焕锦
朱韦光
熊露桥
余恩萍
王峥峰
徐凤霞
曹洪麟
机构
广东从化陈禾洞省级自然保护区管理处
中国科学院华南植物园
华南国家植物园
中国科学院大学
中国科学院华南植物园
出处
《广西科学》
CAS
北大核心
2023年第6期1079-1090,共12页
基金
广东省重点领域研发计划项目(2022B1111230001)及其子课题(2022B1111230001-2-5)
广东从化陈禾洞省级自然保护区“厚叶木莲种群调查、评价及扩繁”项目
广东省林业局生态林业建设专项资金项目“高水平专类园珍稀特有植物保护与建设”资助。
文摘
厚叶木莲(Manglietia pachyphylla)为木兰科(Magnoliaceae)木莲属(Manglietia)的木本植物,零星分布于我国广东省和广西壮族自治区,为国家二级重点保护野生植物。了解濒危物种基因组信息及其遗传多样性有助于合理地保护和利用濒危物种,实现濒危物种的解濒和复壮。为此,本研究通过高通量测序方法对厚叶木莲基因组进行测序,并利用测序数据开展厚叶木莲基因组草图的组装;之后,基于组装的基因组预测其中的重复序列和基因,进行系统发育和基因家族分析。结果表明,组装的厚叶木莲基因组大小为2092298891 bp,包含676个组装序列,N50(将组装的序列按照长度由大到小进行累加,当累加到某个序列时,累加的值为基因组50%的长度时,此序列的长度即为N50)为7961115 bp;利用BUSCO(Benchmarking Universal Single Copy Orthologs),针对“eudicots”和“embryophyta”这两个BUSCO单拷贝基因库,对基因组组装的完整性进行评估,组装的厚叶木莲基因组完整性分别为96.6%和98.8%。厚叶木莲基因组有76.5%的序列为重复序列,共有37900个基因,这些基因编码了41675个蛋白质序列。系统发育分析发现厚叶木莲与望春玉兰(Magnolia biondii)聚在一起,两者分化时间大致为10500000年前。厚叶木莲中与木质部/韧皮部、肌动蛋白丝、热、光合作用以及多种次生代谢相关的基因家族显著扩张,其中次生代谢相关基因在厚叶木莲基因组上呈串联和近端重复,这些基因的扩张和重复形成方式可能与厚叶木莲适应高海拔环境有关。本研究是国内外木兰科木莲属首个基因组报道,为更好地保护和开发厚叶木莲及木兰科其他物种的种质资源提供了遗传信息和参考。
关键词
厚叶木莲
木兰科
木莲属
濒危植物
基因组组装
基因预测
基因家族
基因重复
Keywords
Manglietia pachyphylla
Magnoliaceae
Manglietia
endangered plant
genome assembly
gene prediction
gene family
gene duplication
分类号
Q16 [生物学—普通生物学]
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职称材料
题名
陈禾洞自然保护区珍稀濒危及特有植物资源调查
被引量：
9
3
作者
朱永钊
熊露桥
黄萧洒
陈焕锦
程楠楠
机构
广东从化陈禾洞省级自然保护区管理处
广州林芳生态科技有限公司
出处
《绿色科技》
2018年第16期132-135,共4页
基金
广东从化陈禾洞省级自然保护区动植物本底资源调查项目
文摘
采用野外调查以及标本采集等方法,对广东陈禾洞省级自然保护区珍稀濒危植物资源进行了调查,结果表明:陈禾洞自然保护区共有珍稀濒危植物20种,国家重点保护野生植物有10种,IUCN红色名录植物有53种,中国物种红色名录物种(CSRL)有11种,CITES名录附录Ⅱ物种有34种,该区域植物特有成分多,含中国特有植物17种。应用样方法进行了厚叶木莲群落物种多样性分析,结果显示,群落中有维管植物44科75属129种,并且群落中的优势物种不太明显。提出了对区域内珍稀濒危植物应采取多种措施进行有效的保护,在就地保护的基础上,同时要进行迁地保护及其他保育手段,以扩大其种群数量。
关键词
陈禾洞自然保护区
珍稀濒危植物
国家重点保护野生植物
特有植物
保护对策
Keywords
Chenhedong Reserve
rare and endangered plants
national key protected wild plants
endemic plants
conservation strategy
分类号
Q948.5 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广东从化陈禾洞省级自然保护区兰科植物资源分布
余佩琪
陈焕锦
钟平生
熊露桥
陈永发
甘新军
《林业与环境科学》
2024
2
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职称材料
2
厚叶木莲(Manglietia pachyphylla)基因组草图
甘新军
宾粤
陈焕锦
朱韦光
熊露桥
余恩萍
王峥峰
徐凤霞
曹洪麟
《广西科学》
CAS
北大核心
2023
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
陈禾洞自然保护区珍稀濒危及特有植物资源调查
朱永钊
熊露桥
黄萧洒
陈焕锦
程楠楠
《绿色科技》
2018
9
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职称材料
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