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猪圆环病毒Ⅱ型感染3D4/2细胞的转录组学分析
1
作者
陈虹伶
赵怡
+5 位作者
陈家骥
韦秋旭
李禧梦
冯国越
胡焜翔
胡庭俊
《中国畜牧兽医》
CSCD
北大核心
2024年第1期42-51,共10页
【目的】通过转录组测序筛选猪圆环病毒Ⅱ型(Porcine circovirus typeⅡ,PCV2)感染猪肺泡巨噬细胞系(3D4/2)差异表达基因,为了解PCV2感染宿主免疫细胞机制和抗PCV2感染药物研发奠定基础。【方法】用感染复数(multiplicity of infection,...
【目的】通过转录组测序筛选猪圆环病毒Ⅱ型(Porcine circovirus typeⅡ,PCV2)感染猪肺泡巨噬细胞系(3D4/2)差异表达基因,为了解PCV2感染宿主免疫细胞机制和抗PCV2感染药物研发奠定基础。【方法】用感染复数(multiplicity of infection, MOI)为1的PCV2 NJ2002株处理3D4/2细胞,利用Illumina NovaSeq 6000测序平台进行转录组测序。使用DeSeq 2.0软件进行差异表达基因分析,并对差异表达基因进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能分析及转录因子靶向分析,选取免疫及凋亡相关基因进行实时荧光定量PCR验证,用Western blotting技术检测细胞内磷脂酰肌醇激酶(PI3K)及磷酸化胞内磷脂酰肌醇激酶(p-PI3K)、蛋白激酶B(Akt)和磷酸化蛋白激酶B(p-Akt)蛋白表达水平。【结果】转录组测序结果显示,与对照组相比,PCV2感染组共获得713个差异表达基因,其中313个上调,400个下调。GO功能和KEGG通路富集分析显示,差异表达基因与免疫应答等相关,主要富集在细胞外基质受体互作通路、新陈代谢通路、HIF-1信号通路、病毒致癌作用、PI3K-Akt等信号通路。实时荧光定量PCR结果与转录组测序的基因表达水平保持一致。Western blotting检测结果显示,PCV2感染3D4/2细胞24 h后PI3K和Akt蛋白磷酸化水平显著升高(P<0.05)。转录因子靶向分析表明,差异表达基因与核转录因子Y亚基β(NFYB)和ETS转录因子(ELK4)联系紧密。【结论】PCV2可能通过PI3K-Akt信号通路影响下游炎症信号通路和凋亡信号通路增强自身复制能力。NFYB和ELK4转录因子在PCV2感染过程中可能发挥重要作用,可考虑作为抗PCV2药物靶点。研究结果为深入了解PCV2感染宿主免疫细胞机制和相关药物开发提供了理论基础。
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关键词
猪圆环病毒Ⅱ型
3D4/2细胞
转录组测序
差异表达基因
转录因子
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职称材料
血虹素铁制剂对母猪繁殖性能及生理生化指标的影响
2
作者
蒋尚蓉
周家芳
+7 位作者
何颖
谢小东
韦玉衡
陈家骥
易首利
赵雯
李禧梦
胡庭俊
《广西畜牧兽医》
2024年第5期185-188,共4页
为研究血虹素铁制剂对哺乳母猪繁殖性能及生理生化指标的影响,将48头临产母猪分为血虹素铁制剂组(血虹素1千克/吨拌料)和空白对照组,每组24头。试验期为母猪产前7天至产后21天。试验期间,观察并记录母猪繁殖性能,同时检测两组母猪血液...
为研究血虹素铁制剂对哺乳母猪繁殖性能及生理生化指标的影响,将48头临产母猪分为血虹素铁制剂组(血虹素1千克/吨拌料)和空白对照组,每组24头。试验期为母猪产前7天至产后21天。试验期间,观察并记录母猪繁殖性能,同时检测两组母猪血液的生理、生化指标,以及仔猪脐带血和血清中的生化指标、铁含量(Fe)及总铁结合力(TIBC)。结果显示:血虹素铁制剂可缩短母猪产程、提高仔猪出生窝重和活仔率、降低仔猪弱仔率和死胎率;此外,还可显著提高母猪和小猪血清中铁含量和总铁结合力。本研究表明:饲粮中添加1千克/吨的血虹素铁制剂能够提高母猪繁殖性能以及母猪和小猪的血清铁含量。
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关键词
血虹素铁制剂
母猪
繁殖性能
仔猪成活率
生理指标
生化指标
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职称材料
题名
猪圆环病毒Ⅱ型感染3D4/2细胞的转录组学分析
1
作者
陈虹伶
赵怡
陈家骥
韦秋旭
李禧梦
冯国越
胡焜翔
胡庭俊
机构
广西大学动物科学技术学院
出处
《中国畜牧兽医》
CSCD
北大核心
2024年第1期42-51,共10页
基金
国家自然科学基金(31960715)
广西大学-大学生创新创业训练计划(20220100619)。
文摘
【目的】通过转录组测序筛选猪圆环病毒Ⅱ型(Porcine circovirus typeⅡ,PCV2)感染猪肺泡巨噬细胞系(3D4/2)差异表达基因,为了解PCV2感染宿主免疫细胞机制和抗PCV2感染药物研发奠定基础。【方法】用感染复数(multiplicity of infection, MOI)为1的PCV2 NJ2002株处理3D4/2细胞,利用Illumina NovaSeq 6000测序平台进行转录组测序。使用DeSeq 2.0软件进行差异表达基因分析,并对差异表达基因进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能分析及转录因子靶向分析,选取免疫及凋亡相关基因进行实时荧光定量PCR验证,用Western blotting技术检测细胞内磷脂酰肌醇激酶(PI3K)及磷酸化胞内磷脂酰肌醇激酶(p-PI3K)、蛋白激酶B(Akt)和磷酸化蛋白激酶B(p-Akt)蛋白表达水平。【结果】转录组测序结果显示,与对照组相比,PCV2感染组共获得713个差异表达基因,其中313个上调,400个下调。GO功能和KEGG通路富集分析显示,差异表达基因与免疫应答等相关,主要富集在细胞外基质受体互作通路、新陈代谢通路、HIF-1信号通路、病毒致癌作用、PI3K-Akt等信号通路。实时荧光定量PCR结果与转录组测序的基因表达水平保持一致。Western blotting检测结果显示,PCV2感染3D4/2细胞24 h后PI3K和Akt蛋白磷酸化水平显著升高(P<0.05)。转录因子靶向分析表明,差异表达基因与核转录因子Y亚基β(NFYB)和ETS转录因子(ELK4)联系紧密。【结论】PCV2可能通过PI3K-Akt信号通路影响下游炎症信号通路和凋亡信号通路增强自身复制能力。NFYB和ELK4转录因子在PCV2感染过程中可能发挥重要作用,可考虑作为抗PCV2药物靶点。研究结果为深入了解PCV2感染宿主免疫细胞机制和相关药物开发提供了理论基础。
关键词
猪圆环病毒Ⅱ型
3D4/2细胞
转录组测序
差异表达基因
转录因子
Keywords
Porcine circovirus typeⅡ
3D4/2 cell
transcriptomics sequencing
differentially expressed genes
transcription factor
分类号
S852.3 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
血虹素铁制剂对母猪繁殖性能及生理生化指标的影响
2
作者
蒋尚蓉
周家芳
何颖
谢小东
韦玉衡
陈家骥
易首利
赵雯
李禧梦
胡庭俊
机构
广西大学动物科学技术学院
邻水县畜牧兽医服务中心
广西壮族自治区兽医研究所广西兽医生物技术重点实验室
出处
《广西畜牧兽医》
2024年第5期185-188,共4页
基金
广西大学巴马产教融合研究院人才科技专项(项目编号:20220024)
广西研究生教育创新计划项目(JGY 2023 015)
+1 种基金
广西大学“大学生创新创业训练计划”项目(S 2023 10 593 294)
国家现代农业产业技术体系广西生猪产业创新团队疫病防控岗位功能专家项目(项目编号:nycytxgxcxtd-2023-15-02)。
文摘
为研究血虹素铁制剂对哺乳母猪繁殖性能及生理生化指标的影响,将48头临产母猪分为血虹素铁制剂组(血虹素1千克/吨拌料)和空白对照组,每组24头。试验期为母猪产前7天至产后21天。试验期间,观察并记录母猪繁殖性能,同时检测两组母猪血液的生理、生化指标,以及仔猪脐带血和血清中的生化指标、铁含量(Fe)及总铁结合力(TIBC)。结果显示:血虹素铁制剂可缩短母猪产程、提高仔猪出生窝重和活仔率、降低仔猪弱仔率和死胎率;此外,还可显著提高母猪和小猪血清中铁含量和总铁结合力。本研究表明:饲粮中添加1千克/吨的血虹素铁制剂能够提高母猪繁殖性能以及母猪和小猪的血清铁含量。
关键词
血虹素铁制剂
母猪
繁殖性能
仔猪成活率
生理指标
生化指标
分类号
S828.14 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪圆环病毒Ⅱ型感染3D4/2细胞的转录组学分析
陈虹伶
赵怡
陈家骥
韦秋旭
李禧梦
冯国越
胡焜翔
胡庭俊
《中国畜牧兽医》
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
2
血虹素铁制剂对母猪繁殖性能及生理生化指标的影响
蒋尚蓉
周家芳
何颖
谢小东
韦玉衡
陈家骥
易首利
赵雯
李禧梦
胡庭俊
《广西畜牧兽医》
2024
0
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