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温度逆境处理提高拟微球藻(Nannochloropsis oculata)EPA含量的研究 被引量:11
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作者 杨官品 张继民 +1 位作者 魏东 张学成 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期132-135,共4页
关键词 微藻 眼点拟微球藻 EPA 温度逆境 细胞态饵料 成活率 二十碳五烯酸
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条斑紫菜丝状孢子体表达序列标签分析 被引量:10
2
作者 杨官品 沈怀舜 +1 位作者 许璞 张学成 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2002年第2期93-97,共5页
为获得条斑紫菜丝状孢子体特异表达基因和抗逆相关基因 ,进行了条斑紫菜丝状孢子体表达序列标签分析 ,共获得 170条表达序列标签。与数据库中条斑紫菜叶状配子体表达序列标签比较 ,发现 73条新标签 ,占 4 2 94 %。这些新标签可能是条... 为获得条斑紫菜丝状孢子体特异表达基因和抗逆相关基因 ,进行了条斑紫菜丝状孢子体表达序列标签分析 ,共获得 170条表达序列标签。与数据库中条斑紫菜叶状配子体表达序列标签比较 ,发现 73条新标签 ,占 4 2 94 %。这些新标签可能是条斑紫菜丝状孢子体中特异表达的基因。获得的 170条表达序列标签可分成 10 6组 ,其中的 4 3组 ,占 4 6 6% ,在蛋白质数据库中存在同源蛋白。已知功能的 4 3组标签中 ,大部分与能量代谢和蛋白质合成相关 ,只有 3组与生长发育、6组与抗逆与防御相关。上述研究结果是构建条斑紫菜分子标记连锁图谱和探讨条斑紫菜养殖性状遗传机理的重要基础。 展开更多
关键词 丝状孢子体 条斑紫菜 表达序列标签 基因表达 养殖 遗传机理 抗逆相关基因 特异表达基因
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条斑紫菜丝状孢子体cDNA文库构建及抗病相关基因鉴定 被引量:9
3
作者 杨官品 刘永健 +3 位作者 孙雪 沈怀舜 许璞 张学成 《青岛海洋大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第1期47-52,共6页
经过微量总 RNA抽提、c DNA合成、c DNA扩增和克隆等步骤 ,构建了微量条斑紫菜丝状孢子体 c DNA文库 ,并进行了小规模表达序列标签分析。从 1 70条标签序列中鉴定出 6条抗病相关基因序列。这些序列可用于研制抗病单核苷酸多态性标记 ,... 经过微量总 RNA抽提、c DNA合成、c DNA扩增和克隆等步骤 ,构建了微量条斑紫菜丝状孢子体 c DNA文库 ,并进行了小规模表达序列标签分析。从 1 70条标签序列中鉴定出 6条抗病相关基因序列。这些序列可用于研制抗病单核苷酸多态性标记 ,辅助紫菜抗性遗传改良。 展开更多
关键词 丝状孢子体 条斑紫菜 cDNA PCR文库 CDNA文库 表达序列标签 抗病基因
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水稻一多拷贝微卫星DNA多态性分析 被引量:21
4
作者 杨官品 M.A.SaghaiMaroof +2 位作者 张启发 秦昌华 罗忠训 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第2期27-30,共4页
用一个多拷贝微卫星DNA标记分析了238份栽培水稻的遗传多样性及遗传多样性从农家品种到现代栽培品种的动态变化。共检测出16种长度变异类型和32种表现型,但长度变异类型数、表现型数和表现型多样性水平在农家品种和现代栽培... 用一个多拷贝微卫星DNA标记分析了238份栽培水稻的遗传多样性及遗传多样性从农家品种到现代栽培品种的动态变化。共检测出16种长度变异类型和32种表现型,但长度变异类型数、表现型数和表现型多样性水平在农家品种和现代栽培品种间没有显著差别。该标记在遗传资源评价和DNA指纹图谱建设中有重要的应用价值,也是研究环境或人工对多拷贝基因选择作用的一个良好模型。 展开更多
关键词 水稻 微卫星DNA标记 遗传多样性
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海带配子体无性繁殖(克隆)技术研究与应用进展 被引量:14
5
作者 杨官品 李晓捷 +4 位作者 丛义周 曲善村 李志凌 张壮志 罗世菊 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期569-572,共4页
海带具有异型世代交替,其配子体在单独分离培养时可进行营养生长,形成无性繁殖系(克隆)。本文简要回顾了海带配子体克隆技术研究与应用的历程,综述海带配子体克隆在海带种质资源保存、海带生理和遗传学研究及海带育种和苗种繁育中的应... 海带具有异型世代交替,其配子体在单独分离培养时可进行营养生长,形成无性繁殖系(克隆)。本文简要回顾了海带配子体克隆技术研究与应用的历程,综述海带配子体克隆在海带种质资源保存、海带生理和遗传学研究及海带育种和苗种繁育中的应用现状。 展开更多
关键词 海带 配子体克隆 种质保存 育种 苗种繁育
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环境细菌宏基因组研究及海洋细菌生物活性物质BAC文库筛选 被引量:10
6
作者 杨官品 茅云翔 《青岛海洋大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2001年第5期718-722,共5页
宏基因组是特定环境全部生物遗传物质总和 ,决定生物群体生命现象。特定生物种基因组研究使人们的认识单元实现了从单一基因到基因集合的转变 ,宏基因组研究将使人们摆脱物种界限 ,揭示更高更复杂层次上的生命运动规律。在目前的基因结... 宏基因组是特定环境全部生物遗传物质总和 ,决定生物群体生命现象。特定生物种基因组研究使人们的认识单元实现了从单一基因到基因集合的转变 ,宏基因组研究将使人们摆脱物种界限 ,揭示更高更复杂层次上的生命运动规律。在目前的基因结构功能认识和基因操作技术背景下 ,环境细菌宏基因组成为研究和开发的主要对象。环境细菌宏基因组细菌人工染色体文库筛选和基因系统学分析使研究者能更有效地开发细菌基因资源 。 展开更多
关键词 细菌 宏基因组 细菌人工染色体文库 生物活性物质 微生物 基因工程
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海带属褐藻生物学研究成就与进展 被引量:2
7
作者 杨官品 李晓捷 +3 位作者 石媛嫄 张全胜 丛义周 刘涛 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期564-570,共7页
以海带(LaminariajaponicaAresch)为重点,综述了海带属褐藻生物学研究成就,介绍了海带属褐藻遗传育种技术、育苗技术和分子生物学研究进展。海带属褐藻生物学研究基础好,种质资源丰富,经济、生态价值高,是进行大型海藻遗传学和基因组学... 以海带(LaminariajaponicaAresch)为重点,综述了海带属褐藻生物学研究成就,介绍了海带属褐藻遗传育种技术、育苗技术和分子生物学研究进展。海带属褐藻生物学研究基础好,种质资源丰富,经济、生态价值高,是进行大型海藻遗传学和基因组学研究的理想材料。 展开更多
关键词 海带属褐藻 海带 生活史 杂种优势 分子标记 表达序列标签
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热休克蛋白22结构和功能研究进展 被引量:3
8
作者 杨官品 张蕾 董超华 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期965-970,共6页
热休克蛋白22(HSP22)是唯一在体外能以单体形式存在的小分子热休克蛋白(sHSP),具有分子伴侣功能和激酶活性。HSP22高水平表达促进细胞凋亡而低水平表达抑制凋亡。除此之外,HSP22还在延长寿命、耐热和抗氧化等方面发挥作用。由于其独特... 热休克蛋白22(HSP22)是唯一在体外能以单体形式存在的小分子热休克蛋白(sHSP),具有分子伴侣功能和激酶活性。HSP22高水平表达促进细胞凋亡而低水平表达抑制凋亡。除此之外,HSP22还在延长寿命、耐热和抗氧化等方面发挥作用。由于其独特的生物学功能,HSP22正成为当今研究热门对象之一。近年来,HSP22在医学方面的研究已取得显著进展,其在海洋生物学方面的研究价值也逐渐得到重视。本文综述了近年来HSP22结构和功能及其在医学和海洋生物学上的研究进展。 展开更多
关键词 热休克蛋白22 小热休克蛋白 医学 海洋生物
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蛋白质感染因子与水产养殖 被引量:2
9
作者 杨官品 廖梅杰 +1 位作者 张之文 门荣新 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期403-412,共10页
介绍了蛋白质感染因子的概念、蛋白质感染因子复制机理假说及其证明、蛋白质感染因子多样性等内容 ,并讨论了水产养殖动物中存在蛋白质感染因子疾病的可能性。
关键词 蛋白质感染因子 水产养殖 疯牛病 唯蛋白假说
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工程微生物发酵褐藻碳水化合物生产乙醇:生物乙醇开发新方向 被引量:2
10
作者 杨官品 李斐斐 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期88-95,共8页
生物质(biomass)是生产生物燃油和日用品的天然可再生资源。用生物质生产燃油和日用品有助于解决粮食、环境、能源等重大问题。遗传育种、生物技术、化学加工、工程技术等领域的技术进步和整合,正在逐步使利用生物质生产燃油和日用... 生物质(biomass)是生产生物燃油和日用品的天然可再生资源。用生物质生产燃油和日用品有助于解决粮食、环境、能源等重大问题。遗传育种、生物技术、化学加工、工程技术等领域的技术进步和整合,正在逐步使利用生物质生产燃油和日用品成为可能。其中,最具代表意义的是发酵生物质生产乙醇。攀升的油价和保护化石燃料资源的压力,使人们力图用工程微生物发酵生物质生产生物燃油和日用品,遗传工程修饰和改造工业微生物,规模化开发多样生物质。玉米和甘蔗可做工业用,但“食物-燃油”忧虑(concerns)可能终结这一路经。木质纤维素来源丰富,但处理木质纤维素释放单糖,成本高,环境压力大。因此,需要全新思路和策略开发利用非木质纤维素生物质,海洋大型褐藻是新希望。 展开更多
关键词 微生物发酵 物质生产 开发利用 生物乙醇 工程技术 碳水化合物 褐藻 木质纤维素
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多物种混合转录组测序(msRNA-seq)及其在海洋生态学研究中的应用 被引量:1
11
作者 杨官品 孙诗阳 +1 位作者 潘克厚 郭栗 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期54-63,共10页
转录组测序是细胞生理学过程和机制的解析手段之一。目前,主要应用在对特定物种或细胞类型在不同生长、发育阶段(时间序列)或不同组织、器官、生长环境(空间序列)中基因转录本丰度的定量和比较上。但是,这并不适用于多物种共存的自然生... 转录组测序是细胞生理学过程和机制的解析手段之一。目前,主要应用在对特定物种或细胞类型在不同生长、发育阶段(时间序列)或不同组织、器官、生长环境(空间序列)中基因转录本丰度的定量和比较上。但是,这并不适用于多物种共存的自然生态系统和多细胞协同作用的生物体中。应运而生的混合多物种转录组分析技术则是可以同时针对两个或两个以上物种或细胞类型的转录组进行分析,以此来解析物种或细胞间的相互作用。其最大特点是靠后期拆分数据而不是通过前期的物理方法来拆分物种或细胞类型。目前,该技术在动物医学领域中使用较多,但在生态系统尤其是海洋生态系统的研究中应用较少。本文介绍了多物种混合转录组测序的概念、方法、研究历程和在海洋生态学研究中的应用及前景,以期为该领域研究者打开新思路,提供新方法。 展开更多
关键词 互作转录组测序 混合物种转录组测序 海洋生态学 互作生理机制 合成生态学
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RNA干扰技术与对虾病毒病防治 被引量:1
12
作者 杨官品 董超华 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期71-76,共6页
RNA干扰,是1种由双链RNA引发的转录后基因沉默现象。作为1种有力的反向遗传学研究工具,RNA干扰被广泛用于阻断各种基因的表达。建立在RNA干扰技术基础上的基因治疗,被认为是治疗病毒性疾病的有效手段。在水产科学领域,RNA干扰在对虾病... RNA干扰,是1种由双链RNA引发的转录后基因沉默现象。作为1种有力的反向遗传学研究工具,RNA干扰被广泛用于阻断各种基因的表达。建立在RNA干扰技术基础上的基因治疗,被认为是治疗病毒性疾病的有效手段。在水产科学领域,RNA干扰在对虾病毒病控制上的应用近几年受到广泛的关注。病毒性疾病已经在世界范围内给对虾养殖业造成了严重的经济损失,目前还没有有效的控制手段。利用RNA干扰技术控制对虾病毒的侵染,是一个很有前途的方法。本文综述RNA干扰技术在对虾病毒病防治中的最新进展,并对RNA干扰技术控制病毒侵染的可能性进行探讨。 展开更多
关键词 RNA干扰 对虾 病毒
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基因组的测序技术及其发展趋势 被引量:3
13
作者 杨官品 郭栗 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第S1期48-57,共10页
近年来,基因组测序如火如荼,高水平论文不断涌现,中国科学家成果丰硕。但是,高质量参考基因组序列仍十分匮乏。三代测序技术和各类基因组辅助组装技术组合使用使低成本获得高质量参考基因组序列成为可能,这将拓展基因组序列的应用范围,... 近年来,基因组测序如火如荼,高水平论文不断涌现,中国科学家成果丰硕。但是,高质量参考基因组序列仍十分匮乏。三代测序技术和各类基因组辅助组装技术组合使用使低成本获得高质量参考基因组序列成为可能,这将拓展基因组序列的应用范围,也将有助于解析众多低质量参考基因组序列无法解析的生物学问题。本文综述了三代测序、光学物理作图、Hi-C辅助组装等在用的参考基因组测序和组装技术及其发展趋势,以期为相关研究者提供新技术、新策略选项信息。 展开更多
关键词 三代测序 从头组装 光学物理图谱构建 临近-连接框架
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大麦萌发种子总mRNA的分离及cDNA克隆
14
作者 杨官品 张启发 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1990年第3期315-318,共4页
以大麦为材料,用硫氰酸胍-热酚-氯化锂-蛋白酶K法抽提萌发种子的总RNA,经过Oligo(dT)-纤维素柱层析,分离出总mRNA。经MuMLV逆转录酶合成cDNA第一条链,再用E. coliDNA聚合酶Ⅰ-RNase H共同作用,合成第二条链。经DNA聚合酶Ⅰ大片段修平末... 以大麦为材料,用硫氰酸胍-热酚-氯化锂-蛋白酶K法抽提萌发种子的总RNA,经过Oligo(dT)-纤维素柱层析,分离出总mRNA。经MuMLV逆转录酶合成cDNA第一条链,再用E. coliDNA聚合酶Ⅰ-RNase H共同作用,合成第二条链。经DNA聚合酶Ⅰ大片段修平末端后,与经过SmaⅠ完全酶切并用碱性磷酸酶处理了的pUC19载体连接,转化受体菌JM107,挑出白色重组子,用小麦全长的α-淀粉酶基因为探针经过菌落原位杂交筛选,获得一个含有α-淀粉酶基因片段的阳性克隆,插入片段长度约0.8kb。 展开更多
关键词 大麦 种子 CDNA文库 Α-淀粉酶基因
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新基因功能验证技术及其在微藻基因克隆中的适用性分析
15
作者 杨官品 林根妹 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期72-79,共8页
微藻是指1群真核、单细胞、行光合作用的生物。微藻种类多,分布广泛,有关键生态学功能,也有水产、生物能源应用价值。与模式生物和经济动植物一样,新基因克隆是微藻生物学研究的主要内容。基因组注释、转录组分析和基因分离等依据序列... 微藻是指1群真核、单细胞、行光合作用的生物。微藻种类多,分布广泛,有关键生态学功能,也有水产、生物能源应用价值。与模式生物和经济动植物一样,新基因克隆是微藻生物学研究的主要内容。基因组注释、转录组分析和基因分离等依据序列和结构同源性,是从已知到已知的过程;而新基因克隆需锁定序列和验证功能,其中,功能验证是基因克隆的最重要内容。已有的基因功能验证方法有基因敲除、基因沉默、插入突变、基因组编辑等。多种微藻已有遗传转化技术,有望直接采用模式生物和经济动植物的基因功能验证技术克隆新基因。本文归纳了已有新基因功能验证技术,并分析了它们在微藻新基因克隆中的适用性,以促进微藻新基因克隆研究。 展开更多
关键词 微藻 全新基因 基因克隆 遗传转化
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红鳍东方鲀基因组微卫星特征分析 被引量:46
16
作者 崔建洲 申雪艳 +2 位作者 杨官品 宫庆礼 顾谦群 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期249-254,272,共7页
对河豚基因组微卫星分布特征进行研究,在约365Mb基因组序列中共找到49647个微卫星序列,平均每隔7351个碱基就有1个。微卫星序列长度主要分布在20~60个碱基的长度范围内。全部微卫星序列重复区长度(2802374bp)占整个基因组的比例为0... 对河豚基因组微卫星分布特征进行研究,在约365Mb基因组序列中共找到49647个微卫星序列,平均每隔7351个碱基就有1个。微卫星序列长度主要分布在20~60个碱基的长度范围内。全部微卫星序列重复区长度(2802374bp)占整个基因组的比例为0.77%。两碱基重复类型数目最多,为35339个,占总数的71.30%;其次是四碱基类型,6837个,占13.77%;再次分别是三碱基类型3548个,占7.1496。五碱基类型1856个,占3.73%,六碱基类型1605个,占3.23%,单碱基类型最少,共402个。占0.80%。按降序排列,出现最多的前20个微卫星重复类别为:CA,TG,GT,AC,GA,CT,TC,TA.AG,AT,TCCA,ATCC,TCTG,GATG,ATCT,CATC,TGGA,ATGG,GATA,GAG,占全部微卫星序列的75.21%。在河豚基因组中未发现CC微卫星序列的存在。与其它生物基因组中微卫星分布特征相比,河豚基因组具有更高的简洁性。本研究将为研究河豚微卫星标记、研究其群体遗传多样性,进行不同基因组的比较研究提供基础。 展开更多
关键词 红鳍东方鲀(Tackifugu rubripes) 微卫星 基因组
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海洋微藻总脂含量和脂肪酸组成的测定 被引量:39
17
作者 王明清 迟晓元 +3 位作者 秦松 杨官品 姜鹏 逄少军 《中国油脂》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期67-70,共4页
对14株海洋微藻(绿藻纲6株,金藻纲4株,硅藻纲3株,甲藻纲1株)中的总脂含量和脂肪酸成分进行了测定。结果表明,14株海洋微藻的总脂含量存在着明显差异,盐藻的总脂含量最高,占千重的28.71%;4株金藻的总脂含量均较高,超过干重... 对14株海洋微藻(绿藻纲6株,金藻纲4株,硅藻纲3株,甲藻纲1株)中的总脂含量和脂肪酸成分进行了测定。结果表明,14株海洋微藻的总脂含量存在着明显差异,盐藻的总脂含量最高,占千重的28.71%;4株金藻的总脂含量均较高,超过干重的20%。14株海洋微藻的脂肪酸成分和含量也存在着较大的差异,绿藻中饱和脂肪酸C16:0。的含量均较高;对于单不饱和脂肪酸,小球藻以C16:1(n=7)为主,盐藻以C18:1(n=7)为主,青岛大扁藻以C18:1(n=9)为主。4株金藻的PUFAs含量均较高,几乎占脂肪酸总量的1/2,并且DHA的含量较其他藻株高。3.株硅藻的EPA含量最高,占27.2%-32.9%;而裸甲藻的PUFAs含量最低,仅为25.2%。 展开更多
关键词 海洋微藻 总脂 脂肪酸 多不饱和脂肪酸
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水稻广亲和基因在RFLP图谱上的初步定位 被引量:23
18
作者 刘蔼民 李和标 +3 位作者 张启发 姜晓红 师素云 杨官品 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1992年第3期213-219,共7页
以02428/Balilla//南京11三交F_1群体为材料,对利用染色体特异的RFLP标记进行水稻广亲和基因的定位作了初步尝试。结果表明:该群体中单株小穗可育率呈双峰分布,高结实株与低结实株之比符合1:1分离规律,说明水稻广亲和性受一对显性核基... 以02428/Balilla//南京11三交F_1群体为材料,对利用染色体特异的RFLP标记进行水稻广亲和基因的定位作了初步尝试。结果表明:该群体中单株小穗可育率呈双峰分布,高结实株与低结实株之比符合1:1分离规律,说明水稻广亲和性受一对显性核基因控制;所用7个已定位于第6染色体的探针中,RG213和RG138在02428与另两个亲本之间表现多态性;广亲和基因与Est-2、RG213、RG138、C基因4个位点间均表现极显著连锁关系,交换值分别为5.9%,7.9%,9.7%和10.3%。广亲和基因在RFLP图上位置的初步确定为进行该基因的精细定位、克隆以及该基因的有效利用奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 广亲和 基因 亚种间杂交
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我国引种海带和栽培品种(系)来源配子体克隆的AFLP分析 被引量:14
19
作者 张全胜 石媛媛 +3 位作者 丛义周 曲善村 尚书 杨官品 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期429-435,共7页
用AFLP方法进行了11个海带自然种群和养殖品种(系)来源的配子体克隆的遗传分析。9对引物组合共扩增出246个位点,仅14个位点为单态,多态比例达到94.3%。各材料间的Nei’s遗传距离在0.280~0.726之间,平均为0.512,其中长海带与其它材料间... 用AFLP方法进行了11个海带自然种群和养殖品种(系)来源的配子体克隆的遗传分析。9对引物组合共扩增出246个位点,仅14个位点为单态,多态比例达到94.3%。各材料间的Nei’s遗传距离在0.280~0.726之间,平均为0.512,其中长海带与其它材料间的遗传距离最远。UPGMA聚类分析将各材料大致分为3类群,基本反映了各材料来源孢子体表型特征的分化,也在一定程度上反映了目前海带养殖品种间存在混杂。将扩增图谱转换成[0/1]型数据集,构建了不同材料的指纹图谱,发现55个特征标记,其中26个为特异标记。 展开更多
关键词 海带 自然种群 品种(系) AFLP 指纹图谱 遗传距离 聚类分析
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发光细菌法在环渤海污水样品遗传毒性检测中的应用 被引量:13
20
作者 崔志松 栾晓 +3 位作者 高伟 李倩 杨官品 郑立 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期228-232,共5页
建立了以经过遗传改造的发光细菌Acinetobacter sp.Rec A为受试物种的环境污染物遗传毒性快速检测方法,该方法最快可在3h内得到毒性评价结果。采用该方法评价了环渤海排污口12份污水样品的遗传毒性。环渤海12个排污口的污水样品均表现... 建立了以经过遗传改造的发光细菌Acinetobacter sp.Rec A为受试物种的环境污染物遗传毒性快速检测方法,该方法最快可在3h内得到毒性评价结果。采用该方法评价了环渤海排污口12份污水样品的遗传毒性。环渤海12个排污口的污水样品均表现出了不同水平的遗传毒性,并呈现出一定的分布特征。其中,高毒水质集中出现在山东半岛污水样品中,中毒水质集中出现在辽东半岛地区,而低毒水质主要集中于京津冀地区。综上,在环渤海的污水样品遗传毒性检测中,这种新型发光细菌法具有快速、灵敏、简便等优点,可为以后近海环境的水质生物毒性检测提供参考依据,具有应用于近海环境水质快速监测与评价的潜力。 展开更多
关键词 发光细菌 污水 毒性检测 渤海
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