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海马齿叶绿体基因组综合特征及psbB基因功能分析
1
作者
李单凤
陈璐
+5 位作者
陆万桂
李茵
林伟强
林茨荇
李卫锦
张颖
《草地学报》
北大核心
2025年第10期3194-3204,共11页
为探究红树林伴生植物海马齿(Sesuvium portulacastrum(L.)L.)叶绿体基因组的综合特征,本研究通过高通量测序技术对其叶绿体DNA进行测序。结果表明:海马齿叶绿体基因组全长155932 bp,GC含量36.50%,注释得到133个编码基因,其中蛋白编码基...
为探究红树林伴生植物海马齿(Sesuvium portulacastrum(L.)L.)叶绿体基因组的综合特征,本研究通过高通量测序技术对其叶绿体DNA进行测序。结果表明:海马齿叶绿体基因组全长155932 bp,GC含量36.50%,注释得到133个编码基因,其中蛋白编码基因75个,密码子22945个,偏好以A/U结尾。该叶绿体基因组呈典型四分体结构,与Sesuvium sesuvioides(Fenzl)Verdc.高度保守,共享基因达129个且排列顺序相同。共检测到75个SSR位点,其中约77.33%分布在大单拷贝区(LSC),单核苷酸重复序列出现频率高达92.00%。基于10个物种(含海马齿)的48个共有蛋白编码基因通过最大似然法构建系统发育树,分析结果表明海马齿与S.sesuvioides的亲缘关系最近。海马齿叶绿体psbB基因开放阅读框长1527 bp,其在拟南芥(Arabidopsis thaliana(L.)Heynh.)中过表达可显著提升叶绿素含量。本研究有助于充分了解海马齿叶绿体基因组结构和功能,为进一步进行海马齿分子辅助育种提供参考。
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关键词
海马齿
叶绿体基因组
SSR
系统发育分析
psbB基因
基因功能
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题名
海马齿叶绿体基因组综合特征及psbB基因功能分析
1
作者
李单凤
陈璐
陆万桂
李茵
林伟强
林茨荇
李卫锦
张颖
机构
岭南师范学院生命科学与技术学院
出处
《草地学报》
北大核心
2025年第10期3194-3204,共11页
基金
湛江市科学技术局项目(2023A01018)
广东省普通高校特色创新类项目(2023KTSCX071)
+1 种基金
岭南师范学院科研创新团队项目(2024)
岭南师范学院一般项目(LY2207)资助。
文摘
为探究红树林伴生植物海马齿(Sesuvium portulacastrum(L.)L.)叶绿体基因组的综合特征,本研究通过高通量测序技术对其叶绿体DNA进行测序。结果表明:海马齿叶绿体基因组全长155932 bp,GC含量36.50%,注释得到133个编码基因,其中蛋白编码基因75个,密码子22945个,偏好以A/U结尾。该叶绿体基因组呈典型四分体结构,与Sesuvium sesuvioides(Fenzl)Verdc.高度保守,共享基因达129个且排列顺序相同。共检测到75个SSR位点,其中约77.33%分布在大单拷贝区(LSC),单核苷酸重复序列出现频率高达92.00%。基于10个物种(含海马齿)的48个共有蛋白编码基因通过最大似然法构建系统发育树,分析结果表明海马齿与S.sesuvioides的亲缘关系最近。海马齿叶绿体psbB基因开放阅读框长1527 bp,其在拟南芥(Arabidopsis thaliana(L.)Heynh.)中过表达可显著提升叶绿素含量。本研究有助于充分了解海马齿叶绿体基因组结构和功能,为进一步进行海马齿分子辅助育种提供参考。
关键词
海马齿
叶绿体基因组
SSR
系统发育分析
psbB基因
基因功能
Keywords
Sesuvium portulacastrum L.
Chloroplast genome
SSR
Phylogenetic analysis
psbB gene
Gene function
分类号
Q344.13 [生物学—遗传学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
海马齿叶绿体基因组综合特征及psbB基因功能分析
李单凤
陈璐
陆万桂
李茵
林伟强
林茨荇
李卫锦
张颖
《草地学报》
北大核心
2025
0
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