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基于全长转录组测序的金花茶NAC基因家族鉴定及分析
1
作者
刘合霞
徐飞凤
+3 位作者
杨卓玲
吴晓敏
徐赛颖
李博
《安徽农业科学》
2025年第2期97-103,126,共8页
利用生物信息学技术对金花茶(Camellianitidissima)的全长转录组数据进行筛选,获得了35个金花茶NAC转录因子,将其分别命名为CnNAC1~CnNAC35;随后分析了蛋白理化性质、保守结构域以及系统发育关系;利用RNA-seq数据,对金花茶NAC转录因子...
利用生物信息学技术对金花茶(Camellianitidissima)的全长转录组数据进行筛选,获得了35个金花茶NAC转录因子,将其分别命名为CnNAC1~CnNAC35;随后分析了蛋白理化性质、保守结构域以及系统发育关系;利用RNA-seq数据,对金花茶NAC转录因子在根、茎、叶、花等组织中的表达谱进行了研究;并对金花茶不同开花时期的花瓣表达量与关键类黄酮化合物含量进行Pearson相关性分析。结果表明:金花茶NAC基因家族成员编码的蛋白主要为亲水性的不稳定蛋白,大多定位于细胞核或叶绿体中,多数蛋白都含有NAC基因家族所特有的5个亚保守结构域;系统进化分析中,35个金花茶NAC蛋白被分为16个亚家族,而NAC2亚家族所包含的蛋白数量最多;金花茶NAC转录因子在不同组织中的表达量存在差异,其中8个金花茶NAC转录因子在花瓣中的表达量相对较高,且与槲皮素、槲皮素-7-O-葡糖苷的变化量显著相关。
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关键词
金花茶
类黄酮合成调控
NAC基因家族
进化分析
表达分析
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题名
基于全长转录组测序的金花茶NAC基因家族鉴定及分析
1
作者
刘合霞
徐飞凤
杨卓玲
吴晓敏
徐赛颖
李博
机构
玉林师范学院智慧农业学院
玉林师范学院生物与制药学院
出处
《安徽农业科学》
2025年第2期97-103,126,共8页
基金
玉林师范学院2023年大学生创新创业训练计划项目(S202310606125)。
文摘
利用生物信息学技术对金花茶(Camellianitidissima)的全长转录组数据进行筛选,获得了35个金花茶NAC转录因子,将其分别命名为CnNAC1~CnNAC35;随后分析了蛋白理化性质、保守结构域以及系统发育关系;利用RNA-seq数据,对金花茶NAC转录因子在根、茎、叶、花等组织中的表达谱进行了研究;并对金花茶不同开花时期的花瓣表达量与关键类黄酮化合物含量进行Pearson相关性分析。结果表明:金花茶NAC基因家族成员编码的蛋白主要为亲水性的不稳定蛋白,大多定位于细胞核或叶绿体中,多数蛋白都含有NAC基因家族所特有的5个亚保守结构域;系统进化分析中,35个金花茶NAC蛋白被分为16个亚家族,而NAC2亚家族所包含的蛋白数量最多;金花茶NAC转录因子在不同组织中的表达量存在差异,其中8个金花茶NAC转录因子在花瓣中的表达量相对较高,且与槲皮素、槲皮素-7-O-葡糖苷的变化量显著相关。
关键词
金花茶
类黄酮合成调控
NAC基因家族
进化分析
表达分析
Keywords
Camellia nitidissima
Regulation of flavonoid synthesis
NAC gene family
Phylogenetic analysis
Expression analysis
分类号
S685.14 [农业科学—观赏园艺]
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作者
出处
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被引量
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1
基于全长转录组测序的金花茶NAC基因家族鉴定及分析
刘合霞
徐飞凤
杨卓玲
吴晓敏
徐赛颖
李博
《安徽农业科学》
2025
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