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普通菜豆14-3-3蛋白基因PvGF14h的克隆及冷胁迫诱导表达分析
被引量:
4
1
作者
罗萱
李瑞华
+3 位作者
王莉红
孙雯琦
蒋晓童
李绪彦
《广东农业科学》
CAS
2015年第4期106-112,共7页
根据14-3-3蛋白的保守性及菜豆基因组信息,从普通菜豆品种东北小油豆中克隆了一个14-3-3蛋白基因Pv GF14h。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白以α螺旋为主导结构,具有典型的14-3-3蛋白结构域,主要分布在细胞质与过氧化体中,具有磷...
根据14-3-3蛋白的保守性及菜豆基因组信息,从普通菜豆品种东北小油豆中克隆了一个14-3-3蛋白基因Pv GF14h。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白以α螺旋为主导结构,具有典型的14-3-3蛋白结构域,主要分布在细胞质与过氧化体中,具有磷酸化位点;序列比对及进化树分析表明,它与大豆14-3-3蛋白SGF14h有较高的同源性(可达98.1%);进一步利用实时定量RT-PCR分析Pv GF14h响应冷胁迫的表达模式,结果表明该基因的表达随着冷胁迫处理时间的增长而增加,因此推测Pv GF14h可能参与了冷胁迫的信号转导过程。这些关于菜豆14-3-3蛋白基因的基本信息为进一步研究其功能尤其在响应低温胁迫方面奠定了基础。
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关键词
菜豆
PvGF14h
14-3-3蛋白
冷胁迫
基因表达
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职称材料
lncRNA基因At3NC026490启动子克隆与功能分析
被引量:
1
2
作者
岳少康
谢鑫
+2 位作者
陈滢
李绪彦
边少敏
《广东农业科学》
CAS
2018年第5期52-57,174,共7页
lncRNAs是一类长度大于200 nt的非编码RNA,它们通过调控基因表达或直接影响蛋白功能,在植物生长发育与胁迫响应过程中发挥重要作用。At3NC026490是拟南芥中的一个lncRNA,目前尚未见该lncRNA功能方面的报道。从启动子角度对At3NC026490...
lncRNAs是一类长度大于200 nt的非编码RNA,它们通过调控基因表达或直接影响蛋白功能,在植物生长发育与胁迫响应过程中发挥重要作用。At3NC026490是拟南芥中的一个lncRNA,目前尚未见该lncRNA功能方面的报道。从启动子角度对At3NC026490的功能进行探索,首先利用生物信息学手段分析At3NC026490启动子的特性,发现该启动子具有响应光、激素、胁迫等作用元件;随后构建At3NC026490启动子驱动GUS基因的表达载体并转入拟南芥中;GUS染色分析表明转基因株系的根、幼苗、叶等营养组织以及花器官的花瓣具有明显的GUS表型,而在不同发育时期的种子中并未观察到GUS表型,说明该启动子具有典型的组织驱动特性,表明At3NC026490基因可能在应答光、激素、胁迫刺激以及特定组织中发挥作用,该研究为后期深入阐释lncRNA的功能提供了重要信息和研究思路。
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关键词
拟南芥
lncRNA
At3NC026490
启动子
GUS分析
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职称材料
大豆GmMYB138A基因的克隆及冷胁迫诱导表达分析
3
作者
王金宾
金东昊
+3 位作者
黄成成
孙浩然
陈帅
李绪彦
《广东农业科学》
CAS
2016年第6期43-48,共6页
根据大豆基因组信息,从大豆品种吉林32中克隆了1个转录因子基因,该基因对应大豆基因组中的CDS Glyma02g03020。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白属于MYB转录因子类型,主要分布在细胞核中;进化树分析将它与1R-MYB蛋白聚为一类,并与大...
根据大豆基因组信息,从大豆品种吉林32中克隆了1个转录因子基因,该基因对应大豆基因组中的CDS Glyma02g03020。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白属于MYB转录因子类型,主要分布在细胞核中;进化树分析将它与1R-MYB蛋白聚为一类,并与大豆MYB138亲缘关系最近,同源性可达96%,将其命名为GmMYB138A;进一步利用qRT-PCR分析GmMYB138A响应冷胁迫的表达模式,结果表明随着胁迫处理时间的延长,该基因表达逐渐增加,并在胁迫24 h达到高峰,提示GmMYB138A可能参与大豆的冷胁迫应答过程。
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关键词
大豆
GmMYB138A
克隆
冷胁迫
基因表达
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职称材料
题名
普通菜豆14-3-3蛋白基因PvGF14h的克隆及冷胁迫诱导表达分析
被引量:
4
1
作者
罗萱
李瑞华
王莉红
孙雯琦
蒋晓童
李绪彦
机构
吉林大学植物科学学院
出处
《广东农业科学》
CAS
2015年第4期106-112,共7页
基金
国家自然科学基金(31300253)
大学生创新创业训练计划项目(2013A82283)
文摘
根据14-3-3蛋白的保守性及菜豆基因组信息,从普通菜豆品种东北小油豆中克隆了一个14-3-3蛋白基因Pv GF14h。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白以α螺旋为主导结构,具有典型的14-3-3蛋白结构域,主要分布在细胞质与过氧化体中,具有磷酸化位点;序列比对及进化树分析表明,它与大豆14-3-3蛋白SGF14h有较高的同源性(可达98.1%);进一步利用实时定量RT-PCR分析Pv GF14h响应冷胁迫的表达模式,结果表明该基因的表达随着冷胁迫处理时间的增长而增加,因此推测Pv GF14h可能参与了冷胁迫的信号转导过程。这些关于菜豆14-3-3蛋白基因的基本信息为进一步研究其功能尤其在响应低温胁迫方面奠定了基础。
关键词
菜豆
PvGF14h
14-3-3蛋白
冷胁迫
基因表达
Keywords
common bean
PvGF14h
14-3-3 protein
cold stress
gene expression
分类号
S643.1 [农业科学—蔬菜学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
lncRNA基因At3NC026490启动子克隆与功能分析
被引量:
1
2
作者
岳少康
谢鑫
陈滢
李绪彦
边少敏
机构
吉林大学植物科学学院
出处
《广东农业科学》
CAS
2018年第5期52-57,174,共7页
基金
国家自然科学基金(31370340)
国家级大学生创新创业训练计划项目(2017A82374)
文摘
lncRNAs是一类长度大于200 nt的非编码RNA,它们通过调控基因表达或直接影响蛋白功能,在植物生长发育与胁迫响应过程中发挥重要作用。At3NC026490是拟南芥中的一个lncRNA,目前尚未见该lncRNA功能方面的报道。从启动子角度对At3NC026490的功能进行探索,首先利用生物信息学手段分析At3NC026490启动子的特性,发现该启动子具有响应光、激素、胁迫等作用元件;随后构建At3NC026490启动子驱动GUS基因的表达载体并转入拟南芥中;GUS染色分析表明转基因株系的根、幼苗、叶等营养组织以及花器官的花瓣具有明显的GUS表型,而在不同发育时期的种子中并未观察到GUS表型,说明该启动子具有典型的组织驱动特性,表明At3NC026490基因可能在应答光、激素、胁迫刺激以及特定组织中发挥作用,该研究为后期深入阐释lncRNA的功能提供了重要信息和研究思路。
关键词
拟南芥
lncRNA
At3NC026490
启动子
GUS分析
Keywords
Arabidopsis
lncRNA
At3NC026490
promoter
GUS analysis
分类号
Q949.748.3 [生物学—植物学]
Q813.2 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
大豆GmMYB138A基因的克隆及冷胁迫诱导表达分析
3
作者
王金宾
金东昊
黄成成
孙浩然
陈帅
李绪彦
机构
吉林大学植物科学学院
出处
《广东农业科学》
CAS
2016年第6期43-48,共6页
基金
国家自然科学基金(31300253)
国家大学生创新创业训练计划项目(2014A82371)
文摘
根据大豆基因组信息,从大豆品种吉林32中克隆了1个转录因子基因,该基因对应大豆基因组中的CDS Glyma02g03020。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白属于MYB转录因子类型,主要分布在细胞核中;进化树分析将它与1R-MYB蛋白聚为一类,并与大豆MYB138亲缘关系最近,同源性可达96%,将其命名为GmMYB138A;进一步利用qRT-PCR分析GmMYB138A响应冷胁迫的表达模式,结果表明随着胁迫处理时间的延长,该基因表达逐渐增加,并在胁迫24 h达到高峰,提示GmMYB138A可能参与大豆的冷胁迫应答过程。
关键词
大豆
GmMYB138A
克隆
冷胁迫
基因表达
Keywords
soybean
GmMYB138A
cloning
cold stress
gene expression
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
普通菜豆14-3-3蛋白基因PvGF14h的克隆及冷胁迫诱导表达分析
罗萱
李瑞华
王莉红
孙雯琦
蒋晓童
李绪彦
《广东农业科学》
CAS
2015
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
lncRNA基因At3NC026490启动子克隆与功能分析
岳少康
谢鑫
陈滢
李绪彦
边少敏
《广东农业科学》
CAS
2018
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
大豆GmMYB138A基因的克隆及冷胁迫诱导表达分析
王金宾
金东昊
黄成成
孙浩然
陈帅
李绪彦
《广东农业科学》
CAS
2016
0
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职称材料
已选择
0
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