目的:探讨肠道微生物与乳房恶性肿瘤之间的因果关系,并通过孟德尔随机化(MR)分析确定特定因果微生物分类群。方法:对有关肠道微生物群和乳房恶性肿瘤的全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据,MiBioGen研究GWAS(N=18473)作为暴露样本,IEU O...目的:探讨肠道微生物与乳房恶性肿瘤之间的因果关系,并通过孟德尔随机化(MR)分析确定特定因果微生物分类群。方法:对有关肠道微生物群和乳房恶性肿瘤的全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据,MiBioGen研究GWAS(N=18473)作为暴露样本,IEU Open GWAS数据库中乳房恶性肿瘤的GWAS(N=123579)作为结果样本。采用逆方差加权(IVW)、加权中位数和MR-Egger方法分析MR统计结果。结果:巴斯德菌目(Pasteurellales)丰度的升高会增加乳房恶性肿瘤患病风险(IVW PFDR<0.05,OR=1.21,95%CI:1.07~1.36),水平基因多效性和异质性检测验证不会对因果关系产生影响,留一法敏感性分析表明,已确定的因果关联不是由任何单个工具变量驱动的,因果关系为正向。结论:肠道中巴斯德菌目丰度升高可能会增加乳房恶性肿瘤的发生风险。展开更多
目的:基于网络药理学和分子对接预测黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicines systems pharmacology platform,TCMSP)、BATM-TCM数据库等筛选黄芪补肾活血汤主要...目的:基于网络药理学和分子对接预测黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicines systems pharmacology platform,TCMSP)、BATM-TCM数据库等筛选黄芪补肾活血汤主要活性成分以及相关靶点,通过Gene Cards数据库搜索乳腺癌相关基因并进行筛选,将黄芪补肾活血汤靶点与乳腺癌基因进行映射,利用Cytoscape 3.8.2软件构建中药-成分-靶点可视化网络,绘制蛋白互作网络及进行基因本体(gene ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,筛选出核心基因。将黄芪补肾活血汤复方成分与关键靶点通过Swiss Dock网站进行分子对接验证。结果:黄芪补肾活血汤有效成分136个,潜在治疗靶点828个,其中76个是黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的潜在靶点。在蛋白互作网络中发现TP53、VEGFA、MAPK8、JUN、EGF等可能是黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的关键靶点。通过GO、KEGG富集分析发现作用机制涉及的通路包括PI3K-Akt信号通路、肿瘤中的microRNAs、RNA聚合酶Ⅱ转录因子复合物肌膜、转录因子结合、G蛋白偶联胺受体活性、血红素结合、蛋白质结构域特异性结合、核受体活性、癌症中的转录调控异常、血管内皮生长因子信号通路等。通过分子对接验证显示,化合物槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素、植物甾醇与关键靶点PGR、ADRB2、NR3C2、PREE1、SCN5A具有较好的结合能力。结论:通过网络药理学构建“药物-成分-靶点-信号通路”网络及分子对接技术验证,发现黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌主要是通过抗癌、抑制雌激素受体的表达、调节免疫等多通路、多靶点实现的,为临床治疗乳腺癌提供了更多的治疗方法,给临床用药提供了更多的选择。展开更多
文摘目的:探讨肠道微生物与乳房恶性肿瘤之间的因果关系,并通过孟德尔随机化(MR)分析确定特定因果微生物分类群。方法:对有关肠道微生物群和乳房恶性肿瘤的全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据,MiBioGen研究GWAS(N=18473)作为暴露样本,IEU Open GWAS数据库中乳房恶性肿瘤的GWAS(N=123579)作为结果样本。采用逆方差加权(IVW)、加权中位数和MR-Egger方法分析MR统计结果。结果:巴斯德菌目(Pasteurellales)丰度的升高会增加乳房恶性肿瘤患病风险(IVW PFDR<0.05,OR=1.21,95%CI:1.07~1.36),水平基因多效性和异质性检测验证不会对因果关系产生影响,留一法敏感性分析表明,已确定的因果关联不是由任何单个工具变量驱动的,因果关系为正向。结论:肠道中巴斯德菌目丰度升高可能会增加乳房恶性肿瘤的发生风险。
文摘目的:基于网络药理学和分子对接预测黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicines systems pharmacology platform,TCMSP)、BATM-TCM数据库等筛选黄芪补肾活血汤主要活性成分以及相关靶点,通过Gene Cards数据库搜索乳腺癌相关基因并进行筛选,将黄芪补肾活血汤靶点与乳腺癌基因进行映射,利用Cytoscape 3.8.2软件构建中药-成分-靶点可视化网络,绘制蛋白互作网络及进行基因本体(gene ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,筛选出核心基因。将黄芪补肾活血汤复方成分与关键靶点通过Swiss Dock网站进行分子对接验证。结果:黄芪补肾活血汤有效成分136个,潜在治疗靶点828个,其中76个是黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的潜在靶点。在蛋白互作网络中发现TP53、VEGFA、MAPK8、JUN、EGF等可能是黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的关键靶点。通过GO、KEGG富集分析发现作用机制涉及的通路包括PI3K-Akt信号通路、肿瘤中的microRNAs、RNA聚合酶Ⅱ转录因子复合物肌膜、转录因子结合、G蛋白偶联胺受体活性、血红素结合、蛋白质结构域特异性结合、核受体活性、癌症中的转录调控异常、血管内皮生长因子信号通路等。通过分子对接验证显示,化合物槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素、植物甾醇与关键靶点PGR、ADRB2、NR3C2、PREE1、SCN5A具有较好的结合能力。结论:通过网络药理学构建“药物-成分-靶点-信号通路”网络及分子对接技术验证,发现黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌主要是通过抗癌、抑制雌激素受体的表达、调节免疫等多通路、多靶点实现的,为临床治疗乳腺癌提供了更多的治疗方法,给临床用药提供了更多的选择。
