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核桃JrCOR413基因家族鉴定与表达分析
被引量：
3
1
作者
刘凯
李瑶玲
+4 位作者
李洋
王红霞
赵书岗
安秀红
张志华
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期14-20,共7页
为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅...
为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅读框为549~804 bp,翻译蛋白范围为182~267个氨基酸,等电点为8.15~9.93,全部为碱性稳定蛋白;含有典型的WCOR413高度保守的结构域。聚类分析发现,该类基因可与拟南芥高度同源,并分为2个亚组。在低温胁迫48 h后经转录表达分析,JrCOR5在2个核桃品种中显著升高,并且在花器官和嫩茎转录表达较高;结合qPCR分析,JrCOR5在冷胁迫48 h显著升高,达到90倍以上。因此,推测JrCOR5可能在核桃响应冷胁迫过程中起到重要作用。本研究结果将为解析核桃JrCOR413基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制研究奠定基础。
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关键词
核桃
冷胁迫
COR413基因家族
表达分析
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职称材料
核桃JrMYB44基因的结构与表达分析
被引量：
1
2
作者
代文强
李瑶玲
+3 位作者
刘凯
李林晴
赵悦平
赵书岗
《林业与生态科学》
2021年第4期407-417,共11页
MYB转录因子广泛参与植物生长发育、次生代谢以及植物响应胁迫的调控过程。为研究MYB在核桃生长发育过程中的作用,采用生物信息学方法研究了JrMYB44基因及其编码蛋白的结构特点,并分析了JrMYB44在不同核桃组织和低温胁迫下的转录水平。...
MYB转录因子广泛参与植物生长发育、次生代谢以及植物响应胁迫的调控过程。为研究MYB在核桃生长发育过程中的作用,采用生物信息学方法研究了JrMYB44基因及其编码蛋白的结构特点,并分析了JrMYB44在不同核桃组织和低温胁迫下的转录水平。结果表明,JrMYB44基因长1362 bp,最大开放阅读框966 bp,具1个外显子,无内含子,编码321个氨基酸等电点为7.60,属于弱碱性蛋白,编码蛋白的分子量为34.79 kD,该蛋白无信号肽,且不存在跨膜区域;进一步对JrMYB44编码的蛋白功能预测,其参与依赖ABA途径的非生物胁迫,并且互作蛋白中部分与响应低温胁迫有关,经同源进化分析发现其与毛果杨PtMYB44进化关系较近。低温处理48 h后,“辽宁8号”和“清香”JrMYB44转录表达显著升高,分别是对照组的4.00倍和3.03倍;结合“清香”不同组织转录组数据分析,JrMYB44在“清香”芽、幼叶和雌花中表达量较高,推测其可能参与幼嫩器官发育及响应低温胁迫的调控过程。
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关键词
核桃
JrMYB44
低温胁迫
表达分析
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职称材料
题名
核桃JrCOR413基因家族鉴定与表达分析
被引量：
3
1
作者
刘凯
李瑶玲
李洋
王红霞
赵书岗
安秀红
张志华
机构
河北农业大学园艺学院
河北农业大学山区研究所/河北省农业工程中心/国家北方山区工程中心
河北农业大学生命科学学院
河北省农林科学院植物保护研究所
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期14-20,共7页
基金
国家重点研发计划项目(2019YFD1001603)
河北省自然科学基金资助项目(C2019204270)
河北省重点研发计划项目(21326352D).
文摘
为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅读框为549~804 bp,翻译蛋白范围为182~267个氨基酸,等电点为8.15~9.93,全部为碱性稳定蛋白;含有典型的WCOR413高度保守的结构域。聚类分析发现,该类基因可与拟南芥高度同源,并分为2个亚组。在低温胁迫48 h后经转录表达分析,JrCOR5在2个核桃品种中显著升高,并且在花器官和嫩茎转录表达较高;结合qPCR分析,JrCOR5在冷胁迫48 h显著升高,达到90倍以上。因此,推测JrCOR5可能在核桃响应冷胁迫过程中起到重要作用。本研究结果将为解析核桃JrCOR413基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制研究奠定基础。
关键词
核桃
冷胁迫
COR413基因家族
表达分析
Keywords
walnut
cold stress
COR413 gene family
expression analysis
分类号
S664.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
核桃JrMYB44基因的结构与表达分析
被引量：
1
2
作者
代文强
李瑶玲
刘凯
李林晴
赵悦平
赵书岗
机构
河北农业大学现代科技学院
河北农业大学生命科学学院
河北省山区农业工程技术研究中心
河北农业大学园艺学院
出处
《林业与生态科学》
2021年第4期407-417,共11页
基金
河北农业大学生创新创业训练计划项目(2020148、2020288)
国家重点研发计划(2020YFD100070302)
+1 种基金
河北省现代种业科技创新专项(21326352D)
2021年国家级河北农业大学生创新创业训练计划项目(202110086006)。
文摘
MYB转录因子广泛参与植物生长发育、次生代谢以及植物响应胁迫的调控过程。为研究MYB在核桃生长发育过程中的作用,采用生物信息学方法研究了JrMYB44基因及其编码蛋白的结构特点,并分析了JrMYB44在不同核桃组织和低温胁迫下的转录水平。结果表明,JrMYB44基因长1362 bp,最大开放阅读框966 bp,具1个外显子,无内含子,编码321个氨基酸等电点为7.60,属于弱碱性蛋白,编码蛋白的分子量为34.79 kD,该蛋白无信号肽,且不存在跨膜区域;进一步对JrMYB44编码的蛋白功能预测,其参与依赖ABA途径的非生物胁迫,并且互作蛋白中部分与响应低温胁迫有关,经同源进化分析发现其与毛果杨PtMYB44进化关系较近。低温处理48 h后,“辽宁8号”和“清香”JrMYB44转录表达显著升高,分别是对照组的4.00倍和3.03倍;结合“清香”不同组织转录组数据分析,JrMYB44在“清香”芽、幼叶和雌花中表达量较高,推测其可能参与幼嫩器官发育及响应低温胁迫的调控过程。
关键词
核桃
JrMYB44
低温胁迫
表达分析
Keywords
Juglans regia
JrMYB44
low temperature stress
expression analysis
分类号
S664.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
核桃JrCOR413基因家族鉴定与表达分析
刘凯
李瑶玲
李洋
王红霞
赵书岗
安秀红
张志华
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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职称材料
2
核桃JrMYB44基因的结构与表达分析
代文强
李瑶玲
刘凯
李林晴
赵悦平
赵书岗
《林业与生态科学》
2021
1
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职称材料
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