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基于线粒体ND2与ND4基因探讨4种绵羊的系统发生关系
被引量：
1
1
作者
胡峻
陈天莹
+3 位作者
李孟纯
段嘉宝
李铀
杨具田
《湖南农业科学》
2022年第2期1-4,9,共5页
对甘肃地区兰州大尾羊(Lanzhou fat tailed sheep)、滩羊(Tan sheep)、小尾羊(Small tailed han sheep)和藏羊(Tibetan sheep)的线粒体ND2和ND4基因进行扩增,利用生物信息学软件将扩增得到的序列与GenBank上下载的其他20个绵羊品种的ND2...
对甘肃地区兰州大尾羊(Lanzhou fat tailed sheep)、滩羊(Tan sheep)、小尾羊(Small tailed han sheep)和藏羊(Tibetan sheep)的线粒体ND2和ND4基因进行扩增,利用生物信息学软件将扩增得到的序列与GenBank上下载的其他20个绵羊品种的ND2和ND4基因序列进行比对,再采用MEGA-X软件用邻接法(Neighbor-joining,NJ)和最大似然法(Maximum Likelihood,ML)分别构建NJ树与ML树,探讨不同绵羊种群之间的系统发生关系。结果表明:甘肃地区4种绵羊与国内外绵羊均有不同程度的亲缘关系;在NJ树中所有样本(除外群)聚为1大支,进而再分为2小支,其中2小支中大尾羊、滩羊、小尾羊和藏羊样本均有分布;而在ML树中所有样本(除外群)均聚为1支且并无分支;说明试验所选4种绵羊与这20个绵羊品种有较近的亲缘关系,也说明所采集到绵羊样本有可能与这20个亲缘关系较近的品种存在基因流。
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关键词
绵羊种群
线粒体DNA
系统发生关系
甘肃
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职称材料
基于核基因和微卫星的叶城沙蜥遗传多样性分析
被引量：
2
2
作者
谢慧
蒋罗雪
+5 位作者
赵伟
祁玥
段嘉宝
李孟纯
刘筱烨
李铀
《安徽农业科学》
CAS
2023年第6期81-87,共7页
为了研究我国特有物种叶城沙蜥(Phrynocephalus axillaris)的遗传多样性,采用微卫星和核基因分子标记方法,对新疆7个地区所采集的96只叶城沙蜥进行了遗传多样性分析。基于对6个微卫星位点和核基因BDNF的PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳检测,利...
为了研究我国特有物种叶城沙蜥(Phrynocephalus axillaris)的遗传多样性,采用微卫星和核基因分子标记方法,对新疆7个地区所采集的96只叶城沙蜥进行了遗传多样性分析。基于对6个微卫星位点和核基因BDNF的PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳检测,利用软件进行分析,结果表明群体单倍型多样性为0.707和平均核酸多样性为0.003 14,观察到的杂合度平均值和预期杂合度平均值分别为0.52和0.65,总Fst值为0.175,发现试验研究所采集的叶城沙蜥群体存在明显的遗传差异及种群间存在较大的遗传分化。综合分析说明采集的叶城沙蜥群群体间遗传交流水平低,存在较高程度的遗传分化,但由于样本较少仍需对叶城沙蜥种群遗传特征进一步研究。补充和丰富了新疆部分地区叶城沙蜥的基础遗传数据,为后续合理利用及保护该地区内其他物种的种质资源奠定了基础。
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关键词
叶城沙蜥
微卫星
脑源性神经营养因子(BDNF)
遗传
种群
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职称材料
题名
基于线粒体ND2与ND4基因探讨4种绵羊的系统发生关系
被引量：
1
1
作者
胡峻
陈天莹
李孟纯
段嘉宝
李铀
杨具田
机构
西北民族大学生命科学与工程学院
西北民族大学生物医学研究中心
出处
《湖南农业科学》
2022年第2期1-4,9,共5页
基金
西北民族大学本科生科研创新项目(XBMU21115)
西北民族大学,中央高校基本科研业务费项目(31920200004)
+1 种基金
甘肃省教育厅高等学校创新能力提升项目(2020B-065)
甘肃省科技计划项目(18JR2JA004)。
文摘
对甘肃地区兰州大尾羊(Lanzhou fat tailed sheep)、滩羊(Tan sheep)、小尾羊(Small tailed han sheep)和藏羊(Tibetan sheep)的线粒体ND2和ND4基因进行扩增,利用生物信息学软件将扩增得到的序列与GenBank上下载的其他20个绵羊品种的ND2和ND4基因序列进行比对,再采用MEGA-X软件用邻接法(Neighbor-joining,NJ)和最大似然法(Maximum Likelihood,ML)分别构建NJ树与ML树,探讨不同绵羊种群之间的系统发生关系。结果表明:甘肃地区4种绵羊与国内外绵羊均有不同程度的亲缘关系;在NJ树中所有样本(除外群)聚为1大支,进而再分为2小支,其中2小支中大尾羊、滩羊、小尾羊和藏羊样本均有分布;而在ML树中所有样本(除外群)均聚为1支且并无分支;说明试验所选4种绵羊与这20个绵羊品种有较近的亲缘关系,也说明所采集到绵羊样本有可能与这20个亲缘关系较近的品种存在基因流。
关键词
绵羊种群
线粒体DNA
系统发生关系
甘肃
Keywords
sheep population
mtDNA
phylogenetic relationship
Gansu
分类号
Q347 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
基于核基因和微卫星的叶城沙蜥遗传多样性分析
被引量：
2
2
作者
谢慧
蒋罗雪
赵伟
祁玥
段嘉宝
李孟纯
刘筱烨
李铀
机构
西北民族大学生命科学与工程学院
兰州大学生命科学学院甘肃省环境生物监测与修复重点实验室
西北民族大学生物医学研究中心/甘肃省动物细胞技术创新中心
出处
《安徽农业科学》
CAS
2023年第6期81-87,共7页
基金
国家自然科学基金地区科学基金项目(32060311)
甘肃省自然科学基金项目(20JR10RA124)
+1 种基金
西北民族大学中央高校基本科研业务费项目(31920210143,31920200004,31920190083)
西北民族大学研究生科研创新项目(Yxm2021076)。
文摘
为了研究我国特有物种叶城沙蜥(Phrynocephalus axillaris)的遗传多样性,采用微卫星和核基因分子标记方法,对新疆7个地区所采集的96只叶城沙蜥进行了遗传多样性分析。基于对6个微卫星位点和核基因BDNF的PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳检测,利用软件进行分析,结果表明群体单倍型多样性为0.707和平均核酸多样性为0.003 14,观察到的杂合度平均值和预期杂合度平均值分别为0.52和0.65,总Fst值为0.175,发现试验研究所采集的叶城沙蜥群体存在明显的遗传差异及种群间存在较大的遗传分化。综合分析说明采集的叶城沙蜥群群体间遗传交流水平低,存在较高程度的遗传分化,但由于样本较少仍需对叶城沙蜥种群遗传特征进一步研究。补充和丰富了新疆部分地区叶城沙蜥的基础遗传数据,为后续合理利用及保护该地区内其他物种的种质资源奠定了基础。
关键词
叶城沙蜥
微卫星
脑源性神经营养因子(BDNF)
遗传
种群
Keywords
Phrynocephalus axillaris
SSR
BDNF
Heredity
Populations
分类号
Q953 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体ND2与ND4基因探讨4种绵羊的系统发生关系
胡峻
陈天莹
李孟纯
段嘉宝
李铀
杨具田
《湖南农业科学》
2022
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于核基因和微卫星的叶城沙蜥遗传多样性分析
谢慧
蒋罗雪
赵伟
祁玥
段嘉宝
李孟纯
刘筱烨
李铀
《安徽农业科学》
CAS
2023
2
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职称材料
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