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题名甘草GuWOX基因家族的鉴定与表达分析
被引量：3
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作者
葛甜甜
王楠
高静
张岗
颜永刚
沈雨璇
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机构
陕西中医药大学药学院/陕西省中医药管理局秦药研发重点实验室
陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育)
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出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期398-409,共12页
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基金
国家自然科学基金(31600320)
陕西省社会发展科技攻关项目(2018SF-338)
陕西中医药大学学科创新团队项目(2019-QN01)。
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文摘
WUSCHEL-related homeobox(WOX)转录因子是植物特有的转录因子,具有调控植物生长发育和非生物胁迫响应的作用。该研究通过生物信息学的方法对GuWOX基因家族进行分析,并利用qRT-PCR方法检测该基因家族在不同组织和非生物胁迫下的表达情况,利用RT-PCR方法克隆得到4个GuWOX基因。结果显示,(1)GuWOX基因家族共有16个成员,均含有保守的HD,为亲水性不稳定蛋白质;系统进化分析表明,GuWOX基因家族分为3个进化支(远古支、中间支和现代支);启动子序列中包括响应多种逆境和激素的顺式作用元件。(2)qRT-PCR结果显示,在侧根中GuWOX1的表达量最高,在茎中GuWOX15的表达量最高;GuWOX在盐、无磷和GA_(3)处理后不同时间段都有表达;干旱和ABA处理GuWOX15的表达模式相近,且在处理12 h时均上调表达。(3)成功克隆得到GuWOX1、GuWOX5、GuWOX6、GuWOX12基因,其长度分别为557 bp、707 bp、716 bp和578 bp,分别编码184、237、237和191个氨基酸。该研究结果表明,GuWOX基因参与甘草发育、对逆境胁迫的响应以及植物激素调节,为进一步分析GuWOX基因功能奠定了基础。
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关键词
WOX转录因子
生物信息学
实时荧光定量
基因克隆
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Keywords
WOX transcription factor
bioinformatics
qRT-PCR
gene cloning
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分类号
Q319.3
[生物学—遗传学]
Q786
[生物学—分子生物学]
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