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前列腺特异膜抗原的结构模型研究
1
作者
叶传忠
林传捷
+4 位作者
张芳林
张磬
叶敏
陈建华
黄云腾
《上海第二医科大学学报》
CAS
CSCD
2003年第6期481-484,共4页
目的对前列腺特异膜抗原(PSMA)进行结构模建并尝试其小分子抑制物的设计。 方法通过网络资源和分子设计软件SYBYL进行PSMA的三维模建和小分子抑制物的设计。 结果以气单胞菌氨肽酶(AMP)的晶体结构为模板使用Composer模块,获得PSMA胞外...
目的对前列腺特异膜抗原(PSMA)进行结构模建并尝试其小分子抑制物的设计。 方法通过网络资源和分子设计软件SYBYL进行PSMA的三维模建和小分子抑制物的设计。 结果以气单胞菌氨肽酶(AMP)的晶体结构为模板使用Composer模块,获得PSMA胞外区三维结构模型。采用分子对接方法,以AMP和p-碘基-D-苯丙酸-氧肟酸(AIDPH)的复合物晶体结构IIGB为参照,将AIDPH对接到PSMA的结构上,相对应形成疏水作用一端的残基为Y279、Y294、Y298及Y301,与IIGB的晶体结构中的蛋白-抑制剂间的疏水作用非常相似,相对应于另一端形成氢键的4个残基中有3个相同,说明两个复合物氢键形成的方式大体一致。 结论成功获得PSMA三维结构的理论模型。AIDPH有望作为设计PSMA靶向性药物的前导基团。
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关键词
前列腺特异膜抗原
结构模型
串线法
药物设计
前列腺癌
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职称材料
题名
前列腺特异膜抗原的结构模型研究
1
作者
叶传忠
林传捷
张芳林
张磬
叶敏
陈建华
黄云腾
机构
上海第二医科大学新华医院泌尿外科
福建医科大学第一医院信息科
瑞金医院
中国科学院上海生物化学研究所
出处
《上海第二医科大学学报》
CAS
CSCD
2003年第6期481-484,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(30300347)
文摘
目的对前列腺特异膜抗原(PSMA)进行结构模建并尝试其小分子抑制物的设计。 方法通过网络资源和分子设计软件SYBYL进行PSMA的三维模建和小分子抑制物的设计。 结果以气单胞菌氨肽酶(AMP)的晶体结构为模板使用Composer模块,获得PSMA胞外区三维结构模型。采用分子对接方法,以AMP和p-碘基-D-苯丙酸-氧肟酸(AIDPH)的复合物晶体结构IIGB为参照,将AIDPH对接到PSMA的结构上,相对应形成疏水作用一端的残基为Y279、Y294、Y298及Y301,与IIGB的晶体结构中的蛋白-抑制剂间的疏水作用非常相似,相对应于另一端形成氢键的4个残基中有3个相同,说明两个复合物氢键形成的方式大体一致。 结论成功获得PSMA三维结构的理论模型。AIDPH有望作为设计PSMA靶向性药物的前导基团。
关键词
前列腺特异膜抗原
结构模型
串线法
药物设计
前列腺癌
Keywords
prostate specific membrane
threading
computer
drug design
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
前列腺特异膜抗原的结构模型研究
叶传忠
林传捷
张芳林
张磬
叶敏
陈建华
黄云腾
《上海第二医科大学学报》
CAS
CSCD
2003
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