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基于WGCNA和分子对接分析干姜黄芩黄连人参汤干预胃腺癌的成分及靶点
被引量：
3
1
作者
孙倩
杨美子
+2 位作者
栾继昕
李森
张帆
《中国医药导报》
CAS
2022年第3期18-23,共6页
目的基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和分子对接研究干姜黄芩黄连人参汤干预胃腺癌的成分及靶点。方法从中药系统药理学数据库与分析平台中筛选与药物相关的成分和靶点,构建药物-化合物-靶标相互作用网络。在TCGA数据库下载胃腺癌基...
目的基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和分子对接研究干姜黄芩黄连人参汤干预胃腺癌的成分及靶点。方法从中药系统药理学数据库与分析平台中筛选与药物相关的成分和靶点,构建药物-化合物-靶标相互作用网络。在TCGA数据库下载胃腺癌基因表达数据,筛选与胃腺癌风险等级相关的关键模块,利用GO和KEGG数据库分析关键模块所包含基因的生物学功能。将模块基因上传到STRING数据库筛选关键靶点,通过分子对接技术对关键靶点进行半柔性对接反向验证。结果筛选得到59个活性成分,184个靶点,药物-化合物-靶点相互作用网络得到242个节点,676条边。通过WGCNA筛选出的关键模块共包括32个基因。GO和KEGG富集的结果主要涉及DNA完整性检验点、对金属离子的反应、p53信号通路、细胞周期和细胞衰老等。筛选得到的关键靶点为VEGFA、CDK1、CCND1。通过分子对接表明槲皮素、汉黄芩素、黄芩素等化合物与关键靶点结合活性较高。结论多种活性成分可以与胃腺癌的靶点相结合起到调节作用。
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关键词
胃腺癌
网络药理学
加权基因共表达网络分析
分子对接
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职称材料
题名
基于WGCNA和分子对接分析干姜黄芩黄连人参汤干预胃腺癌的成分及靶点
被引量：
3
1
作者
孙倩
杨美子
栾继昕
李森
张帆
机构
山东省聊城市人民医院临床药学科
滨州医学院药理学教研室
山东第一医科大学研究生院
山东省聊城市人民医院内分泌科
出处
《中国医药导报》
CAS
2022年第3期18-23,共6页
基金
山东省中医药科技发展计划项目(2019-0887)。
文摘
目的基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和分子对接研究干姜黄芩黄连人参汤干预胃腺癌的成分及靶点。方法从中药系统药理学数据库与分析平台中筛选与药物相关的成分和靶点,构建药物-化合物-靶标相互作用网络。在TCGA数据库下载胃腺癌基因表达数据,筛选与胃腺癌风险等级相关的关键模块,利用GO和KEGG数据库分析关键模块所包含基因的生物学功能。将模块基因上传到STRING数据库筛选关键靶点,通过分子对接技术对关键靶点进行半柔性对接反向验证。结果筛选得到59个活性成分,184个靶点,药物-化合物-靶点相互作用网络得到242个节点,676条边。通过WGCNA筛选出的关键模块共包括32个基因。GO和KEGG富集的结果主要涉及DNA完整性检验点、对金属离子的反应、p53信号通路、细胞周期和细胞衰老等。筛选得到的关键靶点为VEGFA、CDK1、CCND1。通过分子对接表明槲皮素、汉黄芩素、黄芩素等化合物与关键靶点结合活性较高。结论多种活性成分可以与胃腺癌的靶点相结合起到调节作用。
关键词
胃腺癌
网络药理学
加权基因共表达网络分析
分子对接
Keywords
Gastric adenocarcinoma
Network pharmacology
Weighted gene co-expression network analysis
Molecular docking
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于WGCNA和分子对接分析干姜黄芩黄连人参汤干预胃腺癌的成分及靶点
孙倩
杨美子
栾继昕
李森
张帆
《中国医药导报》
CAS
2022
3
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