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前列腺特异膜抗原的结构模型研究
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作者 叶传忠 林传捷 +4 位作者 张芳林 张磬 叶敏 陈建华 黄云腾 《上海第二医科大学学报》 CAS CSCD 2003年第6期481-484,共4页
目的对前列腺特异膜抗原(PSMA)进行结构模建并尝试其小分子抑制物的设计。 方法通过网络资源和分子设计软件SYBYL进行PSMA的三维模建和小分子抑制物的设计。 结果以气单胞菌氨肽酶(AMP)的晶体结构为模板使用Composer模块,获得PSMA胞外... 目的对前列腺特异膜抗原(PSMA)进行结构模建并尝试其小分子抑制物的设计。 方法通过网络资源和分子设计软件SYBYL进行PSMA的三维模建和小分子抑制物的设计。 结果以气单胞菌氨肽酶(AMP)的晶体结构为模板使用Composer模块,获得PSMA胞外区三维结构模型。采用分子对接方法,以AMP和p-碘基-D-苯丙酸-氧肟酸(AIDPH)的复合物晶体结构IIGB为参照,将AIDPH对接到PSMA的结构上,相对应形成疏水作用一端的残基为Y279、Y294、Y298及Y301,与IIGB的晶体结构中的蛋白-抑制剂间的疏水作用非常相似,相对应于另一端形成氢键的4个残基中有3个相同,说明两个复合物氢键形成的方式大体一致。 结论成功获得PSMA三维结构的理论模型。AIDPH有望作为设计PSMA靶向性药物的前导基团。 展开更多
关键词 前列腺特异膜抗原 结构模型 串线法 药物设计 前列腺癌
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