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脂肪酸代谢相关基因预后模型在肾透明细胞癌中的应用 被引量:1
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作者 段万里 邓骞 +2 位作者 任伟 程永毅 孙羿 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期684-690,共7页
目的 探索基于脂肪酸代谢相关基因的预后模型在肾透明细胞癌患者中应用的可行性。方法 下载TCGA数据库中肾透明细胞癌组织及癌旁组织mRNA表达矩阵,R语言筛选差异表达的脂肪酸代谢相关基因,结合患者生存数据,利用多元Cox比例风险回归模... 目的 探索基于脂肪酸代谢相关基因的预后模型在肾透明细胞癌患者中应用的可行性。方法 下载TCGA数据库中肾透明细胞癌组织及癌旁组织mRNA表达矩阵,R语言筛选差异表达的脂肪酸代谢相关基因,结合患者生存数据,利用多元Cox比例风险回归模型建立脂肪酸代谢相关多基因预后模型,计算患者的风险评分(risk score, RS),按RS的中位数将患者分为高、低风险组,利用Kaplan-Meier生存曲线分析高、低风险组之间患者的生存差异。将RS与临床病理因素纳入Cox回归分析,验证RS是否为影响患者生存的独立危险因素。受试者工作特征(ROC)曲线评估基于脂肪酸代谢相关基因的预测模型的准确性。比较RS及其相关基因在各临床病理因素分组中的差异。GSEA富集分析比较筛选高、低风险组中的KEGG差异基因集。结果 共筛选出4个差异基因(CPT1B、HADH、CYP4A11、ACADSB)建立肾癌脂肪酸代谢相关基因预后模型。预后风险评分(RS)公式为:RS=0.490×CPT1B-0.428×HADH-0.11×CYP4A11-0.372×ACADSB。低风险组的患者预后较好(P<0.001)。RS是影响肾透明细胞癌患者预后的独立危险因素(P<0.01)。基于肾透明细胞癌脂肪酸代谢相关基因模型计算的RS的5年生存ROC曲线AUC为0.802。GSEA分析筛选出在低风险组81个差异基因(FDR<0.25,normalizedP<0.05)。结论 肾癌脂肪酸代谢相关多基因预后模型能够比较准确预测肾透明细胞癌患者的预后。 展开更多
关键词 肾细胞癌 预后 脂肪酸代谢基因 TCGA数据库 COX比例风险回归模型
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HPLC法测定淫羊藿中木兰花碱、朝藿定C和淫羊藿苷的含量 被引量:5
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作者 翟宇瑶 段万里 郭宝林 《西部中医药》 2019年第7期34-36,共3页
目的:建立同时测定淫羊藿中木兰花碱、朝藿定C和淫羊藿苷含量的HPLC方法,研究淫羊藿(Epimedium brevicornu Maxim.)因产地不同带来的质量差异。方法:Venusil C18 MP色谱柱(250 mm×4.6 mm,5μm),乙腈-1%KH2PO4梯度洗脱;流速1 mL/mi... 目的:建立同时测定淫羊藿中木兰花碱、朝藿定C和淫羊藿苷含量的HPLC方法,研究淫羊藿(Epimedium brevicornu Maxim.)因产地不同带来的质量差异。方法:Venusil C18 MP色谱柱(250 mm×4.6 mm,5μm),乙腈-1%KH2PO4梯度洗脱;流速1 mL/min。结果:木兰花碱、朝藿定C和淫羊藿苷分别在4.0~52.0,6.4~206.0,7.0~242.0μg/mL范围内线性关系良好;回收率分别为97.66%、101.10%、96.76%,RSD分别为2.14%、2.20%、1.58%。结论:本方法适用于同时测定淫羊藿中生物碱和黄酮两种不同类型的成分;不同分布地区淫羊藿中朝藿定C、淫羊藿苷均呈现较大的变化,木兰花碱含量变化大,不适于作为质控成分。 展开更多
关键词 淫羊藿 木兰花碱 朝藿定C 淫羊藿苷 HPLC
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基于本科生导师制的第二课堂医学科研创新实践 被引量:13
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作者 肖良 邓宇晨 +8 位作者 马超群 李松声 顾嘉伟 严振鹏 段万里 许智超 罗溪 王月帆 朱仁心 《西北医学教育》 2016年第5期661-664,共4页
大力扶持医学院校学员的专业学习与能力培养是我国培育医疗卫生人才的重要途径,其目标是培养具有创新精神和实践能力的高素质、全面发展的医学专业人才。其中,积极探索合理有效的本科学员培养模式是实现资源有效利用、保证医学人才质量... 大力扶持医学院校学员的专业学习与能力培养是我国培育医疗卫生人才的重要途径,其目标是培养具有创新精神和实践能力的高素质、全面发展的医学专业人才。其中,积极探索合理有效的本科学员培养模式是实现资源有效利用、保证医学人才质量的重中之重。本科生导师制作为一种教学育人的重要模式,已被我国大多数医学院广泛采用并取得了良好的效果。在此基础上,通过大学生创新基金和第二课堂科技论文报告会为导向的医学本科学员第二课堂科研创新实践体制,建立学员与教员互进合作的科研关系,可以有效推动本科生导师制的发展,对提升医学本科学员的培养质量和科技创新能力具有非常重要的现实意义。 展开更多
关键词 医学 本科生导师制 第二课堂 科研创新
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医学本科生科研创新实践活动的“材”与“教” 被引量:7
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作者 马超群 王月帆 +11 位作者 李松声 邓宇晨 顾嘉伟 罗溪 严振鹏 段万里 许智超 徐拯 马骞 张倩 鞠金涛 肖良 《西北医学教育》 2016年第5期684-688,共5页
当今医疗科学事业的迅猛发展对医学院校人才培养提出了更高的要求,以本科生导师制为基础、以大学生创新能力培养计划和本科生科技论文报告会等第二课堂活动为导向的科研创新实践体制,是经过长期探索得到的提升医学本科学员科技创新能力... 当今医疗科学事业的迅猛发展对医学院校人才培养提出了更高的要求,以本科生导师制为基础、以大学生创新能力培养计划和本科生科技论文报告会等第二课堂活动为导向的科研创新实践体制,是经过长期探索得到的提升医学本科学员科技创新能力的有效途径。然而,在基于导师制开展本科生第二课堂科研创新实践的过程中,本科学员能力发展贪多求全、兴趣导向动力不足等问题逐渐凸显,不同学员开展第二课堂的感受与收获各有差异。对不同学员开展医学科研创新实践的过程进行观察分析,针对不同类型学员心理特征和能力特长制定不同的科研入门培养方案,通过因"材"施"教"、团队合作竞争,充分发挥本科学员的主观能动性,有效提高本科学员的科研素质和创新热情,将对第二课堂医学科研创新实践活动的合理优化具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 医学 本科生导师制 第二课堂 科研创新
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活血化瘀类中药注射剂临床应用合理性分析 被引量:12
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作者 翟宇瑶 段万里 +3 位作者 胡斌 薛小荣 王静 闵慧 《西部中医药》 2021年第5期112-115,共4页
目的:分析某医院活血化瘀类中药注射剂的应用状况,为临床合理用药提供参考。方法:抽取某医院2018年1~12月期间使用活血化瘀类中药注射剂住院患者病历,对活血化瘀类中药注射剂的临床应用进行分析。结果:765份病历中活血化瘀类中药注射剂... 目的:分析某医院活血化瘀类中药注射剂的应用状况,为临床合理用药提供参考。方法:抽取某医院2018年1~12月期间使用活血化瘀类中药注射剂住院患者病历,对活血化瘀类中药注射剂的临床应用进行分析。结果:765份病历中活血化瘀类中药注射剂不合理现象包括:联用未冲管占59.87%(458/765)、适应症不合理占21.44%(164/765)、配伍禁忌占10.72%(82/765)、超疗程用药占7.45%(57/765)、重复用药占5.62%(43/765)、溶媒选择错误占3.14%(24/765)。结论:该院活血化瘀类中药注射剂临床应用有待进一步提高,应在中医药理论指导下使用,以确保临床合理用药。 展开更多
关键词 活血化瘀 中药注射剂 合理性分析 联合用药
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基于网络药理学和生物信息学的姜黄素抑制肾透明细胞癌增殖的机制研究 被引量:2
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作者 段万里 翟宇瑶 +4 位作者 潘思源 杨海燕 程永毅 孙羿 邓骞 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期278-285,共8页
目的通过网络药理学和生物信息学挖掘并验证姜黄素抑制肾透明细胞癌增殖的作用机制。方法从PharmMapper、GeneCards数据库筛选肾透明细胞癌和姜黄素共同靶点基因;应用TCGA数据库数据分析筛选出在肾透明细胞癌组织样本和正常组织样本中... 目的通过网络药理学和生物信息学挖掘并验证姜黄素抑制肾透明细胞癌增殖的作用机制。方法从PharmMapper、GeneCards数据库筛选肾透明细胞癌和姜黄素共同靶点基因;应用TCGA数据库数据分析筛选出在肾透明细胞癌组织样本和正常组织样本中的差异表达并影响预后的共同靶点基因;利用STRING平台构建姜黄素-肾透明细胞癌靶点交互网络(protein-protein interaction,PPI);利用R软件对上述筛选靶点蛋白进行GO生物过程分析及KEGG通路富集分析;姜黄素和(或)活性氧抑制剂N-乙酰基-L-半胱氨酸(N-acetyl-L-cysteine,NAC)作用于肾癌786-O、ACHN细胞后,通过CCK8检测不同浓度姜黄素对细胞增殖及细胞活力影响,通过活性氧检测试剂盒(2′,7′-dichlorodihydrofluorescein diacetate,DCFH-DA)检测细胞内活性氧水平,丙二醛(malondialdehyde,MDA)测定试剂盒测定细胞内MDA变化。结果PharmMapper网站及GeneCards数据库筛选出姜黄素和肾癌共同靶点109个;TCGA数据库数据分析筛选出37个差异基因可能影响患者的总体生存期;PPI筛选出姜黄素抑制肾透明细胞癌生物学行为的核心靶标蛋白主要涉及CASP3、EGFR、CHEK1、HSP90AA1、AR等。GO富集分析确定213个条目,主要包括活性氧代谢过程、对类固醇激素的反应、纤维蛋白溶解等生物活性过程;KEGG富集分析确定24个条目,主要涉及丙酮酸代谢、糖酵解/糖异生、FoxO信号通路、大肠癌、酪氨酸代谢、IL-17信号通路、细胞凋亡等信号通路;姜黄素以时间和剂量依赖性方式降低了786-O、ACHN的细胞活力(P<0.05);姜黄素处理肾癌细胞后活性氧水平及MDA水平显著升高(P<0.05);加入NAC后逆转了姜黄素对786-O和ACHN细胞的细胞活力影响(P<0.05)。结论姜黄素可能参与氧化应激途径抑制肾细胞癌的增殖。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 姜黄素 氧化应激 增殖 网络药理学 生物信息学
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