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心肌成纤维细胞来源的外泌体miRNA参与放射性心肌纤维化损伤
被引量：
3
1
作者
段依璠
顾静
+2 位作者
舒亚妃
韩晓斐
梁乾坤
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期108-120,共13页
外泌体及携带的miRNA在组织器官纤维化中发挥重要作用,但相关于其在放射性心肌纤维化(RICF)的研究十分有限,本研究拟运用生物信息学分析辐射诱导的外泌体miRNA通过辐射旁效应促进RICF发生的可能分子机制。心肌成纤维细胞(CFs)是RICF的...
外泌体及携带的miRNA在组织器官纤维化中发挥重要作用,但相关于其在放射性心肌纤维化(RICF)的研究十分有限,本研究拟运用生物信息学分析辐射诱导的外泌体miRNA通过辐射旁效应促进RICF发生的可能分子机制。心肌成纤维细胞(CFs)是RICF的主要效应细胞,用2 Gy X射线辐照CFs后超速离心提取辐射诱导的外泌体(X-exo)和未受照射的CFs外泌体(Exo),并进行外泌体电镜观察、NTA浓度检测和CD9、CD63、CD81等外泌体表面标志蛋白质的纳米流式鉴定;随后通过RNA-seq技术检测外泌体miRNA表达谱,筛选差异表达的miRNA,预测其潜在靶基因并进行富集分析。结果显示:与未受照射的CFs外泌体相比,X射线诱导的外泌体中表达上调的miRNAs共9个(|log_(2) Fold Change|>1,P<0.05),其中|log_(2) Fold Change|>2的有8个,表达下调的miRNAs共19个(|log_(2) Fold Change|>1,P<0.05),其中|log_(2) Fold Change|>2的有12个。使用targetScan、miRWalk、miRNADB预测差异miRNA的靶基因,并进行GO及KEGG富集分析。GO富集结果显示,差异表达的miRNA调控的靶基因主要参与蛋白质磷酸化、细胞信号转导等生物学过程,富集于细胞质和细胞膜等细胞组分,发挥蛋白激酶绑定和蛋白质结合等分子功能。KEGG富集结果显示,差异表达miRNAs的靶基因主要富集于PI3K-Akt、MAPK、mTOR、ECM-receptor interaction、cAMP、Wnt、TGF-β、Notch等相关通路。对本研究富集到的信号通路进行文献梳理,表明差异表达的外泌体miRNA可能通过调节靶基因及相关信号通路促进RICF的发生发展。因MAPK、PI3k-Akt、mTOR等信号通路的活化调节主要依靠关键分子的磷酸化,并非主要依靠转录水平的调控,所以未来在探讨“外泌体miRNA通过辐射旁效应参与RICF”的机制研究中,应该着重关注ECM、cAMP、TGF-β、Wnt、Notch、Ras、Rap1等信号通路。
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关键词
放射性心肌纤维化
心肌成纤维细胞
外泌体
微RNA
生物信息学分析
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职称材料
髓系肿瘤遗传易感基因在骨髓增殖性肿瘤中的临床价值
被引量：
1
2
作者
高杉
段依璠
+3 位作者
张宇卉
滕广帅
杜晨霄
白洁
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1119-1124,共6页
目的:探讨髓系肿瘤遗传易感基因对骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者临床特征的影响。方法:收集2017年9月至2021年12月就诊于天津医科大学第二医院的232例MPN患者,通过靶向二代测序技术检测髓系肿瘤相关基因,并进行胚系验证,分析携带髓系肿瘤遗...
目的:探讨髓系肿瘤遗传易感基因对骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者临床特征的影响。方法:收集2017年9月至2021年12月就诊于天津医科大学第二医院的232例MPN患者,通过靶向二代测序技术检测髓系肿瘤相关基因,并进行胚系验证,分析携带髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变MPN患者的临床特征及生存。结果:MPN患者髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变携带率为21.6%(50/232),携带髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变的PV、ET、PMF患者分别为25/114(21.9%)例、8/69(11.6%)例、17/49(34.7%)例,其中PMF患者携带率最高(P=0.01),且年龄较大(P=0.02)。携带髓系肿瘤遗传易感基因组的MPN患者较未携带组染色体异常发生率高(26.5%vs 11.8%,P=0.05)。MPN患者髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变主要集中在RAS通路,且携带RAS通路相关髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变的患者无AML进展生存期较未携带组更短(P<0.001)。携带CBL、TP53胚系突变的MPN患者总生存期较未携带者更短(P=0.001;P=0.043)。结论:MPN中PMF患者更易携带髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变;携带髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变的MPN患者易发生染色体异常;集中于RAS途径的髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变的MPN患者更易进展为AML;CBL、TP53胚系突变影响MPN患者的总生存。
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关键词
遗传易感基因
骨髓增殖性肿瘤
疾病进展
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职称材料
题名
心肌成纤维细胞来源的外泌体miRNA参与放射性心肌纤维化损伤
被引量：
3
1
作者
段依璠
顾静
舒亚妃
韩晓斐
梁乾坤
机构
甘肃中医药大学基础医学院
天津医科大学第二医院血液内科
甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究省级重点实验室
甘肃省中医方药挖掘与创新转化重点实验室
甘肃省中医药防治慢性疾病重点实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期108-120,共13页
基金
甘肃省“双一流”科研重点项目(No.GSSYLXM-05)
甘肃省中医药管理局重点项目“甘肃省中医药科研课题”(No.GZKZ-2020-10)
+2 种基金
甘肃省教育科技创新项目“青年博士基金”(No.2022QB-094)
甘肃省自然科学基金(No.21JR1RA262)
甘肃省中医药研究中心“中医方药挖掘与创新转化重点实验室”开放课题(No.ZYFY-2020-006)。
文摘
外泌体及携带的miRNA在组织器官纤维化中发挥重要作用,但相关于其在放射性心肌纤维化(RICF)的研究十分有限,本研究拟运用生物信息学分析辐射诱导的外泌体miRNA通过辐射旁效应促进RICF发生的可能分子机制。心肌成纤维细胞(CFs)是RICF的主要效应细胞,用2 Gy X射线辐照CFs后超速离心提取辐射诱导的外泌体(X-exo)和未受照射的CFs外泌体(Exo),并进行外泌体电镜观察、NTA浓度检测和CD9、CD63、CD81等外泌体表面标志蛋白质的纳米流式鉴定;随后通过RNA-seq技术检测外泌体miRNA表达谱,筛选差异表达的miRNA,预测其潜在靶基因并进行富集分析。结果显示:与未受照射的CFs外泌体相比,X射线诱导的外泌体中表达上调的miRNAs共9个(|log_(2) Fold Change|>1,P<0.05),其中|log_(2) Fold Change|>2的有8个,表达下调的miRNAs共19个(|log_(2) Fold Change|>1,P<0.05),其中|log_(2) Fold Change|>2的有12个。使用targetScan、miRWalk、miRNADB预测差异miRNA的靶基因,并进行GO及KEGG富集分析。GO富集结果显示,差异表达的miRNA调控的靶基因主要参与蛋白质磷酸化、细胞信号转导等生物学过程,富集于细胞质和细胞膜等细胞组分,发挥蛋白激酶绑定和蛋白质结合等分子功能。KEGG富集结果显示,差异表达miRNAs的靶基因主要富集于PI3K-Akt、MAPK、mTOR、ECM-receptor interaction、cAMP、Wnt、TGF-β、Notch等相关通路。对本研究富集到的信号通路进行文献梳理,表明差异表达的外泌体miRNA可能通过调节靶基因及相关信号通路促进RICF的发生发展。因MAPK、PI3k-Akt、mTOR等信号通路的活化调节主要依靠关键分子的磷酸化,并非主要依靠转录水平的调控,所以未来在探讨“外泌体miRNA通过辐射旁效应参与RICF”的机制研究中,应该着重关注ECM、cAMP、TGF-β、Wnt、Notch、Ras、Rap1等信号通路。
关键词
放射性心肌纤维化
心肌成纤维细胞
外泌体
微RNA
生物信息学分析
Keywords
radiation-induced cardiac fibrosis(RICF)
cardiac fibroblasts(CF)
exosomes
microRNA(miRNA)
bioinformatics analysis
分类号
Q28 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
髓系肿瘤遗传易感基因在骨髓增殖性肿瘤中的临床价值
被引量：
1
2
作者
高杉
段依璠
张宇卉
滕广帅
杜晨霄
白洁
机构
天津医科大学第二医院血液科
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1119-1124,共6页
基金
天津市教委科研计划项目(自然科学)(2022ZD072,2022KJ253)。
文摘
目的:探讨髓系肿瘤遗传易感基因对骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者临床特征的影响。方法:收集2017年9月至2021年12月就诊于天津医科大学第二医院的232例MPN患者,通过靶向二代测序技术检测髓系肿瘤相关基因,并进行胚系验证,分析携带髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变MPN患者的临床特征及生存。结果:MPN患者髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变携带率为21.6%(50/232),携带髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变的PV、ET、PMF患者分别为25/114(21.9%)例、8/69(11.6%)例、17/49(34.7%)例,其中PMF患者携带率最高(P=0.01),且年龄较大(P=0.02)。携带髓系肿瘤遗传易感基因组的MPN患者较未携带组染色体异常发生率高(26.5%vs 11.8%,P=0.05)。MPN患者髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变主要集中在RAS通路,且携带RAS通路相关髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变的患者无AML进展生存期较未携带组更短(P<0.001)。携带CBL、TP53胚系突变的MPN患者总生存期较未携带者更短(P=0.001;P=0.043)。结论:MPN中PMF患者更易携带髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变;携带髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变的MPN患者易发生染色体异常;集中于RAS途径的髓系肿瘤遗传易感基因胚系突变的MPN患者更易进展为AML;CBL、TP53胚系突变影响MPN患者的总生存。
关键词
遗传易感基因
骨髓增殖性肿瘤
疾病进展
Keywords
inheritance of susceptibility genes
myeloproliferative neoplasm
disease progression
分类号
R733.3 [医药卫生—肿瘤]
R551.3 [医药卫生—血液循环系统疾病]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
心肌成纤维细胞来源的外泌体miRNA参与放射性心肌纤维化损伤
段依璠
顾静
舒亚妃
韩晓斐
梁乾坤
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
髓系肿瘤遗传易感基因在骨髓增殖性肿瘤中的临床价值
高杉
段依璠
张宇卉
滕广帅
杜晨霄
白洁
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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