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2008-2022年福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征研究
1
作者
柯自立
张小玄
+5 位作者
徐海滨
高亚东
罗朝晨
黄梦颖
邱玉锋
杨劲松
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期708-715,共8页
目的了解福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征,为深入开展霍乱分子流行病学研究提供依据。方法收集2008-2022年福建省霍乱病例和带菌者来源O1群霍乱弧菌16株,肉汤稀释法检测抗生素最小抑菌浓度(MIC)。运用二代测序技术得到全基因组序列...
目的了解福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征,为深入开展霍乱分子流行病学研究提供依据。方法收集2008-2022年福建省霍乱病例和带菌者来源O1群霍乱弧菌16株,肉汤稀释法检测抗生素最小抑菌浓度(MIC)。运用二代测序技术得到全基因组序列;利用snippy、Roary、Prokka等开源软件及NCBI、BacWGSTdb等在线分析网站进行核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、核心基因组单核苷酸多态性分析(cgSNP)、毒力基因和耐药基因预测、泛基因组多样性的分析。结果福建省霍乱弧菌分为5个ST(sequence type)型别,其中新发现的ST182和ST1480型是当前我国优势克隆群ST75型的进化分支,并与2010年和2013年的台湾株高度同源。产毒株和非产毒株均不同程度地携带各种毒力因子并发生变异;预测出7大类13个耐药基因,其中黏菌素类、四环素类耐药基因携带情况与耐药表型一致。泛基因组学分析发现霍乱弧菌拥有1个开放的泛基因组,Roary聚类分析表现出比cgMLST更高的分辨率。结论福建省O1群霍乱弧菌人源株的基因组结构和功能具有多态性,新发的ST1480型克隆群具有流行潜力,需加强对此类菌株的监测。
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关键词
霍乱弧菌
全基因组测序
生物信息学分析
核心基因组多位点序列分型
泛基因组
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职称材料
不同病程帕金森病大鼠纹状体多巴胺转运蛋白的动态变化
被引量：
1
2
作者
杜越群
陈文新
+4 位作者
林志毅
伍兵
叶婧
柯自立
林玲
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期399-402,共4页
目的：观察不同病程帕金森病（PD）大鼠纹状体多巴胺转运蛋白（DAT）的动态变化，并探讨该变化与黑质酪氨酸羟化酶（TH）之间的关系。方法：采用双点注射6-OHDA至大鼠右侧黑质致密部和前脑内侧束，建立偏侧PD模型。建模后2周、4周、6周...
目的：观察不同病程帕金森病（PD）大鼠纹状体多巴胺转运蛋白（DAT）的动态变化，并探讨该变化与黑质酪氨酸羟化酶（TH）之间的关系。方法：采用双点注射6-OHDA至大鼠右侧黑质致密部和前脑内侧束，建立偏侧PD模型。建模后2周、4周、6周的PD大鼠分别尾静脉注射99mTc-TRODAT-1，1h后取左右纹状体，以1计数仪测定放射性计数，并计算单位质量的左、右放射性计数率以及左、右纹状体单位质量的放射性计数比值。同时取建模后2周、4周、6周PD大鼠黑质组织进行TH免疫染色，观察阳性细胞形态及分布。结果：PD大鼠毁损侧纹状体放射计数明显低于健侧，建模后2周、4周、6周PD大鼠DAT相对放射计数较健侧分别降低了16．8％、35．9％和50．1％（P〈0．05～0．001）；不同病程PD大鼠毁损侧纹状体DAT的相对放射计数与TH阳性细胞数呈高度的正相关（P〈0．01，R=0．9，n=15）。结论：PD大鼠纹状体DAT含量随着病程的增加逐渐减少，“Tc—PRO-DAT-1的放射性分布能够较准确的反映突触前多巴胺能神经元的变化。
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关键词
帕金森病
多巴胺转运蛋白
多巴胺
酪氨酸羟化酶
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职称材料
题名
2008-2022年福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征研究
1
作者
柯自立
张小玄
徐海滨
高亚东
罗朝晨
黄梦颖
邱玉锋
杨劲松
机构
福建省疾病预防控制中心传染病预防控制所
福建医科大学公共卫生学院
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期708-715,共8页
基金
福建省自然科学基金项目(No.2022J01399)
福建省卫生健康科技计划项目(No.2021CXA024)联合资助。
文摘
目的了解福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征,为深入开展霍乱分子流行病学研究提供依据。方法收集2008-2022年福建省霍乱病例和带菌者来源O1群霍乱弧菌16株,肉汤稀释法检测抗生素最小抑菌浓度(MIC)。运用二代测序技术得到全基因组序列;利用snippy、Roary、Prokka等开源软件及NCBI、BacWGSTdb等在线分析网站进行核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、核心基因组单核苷酸多态性分析(cgSNP)、毒力基因和耐药基因预测、泛基因组多样性的分析。结果福建省霍乱弧菌分为5个ST(sequence type)型别,其中新发现的ST182和ST1480型是当前我国优势克隆群ST75型的进化分支,并与2010年和2013年的台湾株高度同源。产毒株和非产毒株均不同程度地携带各种毒力因子并发生变异;预测出7大类13个耐药基因,其中黏菌素类、四环素类耐药基因携带情况与耐药表型一致。泛基因组学分析发现霍乱弧菌拥有1个开放的泛基因组,Roary聚类分析表现出比cgMLST更高的分辨率。结论福建省O1群霍乱弧菌人源株的基因组结构和功能具有多态性,新发的ST1480型克隆群具有流行潜力,需加强对此类菌株的监测。
关键词
霍乱弧菌
全基因组测序
生物信息学分析
核心基因组多位点序列分型
泛基因组
Keywords
Vibrio cholerae
whole genome sequencing
bioinformatics analysis
core-genome multilocus sequence typing(cgMLST)
pan-genome
分类号
R378.3 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
不同病程帕金森病大鼠纹状体多巴胺转运蛋白的动态变化
被引量：
1
2
作者
杜越群
陈文新
林志毅
伍兵
叶婧
柯自立
林玲
机构
福建医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系
福建医科大学福建省立临床学院核医学科
福建医科大学神经生物学中心
出处
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期399-402,共4页
基金
国家自然科学基金(81241047)
福建省科技计划重点项目(2012Y0031)
文摘
目的：观察不同病程帕金森病（PD）大鼠纹状体多巴胺转运蛋白（DAT）的动态变化，并探讨该变化与黑质酪氨酸羟化酶（TH）之间的关系。方法：采用双点注射6-OHDA至大鼠右侧黑质致密部和前脑内侧束，建立偏侧PD模型。建模后2周、4周、6周的PD大鼠分别尾静脉注射99mTc-TRODAT-1，1h后取左右纹状体，以1计数仪测定放射性计数，并计算单位质量的左、右放射性计数率以及左、右纹状体单位质量的放射性计数比值。同时取建模后2周、4周、6周PD大鼠黑质组织进行TH免疫染色，观察阳性细胞形态及分布。结果：PD大鼠毁损侧纹状体放射计数明显低于健侧，建模后2周、4周、6周PD大鼠DAT相对放射计数较健侧分别降低了16．8％、35．9％和50．1％（P〈0．05～0．001）；不同病程PD大鼠毁损侧纹状体DAT的相对放射计数与TH阳性细胞数呈高度的正相关（P〈0．01，R=0．9，n=15）。结论：PD大鼠纹状体DAT含量随着病程的增加逐渐减少，“Tc—PRO-DAT-1的放射性分布能够较准确的反映突触前多巴胺能神经元的变化。
关键词
帕金森病
多巴胺转运蛋白
多巴胺
酪氨酸羟化酶
Keywords
Parkinson ＇ s disease
melatonin
dopamine
tyrosine hydroxylase
striatum
substantia nigra
6 - OH-DA
apomorphine
DAT
99m Tc - PRODAT - 1
分类号
R742.5 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2008-2022年福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征研究
柯自立
张小玄
徐海滨
高亚东
罗朝晨
黄梦颖
邱玉锋
杨劲松
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
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职称材料
2
不同病程帕金森病大鼠纹状体多巴胺转运蛋白的动态变化
杜越群
陈文新
林志毅
伍兵
叶婧
柯自立
林玲
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
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职称材料
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