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基于转录组测序技术研究高原低氧对小鼠脾脏组织的影响
被引量：
5
1
作者
李慧倩
胡英
+3 位作者
许玉珍
李积东
郭玉静
永胜
(
指导
)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期11-17,共7页
目的:利用转录组学测序技术探究免疫系统在高原低氧胁迫适应过程中相关基因的表达及响应的分子机制。方法:本研究在高、低海拔环境分别饲养C57BL/6小鼠30 d,取脾脏组织利用RNA-Seq进行转录组测序,将得到的差异基因(DEGs)进行GO和KEGG富...
目的:利用转录组学测序技术探究免疫系统在高原低氧胁迫适应过程中相关基因的表达及响应的分子机制。方法:本研究在高、低海拔环境分别饲养C57BL/6小鼠30 d,取脾脏组织利用RNA-Seq进行转录组测序,将得到的差异基因(DEGs)进行GO和KEGG富集分析,并通过荧光定量PCR验证测序数据的准确性。结果:与平原常氧组相比,共富集到4218个DEGs(P<0.05)。其中,ANXA1、S100A8、S100A9和HSPB1等基因显著富集;GO结果表明DEGs主要富集于B细胞激活、免疫球蛋白复合体和抗原结合分类,且JAK-STAT及NOD样受体信号通路为显著富集通路。结论:免疫系统响应高原低氧胁迫的转录调控分子可能致使机体内部免疫调节和炎症反应失衡,为相关高原病的病因学探究提供了新的理论依据。
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关键词
高原低氧
免疫系统
脾脏
转录组学测序
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职称材料
题名
基于转录组测序技术研究高原低氧对小鼠脾脏组织的影响
被引量：
5
1
作者
李慧倩
胡英
许玉珍
李积东
郭玉静
永胜
(
指导
)
机构
青海大学医学院
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期11-17,共7页
基金
国家自然科学基金项目(82060295)
青海省应用基础研究计划项目(2019-ZJ-7059)。
文摘
目的:利用转录组学测序技术探究免疫系统在高原低氧胁迫适应过程中相关基因的表达及响应的分子机制。方法:本研究在高、低海拔环境分别饲养C57BL/6小鼠30 d,取脾脏组织利用RNA-Seq进行转录组测序,将得到的差异基因(DEGs)进行GO和KEGG富集分析,并通过荧光定量PCR验证测序数据的准确性。结果:与平原常氧组相比,共富集到4218个DEGs(P<0.05)。其中,ANXA1、S100A8、S100A9和HSPB1等基因显著富集;GO结果表明DEGs主要富集于B细胞激活、免疫球蛋白复合体和抗原结合分类,且JAK-STAT及NOD样受体信号通路为显著富集通路。结论:免疫系统响应高原低氧胁迫的转录调控分子可能致使机体内部免疫调节和炎症反应失衡,为相关高原病的病因学探究提供了新的理论依据。
关键词
高原低氧
免疫系统
脾脏
转录组学测序
Keywords
Plateau hypoxia
Immune system
Spleen
Transcriptome sequencing
分类号
R318.04 [医药卫生—生物医学工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序技术研究高原低氧对小鼠脾脏组织的影响
李慧倩
胡英
许玉珍
李积东
郭玉静
永胜
(
指导
)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
5
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