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圆齿野鸦椿CLE多肽的系统鉴定及功能分析
1
作者
潘钰茹
吴金琳
+2 位作者
高宇欣
唐韦伟
邹小兴
《南方农业》
2025年第1期1-7,F0003,共8页
采用生物信息学的方法,鉴定和分析了圆齿野鸦椿(Euscaphis konishii Hayata)CLE基因家族组成及其表达调控作用机制。结果:从圆齿野鸦椿中共鉴定出15个CLE基因,分布在圆齿野鸦椿的6条染色体上,其编码的前体肽大小介于94~920 aa,蛋白质相...
采用生物信息学的方法,鉴定和分析了圆齿野鸦椿(Euscaphis konishii Hayata)CLE基因家族组成及其表达调控作用机制。结果:从圆齿野鸦椿中共鉴定出15个CLE基因,分布在圆齿野鸦椿的6条染色体上,其编码的前体肽大小介于94~920 aa,蛋白质相对分子质量介于10705.66~101725.48 KD,理论等电点介于5.84~12.01。多序列比对和偏好性分析表明,圆齿野鸦椿CLE与拟南芥[Arabidopsis thaliana(L.)Heynh.]CLE的同源多肽较为一致,但是部分圆齿野鸦椿CLE在第9位氨基酸上表现出了对丝氨酸的偏好性。系统进化分析表明,圆齿野鸦椿CLE基因成员分为6大亚家族,分别为Group1(0个)、Group2(0个)、Group3(CLE1、CLE2)、Group4(CLE8、CLE9、CLE10、CLE13、CLE14、CLE15)、Group5(CLE11、CLE12)、Group6(CLE3、CLE4、CLE5、CLE6、CLE7)亚组。功能分析发现,CLE3、CLE4在根部维管束组织中表达,影响根的初生木质部发育,CLE9、CLE10、CLE8、CLE13、CLE14、CLE15在根部韧皮部中表达,可以通过间接或直接相互作用,引导根的初生韧皮部细胞从分裂向分化转化。
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关键词
圆齿野鸦椿(Euscaphis
konishii
Hayata)
CLE多肽
系统进化
功能分析
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职称材料
MaxEnt模型预测气候变化下野鸦椿在中国的潜在地理分布
被引量：
2
2
作者
徐易溱
文威坚
+3 位作者
林协全
高宇欣
潘钰茹
邹小兴
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期47-51,共5页
筛选野鸦椿(Euscaphis japonica)的288条分布记录及10个环境因子,采用MaxEnt和ArcGIS模拟探究野鸦椿当前、未来2041—2060年、未来2081—2100年3种气候变化情景下的潜在区分布,使用环境变量贡献率、置换重要值、刀切法检验综合评估影响...
筛选野鸦椿(Euscaphis japonica)的288条分布记录及10个环境因子,采用MaxEnt和ArcGIS模拟探究野鸦椿当前、未来2041—2060年、未来2081—2100年3种气候变化情景下的潜在区分布,使用环境变量贡献率、置换重要值、刀切法检验综合评估影响当代野鸦椿分布的主导环境因子,对野鸦椿潜在适生区的变化趋势进行分析。结果表明:MaxEnt模型的评价指标受试者工作特征曲线下面积(AUC)训练集和测试集平均值分别为0.943、0.928,说明模型的模拟结果精准度高。最干月降水量、最冷月最低温、坡度、等温性是限制野鸦椿地理分布的4个主要因子。野鸦椿的适宜栖息地面积为141.33×104km^(2),横跨长江以南大部分亚热带地区。随着未来气候变暖,野鸦椿的分布区域呈现沿秦岭-淮河线向北移的趋势。未来需在水热条件及地形层面进行野鸦椿培育,以增加野鸦椿的适生性。
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关键词
野鸦椿
Maxent模型
气候变化
潜在适生区
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职称材料
题名
圆齿野鸦椿CLE多肽的系统鉴定及功能分析
1
作者
潘钰茹
吴金琳
高宇欣
唐韦伟
邹小兴
机构
福建农林大学林学院
自然生物资源保育利用福建省高校工程中心
出处
《南方农业》
2025年第1期1-7,F0003,共8页
基金
中央财政林业科技推广示范项目(闽〔2022〕TG14号)
福建农林大学乡村振兴服务团队项目(11899170128)。
文摘
采用生物信息学的方法,鉴定和分析了圆齿野鸦椿(Euscaphis konishii Hayata)CLE基因家族组成及其表达调控作用机制。结果:从圆齿野鸦椿中共鉴定出15个CLE基因,分布在圆齿野鸦椿的6条染色体上,其编码的前体肽大小介于94~920 aa,蛋白质相对分子质量介于10705.66~101725.48 KD,理论等电点介于5.84~12.01。多序列比对和偏好性分析表明,圆齿野鸦椿CLE与拟南芥[Arabidopsis thaliana(L.)Heynh.]CLE的同源多肽较为一致,但是部分圆齿野鸦椿CLE在第9位氨基酸上表现出了对丝氨酸的偏好性。系统进化分析表明,圆齿野鸦椿CLE基因成员分为6大亚家族,分别为Group1(0个)、Group2(0个)、Group3(CLE1、CLE2)、Group4(CLE8、CLE9、CLE10、CLE13、CLE14、CLE15)、Group5(CLE11、CLE12)、Group6(CLE3、CLE4、CLE5、CLE6、CLE7)亚组。功能分析发现,CLE3、CLE4在根部维管束组织中表达,影响根的初生木质部发育,CLE9、CLE10、CLE8、CLE13、CLE14、CLE15在根部韧皮部中表达,可以通过间接或直接相互作用,引导根的初生韧皮部细胞从分裂向分化转化。
关键词
圆齿野鸦椿(Euscaphis
konishii
Hayata)
CLE多肽
系统进化
功能分析
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
MaxEnt模型预测气候变化下野鸦椿在中国的潜在地理分布
被引量：
2
2
作者
徐易溱
文威坚
林协全
高宇欣
潘钰茹
邹小兴
机构
自然生物资源保育利用福建省高校工程研究中心(福建农林大学)
出处
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期47-51,共5页
基金
中央财政林业科技推广示范项目(闽[2022]TG14号)
福建农林大学乡村振兴服务团队项目(11899170128)。
文摘
筛选野鸦椿(Euscaphis japonica)的288条分布记录及10个环境因子,采用MaxEnt和ArcGIS模拟探究野鸦椿当前、未来2041—2060年、未来2081—2100年3种气候变化情景下的潜在区分布,使用环境变量贡献率、置换重要值、刀切法检验综合评估影响当代野鸦椿分布的主导环境因子,对野鸦椿潜在适生区的变化趋势进行分析。结果表明:MaxEnt模型的评价指标受试者工作特征曲线下面积(AUC)训练集和测试集平均值分别为0.943、0.928,说明模型的模拟结果精准度高。最干月降水量、最冷月最低温、坡度、等温性是限制野鸦椿地理分布的4个主要因子。野鸦椿的适宜栖息地面积为141.33×104km^(2),横跨长江以南大部分亚热带地区。随着未来气候变暖,野鸦椿的分布区域呈现沿秦岭-淮河线向北移的趋势。未来需在水热条件及地形层面进行野鸦椿培育,以增加野鸦椿的适生性。
关键词
野鸦椿
Maxent模型
气候变化
潜在适生区
Keywords
Euscaphis japonica
MaxEnt model
Climate change
Potential suitable habitat
分类号
S792.99 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
圆齿野鸦椿CLE多肽的系统鉴定及功能分析
潘钰茹
吴金琳
高宇欣
唐韦伟
邹小兴
《南方农业》
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
MaxEnt模型预测气候变化下野鸦椿在中国的潜在地理分布
徐易溱
文威坚
林协全
高宇欣
潘钰茹
邹小兴
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
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