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过表达Kdm4d对山羊孤雌胚胎基因组激活期Xist表达的影响
1
作者
杨瑛楠
蔡玉
+4 位作者
刘孜斐
李东旭
万永杰
王锋
邓明田
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1227-1234,共8页
[目的]本试验旨在探究过表达赖氨酸特异去甲基化酶4D(Kdm4d)对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[方法]通过构建Kdm4d-IRES-EGFP重组质粒,体外转录Kdm4d mRNA,再利用显微注射、免疫荧光和亚硫酸氢盐测序等方法,分析过...
[目的]本试验旨在探究过表达赖氨酸特异去甲基化酶4D(Kdm4d)对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[方法]通过构建Kdm4d-IRES-EGFP重组质粒,体外转录Kdm4d mRNA,再利用显微注射、免疫荧光和亚硫酸氢盐测序等方法,分析过表达Kdm4d对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[结果]与对照组相比,组蛋白H3K9甲基化(H3K9me3)水平在2~8细胞期和囊胚期过表达Kdm4d的山羊孤雌胚胎中均显著降低,过表达Kdm4d山羊的4、8细胞期胚胎和囊胚的发育潜能无显著变化;Xist表达水平在过表达Kdm4d的山羊8细胞期孤雌胚胎中显著升高,但Xist启动子仍维持高甲基化,与对照组相比无显著变化。[结论]Kdm4d能有效移除孤雌胚胎中H3K9me3修饰,促进Xist表达,但不影响Xist启动子DNA甲基化水平和山羊孤雌胚胎发育潜能。本研究为深入理解Kdm4d调控山羊早期胚胎X染色体失活的机制奠定了基础。
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关键词
Kdm4d
XIST
孤雌胚胎
胚胎基因组激活
山羊
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职称材料
哺乳动物合子基因组激活过程中表观遗传因子的表达模式研究
2
作者
陈笑薇
杨瑛楠
+3 位作者
田梦圆
张金豪
王锋
邓明田
《南京农业大学学报》
2025年第5期1128-1140,共13页
[目的]哺乳动物合子基因组激活(zygotic genome activation,ZGA)是早期胚胎发育的一个关键阶段,标志着早期胚胎的发育调控由母源基因向合子基因转变。DNA甲基化和组蛋白修饰等表观遗传精确调控合子基因或母源基因的激活或抑制,在早期胚...
[目的]哺乳动物合子基因组激活(zygotic genome activation,ZGA)是早期胚胎发育的一个关键阶段,标志着早期胚胎的发育调控由母源基因向合子基因转变。DNA甲基化和组蛋白修饰等表观遗传精确调控合子基因或母源基因的激活或抑制,在早期胚胎发育过程中发挥重要作用。本研究目的为探究表观遗传因子在哺乳动物ZGA过程中的表达变化,理解哺乳动物早期胚胎发育的调控方式。[方法]通过构建山羊早期胚胎发育不同时期胚胎RNA-seq文库,使用生物信息学方法联合分析小鼠、人和牛早期胚胎发育不同时期胚胎RNA-seq数据,分析重要表观遗传因子在哺乳动物ZGA过程中的表达模式。[结果]在人、小鼠、山羊、牛ZGA过程中分别检测到153、153、87、58个差异表达的表观遗传因子,其中KDM5B、SETD2、EED、MSL2、MTA2、ATXN7L3、YTHDF2、IGF2BP1、ALYREF在人、小鼠、牛和山羊ZGA时期均差异表达;DNA甲基化因子TET1在小鼠、人、牛ZGA时期表达存在显著差异,在山羊ZGA过程中不差异但表达水平逐渐升高;组蛋白甲基化因子STED2和KDM5B在人、小鼠、牛、山羊ZGA过程中发挥重要作用;组蛋白乙酰化因子MSL2和MTA2在人、小鼠、牛、山羊ZGA时期维持乙酰化的动态平衡发挥重要作用;RNA修饰因子中YTHDF2和IGF2BP1可能参与调控哺乳动物ZGA过程的转录过程。[结论]本试验解析了DNA甲基化、组蛋白甲基化、组蛋白乙酰化和RNA修饰等表观遗传调控因子在哺乳动物ZGA期间的变化规律,并比较了人、小鼠、牛和山羊的表达模式,为构建哺乳动物ZGA调控网络、剖析表观遗传因子的动态调控作用、预测胚胎发育潜能等提供科学依据。
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关键词
合子基因组激活
表观遗传
早期胚胎发育
哺乳动物
组蛋白修饰
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职称材料
题名
过表达Kdm4d对山羊孤雌胚胎基因组激活期Xist表达的影响
1
作者
杨瑛楠
蔡玉
刘孜斐
李东旭
万永杰
王锋
邓明田
机构
南京农业大学动物科技学院江苏省家畜胚胎工程实验室
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1227-1234,共8页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(32102546)
江苏省基础研究计划青年基金项目(BK20200563)。
文摘
[目的]本试验旨在探究过表达赖氨酸特异去甲基化酶4D(Kdm4d)对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[方法]通过构建Kdm4d-IRES-EGFP重组质粒,体外转录Kdm4d mRNA,再利用显微注射、免疫荧光和亚硫酸氢盐测序等方法,分析过表达Kdm4d对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[结果]与对照组相比,组蛋白H3K9甲基化(H3K9me3)水平在2~8细胞期和囊胚期过表达Kdm4d的山羊孤雌胚胎中均显著降低,过表达Kdm4d山羊的4、8细胞期胚胎和囊胚的发育潜能无显著变化;Xist表达水平在过表达Kdm4d的山羊8细胞期孤雌胚胎中显著升高,但Xist启动子仍维持高甲基化,与对照组相比无显著变化。[结论]Kdm4d能有效移除孤雌胚胎中H3K9me3修饰,促进Xist表达,但不影响Xist启动子DNA甲基化水平和山羊孤雌胚胎发育潜能。本研究为深入理解Kdm4d调控山羊早期胚胎X染色体失活的机制奠定了基础。
关键词
Kdm4d
XIST
孤雌胚胎
胚胎基因组激活
山羊
Keywords
Kdm4d
Xist
parthenogenetic embryos
embryo genome activation
goat
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
哺乳动物合子基因组激活过程中表观遗传因子的表达模式研究
2
作者
陈笑薇
杨瑛楠
田梦圆
张金豪
王锋
邓明田
机构
南京农业大学动物科技学院江苏省家畜胚胎工程实验室
出处
《南京农业大学学报》
2025年第5期1128-1140,共13页
基金
国家自然科学基金项目(32102546)
中国博士后科学基金项目(2023M731732)
中央高校基本科研业务费(KJYQ2024007)。
文摘
[目的]哺乳动物合子基因组激活(zygotic genome activation,ZGA)是早期胚胎发育的一个关键阶段,标志着早期胚胎的发育调控由母源基因向合子基因转变。DNA甲基化和组蛋白修饰等表观遗传精确调控合子基因或母源基因的激活或抑制,在早期胚胎发育过程中发挥重要作用。本研究目的为探究表观遗传因子在哺乳动物ZGA过程中的表达变化,理解哺乳动物早期胚胎发育的调控方式。[方法]通过构建山羊早期胚胎发育不同时期胚胎RNA-seq文库,使用生物信息学方法联合分析小鼠、人和牛早期胚胎发育不同时期胚胎RNA-seq数据,分析重要表观遗传因子在哺乳动物ZGA过程中的表达模式。[结果]在人、小鼠、山羊、牛ZGA过程中分别检测到153、153、87、58个差异表达的表观遗传因子,其中KDM5B、SETD2、EED、MSL2、MTA2、ATXN7L3、YTHDF2、IGF2BP1、ALYREF在人、小鼠、牛和山羊ZGA时期均差异表达;DNA甲基化因子TET1在小鼠、人、牛ZGA时期表达存在显著差异,在山羊ZGA过程中不差异但表达水平逐渐升高;组蛋白甲基化因子STED2和KDM5B在人、小鼠、牛、山羊ZGA过程中发挥重要作用;组蛋白乙酰化因子MSL2和MTA2在人、小鼠、牛、山羊ZGA时期维持乙酰化的动态平衡发挥重要作用;RNA修饰因子中YTHDF2和IGF2BP1可能参与调控哺乳动物ZGA过程的转录过程。[结论]本试验解析了DNA甲基化、组蛋白甲基化、组蛋白乙酰化和RNA修饰等表观遗传调控因子在哺乳动物ZGA期间的变化规律,并比较了人、小鼠、牛和山羊的表达模式,为构建哺乳动物ZGA调控网络、剖析表观遗传因子的动态调控作用、预测胚胎发育潜能等提供科学依据。
关键词
合子基因组激活
表观遗传
早期胚胎发育
哺乳动物
组蛋白修饰
Keywords
zygotic genome activation(ZGA)
epigenetics
early embryonic development
mammals
histone modification
分类号
S814.6 [农业科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
过表达Kdm4d对山羊孤雌胚胎基因组激活期Xist表达的影响
杨瑛楠
蔡玉
刘孜斐
李东旭
万永杰
王锋
邓明田
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
哺乳动物合子基因组激活过程中表观遗传因子的表达模式研究
陈笑薇
杨瑛楠
田梦圆
张金豪
王锋
邓明田
《南京农业大学学报》
2025
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