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瓜类褪绿黄化病毒及其系统进化分析
被引量:
1
1
作者
韩盛
麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔
+2 位作者
杨渡
温且木·阿布列孜
玉山江·麦麦提
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期866-872,共7页
【目的】检测新疆南疆7个县/市瓜类褪绿黄化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV),进行系统发育分析,为新疆南疆CCYV预警和防控提供参考。【方法】于2019年,从中国新疆南疆7个县/市采集带有黄化特征的51份甜瓜叶片样品,RT-PCR进...
【目的】检测新疆南疆7个县/市瓜类褪绿黄化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV),进行系统发育分析,为新疆南疆CCYV预警和防控提供参考。【方法】于2019年,从中国新疆南疆7个县/市采集带有黄化特征的51份甜瓜叶片样品,RT-PCR进行CCYV的检测,进行特异性片段的克隆、测序和系统发育分析。【结果】中国新疆巴楚县、阿克苏市、莎车县、伽师县、疏勒县、疏附县均未检测到CCYV,而洛浦县的13份样本中,8份检出为CCYV阳性,检出率为61.53%,洛浦县CCYV特异性片段克隆测序获得了685 bp的核酸序列,与GenBank中的CCYV分离物外壳蛋白(Coat protein,CP)的一致性达到100%。所得序列与中国新疆(吐鲁番)、中国其他省、苏丹、日本、塞浦路斯、黎巴嫩的CP基因聚在I组(Group),沙特阿拉伯的分离物聚在Ⅱ组,伊朗的分离物聚在Ⅲ组。【结论】CCYV在中国新疆南疆洛浦县甜瓜产区发生,与中国新疆吐鲁番、中国其他省及周围国家的CCYV分离物亲缘关系很近,且群体遗传变异很小。
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关键词
瓜类褪绿黄化病毒
和田
甜瓜
病毒分布
病毒进化
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职称材料
瓜类蚜传黄化病毒在南疆的检测及系统进化
被引量:
2
2
作者
麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔
杨渡
+2 位作者
韩盛
温且木·阿布列孜
玉山江·麦麦提
《中国蔬菜》
北大核心
2020年第7期38-44,共7页
2019年从南疆7个县/市采集表现瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)侵染典型特征的47份甜瓜叶片样品,通过RT-PCR进行CABYV的检测,从县/市各选出1份代表性样本,进行特异性片段的克隆、测序,以及核苷酸多样性、...
2019年从南疆7个县/市采集表现瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)侵染典型特征的47份甜瓜叶片样品,通过RT-PCR进行CABYV的检测,从县/市各选出1份代表性样本,进行特异性片段的克隆、测序,以及核苷酸多样性、蛋白序列和系统发育分析。结果显示,28份样本呈现CABYV阳性,检出率为59.57%,巴楚县、阿克苏市、莎车县、伽师县、疏勒县、疏附县、洛浦县的检出率分别为80.00%、28.57%、83.33%、60.00%、37.50%、71.42%、66.67%。克隆测序获得了707 bp的核酸序列,核苷酸多样性值在0.012~0.018之间,所有序列均具有2个开放阅读框(ORF)。ORF1编码199个氨基酸的外壳蛋白(CP),各县/市的序列相似性为99.07%。ORF2编码191个氨基酸的运动蛋白(MP),各县/市的序列相似性为98.80%。基于CP和MP序列构建的系统发育树表明,各县/市得到的所有CP和MP均聚在亚洲分支。CABYV在南疆甜瓜主产区普遍发生,且不同区域核苷酸变异很低,这些地区的CABYV与中国及日本分离物的亲缘关系较近,而与欧洲及中国台湾分离物的亲缘关系较远。
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关键词
瓜类蚜传黄化病毒
甜瓜
病毒分布
系统进化
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职称材料
题名
瓜类褪绿黄化病毒及其系统进化分析
被引量:
1
1
作者
韩盛
麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔
杨渡
温且木·阿布列孜
玉山江·麦麦提
机构
新疆农业科学院植物保护研究所/农业部西北荒漠绿洲作物有害生物综合治理重点实验室
阿勒泰市菜篮子工程办公室
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期866-872,共7页
基金
新疆维吾尔自治区科技援疆计划“阿泰灵在防治甜瓜病毒病的应用及配套技术研究”(2019E0243)。
文摘
【目的】检测新疆南疆7个县/市瓜类褪绿黄化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV),进行系统发育分析,为新疆南疆CCYV预警和防控提供参考。【方法】于2019年,从中国新疆南疆7个县/市采集带有黄化特征的51份甜瓜叶片样品,RT-PCR进行CCYV的检测,进行特异性片段的克隆、测序和系统发育分析。【结果】中国新疆巴楚县、阿克苏市、莎车县、伽师县、疏勒县、疏附县均未检测到CCYV,而洛浦县的13份样本中,8份检出为CCYV阳性,检出率为61.53%,洛浦县CCYV特异性片段克隆测序获得了685 bp的核酸序列,与GenBank中的CCYV分离物外壳蛋白(Coat protein,CP)的一致性达到100%。所得序列与中国新疆(吐鲁番)、中国其他省、苏丹、日本、塞浦路斯、黎巴嫩的CP基因聚在I组(Group),沙特阿拉伯的分离物聚在Ⅱ组,伊朗的分离物聚在Ⅲ组。【结论】CCYV在中国新疆南疆洛浦县甜瓜产区发生,与中国新疆吐鲁番、中国其他省及周围国家的CCYV分离物亲缘关系很近,且群体遗传变异很小。
关键词
瓜类褪绿黄化病毒
和田
甜瓜
病毒分布
病毒进化
Keywords
Cucurbit chlorotic yellows virus
Hotan
muskmelon
virus distribution
virus evolution
分类号
S436.5 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
瓜类蚜传黄化病毒在南疆的检测及系统进化
被引量:
2
2
作者
麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔
杨渡
韩盛
温且木·阿布列孜
玉山江·麦麦提
机构
新疆农业科学院植物保护研究所
阿勒泰市菜篮子工程办公室
出处
《中国蔬菜》
北大核心
2020年第7期38-44,共7页
基金
新疆维吾尔自治区科技援疆计划项目(2019E0243)
新疆维吾尔自治区公益性科研院所基本科研业务经费资助项目(KYGY2016123)。
文摘
2019年从南疆7个县/市采集表现瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)侵染典型特征的47份甜瓜叶片样品,通过RT-PCR进行CABYV的检测,从县/市各选出1份代表性样本,进行特异性片段的克隆、测序,以及核苷酸多样性、蛋白序列和系统发育分析。结果显示,28份样本呈现CABYV阳性,检出率为59.57%,巴楚县、阿克苏市、莎车县、伽师县、疏勒县、疏附县、洛浦县的检出率分别为80.00%、28.57%、83.33%、60.00%、37.50%、71.42%、66.67%。克隆测序获得了707 bp的核酸序列,核苷酸多样性值在0.012~0.018之间,所有序列均具有2个开放阅读框(ORF)。ORF1编码199个氨基酸的外壳蛋白(CP),各县/市的序列相似性为99.07%。ORF2编码191个氨基酸的运动蛋白(MP),各县/市的序列相似性为98.80%。基于CP和MP序列构建的系统发育树表明,各县/市得到的所有CP和MP均聚在亚洲分支。CABYV在南疆甜瓜主产区普遍发生,且不同区域核苷酸变异很低,这些地区的CABYV与中国及日本分离物的亲缘关系较近,而与欧洲及中国台湾分离物的亲缘关系较远。
关键词
瓜类蚜传黄化病毒
甜瓜
病毒分布
系统进化
Keywords
Cucurbit aphid-borne yellows virus
Melon
Virus distribution
System evolution
分类号
S436.5 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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作者
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被引量
操作
1
瓜类褪绿黄化病毒及其系统进化分析
韩盛
麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔
杨渡
温且木·阿布列孜
玉山江·麦麦提
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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职称材料
2
瓜类蚜传黄化病毒在南疆的检测及系统进化
麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔
杨渡
韩盛
温且木·阿布列孜
玉山江·麦麦提
《中国蔬菜》
北大核心
2020
2
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