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猪源新城疫病毒SP13株的F基因克隆及序列分析
被引量：
4
1
作者
郑腾
程龙飞
+4 位作者
李志方
柯美峰
黄瑜
李文杨
施少华
《福建农林大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2007年第3期259-263,共5页
采用RT-PCR方法对猪源新城疫病毒(NDV)SP13株的F基因进行了扩增与克隆,并测定出F基因的核苷酸全序列,推导出氨基酸序列.F基因全长为1662 bp,单一的开放阅读框,编码553个氨基酸的长肽,裂解位点的氨基酸序列为112G-R-Q-G-R-L117,与弱毒株...
采用RT-PCR方法对猪源新城疫病毒(NDV)SP13株的F基因进行了扩增与克隆,并测定出F基因的核苷酸全序列,推导出氨基酸序列.F基因全长为1662 bp,单一的开放阅读框,编码553个氨基酸的长肽,裂解位点的氨基酸序列为112G-R-Q-G-R-L117,与弱毒株在这一区域的序列(112G-R/K-Q-G/S-R-L117)相符;F蛋白有6个潜在的糖基化位点和13个Cys残基位点,其疏水构型有3个强疏水区.通过同源率、系统发育、致病性、疏水性和抗原性等比较分析的结果表明,SP13与LaSota、Clone 30株不但同源性达到99.9%,而且在致病性、疏水性和抗原性等方面也极为相似.
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关键词
猪源
新城疫病毒
F基因
克隆
序列分析
系统发育分析
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职称材料
题名
猪源新城疫病毒SP13株的F基因克隆及序列分析
被引量：
4
1
作者
郑腾
程龙飞
李志方
柯美峰
黄瑜
李文杨
施少华
机构
福建出入境检验检疫局
福建省农业科学院畜牧兽医研究所
福州大北农生物技术有限公司
出处
《福建农林大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2007年第3期259-263,共5页
基金
福建省自然科学基金资助项目(Z0516088)
文摘
采用RT-PCR方法对猪源新城疫病毒(NDV)SP13株的F基因进行了扩增与克隆,并测定出F基因的核苷酸全序列,推导出氨基酸序列.F基因全长为1662 bp,单一的开放阅读框,编码553个氨基酸的长肽,裂解位点的氨基酸序列为112G-R-Q-G-R-L117,与弱毒株在这一区域的序列(112G-R/K-Q-G/S-R-L117)相符;F蛋白有6个潜在的糖基化位点和13个Cys残基位点,其疏水构型有3个强疏水区.通过同源率、系统发育、致病性、疏水性和抗原性等比较分析的结果表明,SP13与LaSota、Clone 30株不但同源性达到99.9%,而且在致病性、疏水性和抗原性等方面也极为相似.
关键词
猪源
新城疫病毒
F基因
克隆
序列分析
系统发育分析
Keywords
swine
newcastle disease virus
F gene
clone
sequence analysis
phyogenrtic analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪源新城疫病毒SP13株的F基因克隆及序列分析
郑腾
程龙飞
李志方
柯美峰
黄瑜
李文杨
施少华
《福建农林大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2007
4
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