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基于TMT技术的牦牛妊娠期血清蛋白质组学分析
被引量：
1
1
作者
姚颖
周应聪
+7 位作者
杜培岩
李一娟
钱文洁
李柳杨
余志鹏
崔燕
余四九
樊江峰
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期192-206,共15页
为了探究妊娠期内牦牛血清的蛋白质组特征,筛选并分析差异表达蛋白质(DEPs)在牦牛妊娠维持中的作用。本研究选择9头4岁半至6岁龄健康状况良好且当年未产犊的自然发情母牦牛进行人工授精(AI)。在AI后第30、60及90天采集其血清样品,并对...
为了探究妊娠期内牦牛血清的蛋白质组特征,筛选并分析差异表达蛋白质(DEPs)在牦牛妊娠维持中的作用。本研究选择9头4岁半至6岁龄健康状况良好且当年未产犊的自然发情母牦牛进行人工授精(AI)。在AI后第30、60及90天采集其血清样品,并对授配母牦牛进行妊娠诊断。依据诊断结果将采集的样品进行回顾性分组,即妊娠第1、2、3月组及未妊娠组(未妊娠组样品来自AI后90天经妊娠诊断确诊为未孕的牦牛个体),每组样品3个生物学重复。利用串联质谱标签(TMT)技术对牦牛血清样品的蛋白表达情况进行定量分析,筛选差异表达蛋白,并对其进行GO功能富集和KEGG通路等生物信息学分析,进一步筛选与牦牛妊娠维持相关的潜在蛋白。结果显示,在4组牦牛血清蛋白样品中共获得497个蛋白,以差异倍数≥1.2或≤0.83,且P<0.05为条件筛选,共筛选到68个差异蛋白。GO功能富集和KEGG通路分析显示,这些DEPs在代谢、免疫系统、粘附、生物调节等生物学过程以及补体与凝血级联、金黄色葡萄球菌感染等与炎症和免疫途径相关的通路有明显富集。值得注意的是,妊娠期各组间差异蛋白富集通路中均包含有PI3K-Akt、Rap1、MAPK等与生殖相关的信号通路。DEPs中IGFBP2、FGG、B2M、PDIA4、AZGP1的表达具有随妊娠时间的延长而连续上调的趋势,且这些蛋白在妊娠第3月表达量显著高于未妊娠状态。研究结果表明,牦牛妊娠早期存在明显的血清蛋白组的变化。这些DEPs分别在促进细胞粘附与增殖、母胎血管生成、维持母体代谢与免疫平衡等过程中起到重要作用。尤其是IGFBP2、FGG、B2M、PDIA4、AZGP1可能通过参与调节胎盘生长发育、免疫应答和脂质代谢等过程,在牦牛妊娠维持中发挥着重要作用。研究结果为进一步探明牦牛维持妊娠过程的调控机制提供了基础资料。
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关键词
TMT
蛋白质组学
牦牛
血清
差异表达蛋白
妊娠维持
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职称材料
靶向山羊痘病毒GPCR基因SYBR Green荧光定量PCR检测方法的建立
2
作者
张红强
任善会
+12 位作者
姚威
龚真莉
杨雪
马春玲
尤婷
张玉哲
柳民意
钱文洁
李柳杨
余志鹏
孙跃峰
陈豪泰
樊江峰
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期4779-4784,共6页
基于山羊痘病毒(goat pox virus,GTPV)的基因组序列,建立靶向G蛋白偶联趋化因子受体(G-protein-coupled chemokine receptor,GPCR)基因的荧光定量PCR检测方法。基于GTPV全基因序列设计6对qPCR引物,并进行特异性和灵敏性的筛选和检测,最...
基于山羊痘病毒(goat pox virus,GTPV)的基因组序列,建立靶向G蛋白偶联趋化因子受体(G-protein-coupled chemokine receptor,GPCR)基因的荧光定量PCR检测方法。基于GTPV全基因序列设计6对qPCR引物,并进行特异性和灵敏性的筛选和检测,最终筛选得到1对高特异性和灵敏性的荧光定量PCR引物;根据GTPV/AV41疫苗株GPCR基因序列,设计普通PCR引物,扩增GPCR基因,构建真核表达载体,建立荧光定量PCR标准曲线。结果表明:筛选得到1对靶向于GPCR基因的特异性qPCR引物;构建pCAGGS-GPCR真核表达质粒,建立标准曲线y=-3.5289x+49.07,线性相关系数R^(2)=0.9972,扩增效率为92.7%;验证性试验结果显示,该引物最低检测限为2.0拷贝·μL^(-1),各批次内与批次间重复性结果的变异系数均小于2%,表明其具有特异性强、重复性好和灵敏度高的优点。建立了靶向山羊痘病毒GPCR基因的qPCR检测方法,为防控山羊痘提供了高效的检测手段。
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关键词
山羊痘病毒
GPCR
荧光定量PCR
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职称材料
题名
基于TMT技术的牦牛妊娠期血清蛋白质组学分析
被引量：
1
1
作者
姚颖
周应聪
杜培岩
李一娟
钱文洁
李柳杨
余志鹏
崔燕
余四九
樊江峰
机构
甘肃农业大学动物医学院
甘肃省牛羊胚胎工程技术研究中心
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期192-206,共15页
基金
国家自然科学基金(31660732)
甘肃省科技重点研发计划(农业类)项目(20YF8NA131)
陇原青年创新创业人才项目(2021LQGR47)。
文摘
为了探究妊娠期内牦牛血清的蛋白质组特征,筛选并分析差异表达蛋白质(DEPs)在牦牛妊娠维持中的作用。本研究选择9头4岁半至6岁龄健康状况良好且当年未产犊的自然发情母牦牛进行人工授精(AI)。在AI后第30、60及90天采集其血清样品,并对授配母牦牛进行妊娠诊断。依据诊断结果将采集的样品进行回顾性分组,即妊娠第1、2、3月组及未妊娠组(未妊娠组样品来自AI后90天经妊娠诊断确诊为未孕的牦牛个体),每组样品3个生物学重复。利用串联质谱标签(TMT)技术对牦牛血清样品的蛋白表达情况进行定量分析,筛选差异表达蛋白,并对其进行GO功能富集和KEGG通路等生物信息学分析,进一步筛选与牦牛妊娠维持相关的潜在蛋白。结果显示,在4组牦牛血清蛋白样品中共获得497个蛋白,以差异倍数≥1.2或≤0.83,且P<0.05为条件筛选,共筛选到68个差异蛋白。GO功能富集和KEGG通路分析显示,这些DEPs在代谢、免疫系统、粘附、生物调节等生物学过程以及补体与凝血级联、金黄色葡萄球菌感染等与炎症和免疫途径相关的通路有明显富集。值得注意的是,妊娠期各组间差异蛋白富集通路中均包含有PI3K-Akt、Rap1、MAPK等与生殖相关的信号通路。DEPs中IGFBP2、FGG、B2M、PDIA4、AZGP1的表达具有随妊娠时间的延长而连续上调的趋势,且这些蛋白在妊娠第3月表达量显著高于未妊娠状态。研究结果表明,牦牛妊娠早期存在明显的血清蛋白组的变化。这些DEPs分别在促进细胞粘附与增殖、母胎血管生成、维持母体代谢与免疫平衡等过程中起到重要作用。尤其是IGFBP2、FGG、B2M、PDIA4、AZGP1可能通过参与调节胎盘生长发育、免疫应答和脂质代谢等过程,在牦牛妊娠维持中发挥着重要作用。研究结果为进一步探明牦牛维持妊娠过程的调控机制提供了基础资料。
关键词
TMT
蛋白质组学
牦牛
血清
差异表达蛋白
妊娠维持
Keywords
TMT
proteomics
yak
serum
differentially expressed proteins
pregnancy maintenance
分类号
S823.85 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
靶向山羊痘病毒GPCR基因SYBR Green荧光定量PCR检测方法的建立
2
作者
张红强
任善会
姚威
龚真莉
杨雪
马春玲
尤婷
张玉哲
柳民意
钱文洁
李柳杨
余志鹏
孙跃峰
陈豪泰
樊江峰
机构
甘肃农业大学动物医学院
中国农业科学院兰州兽医研究所
重庆市万州区畜牧产业发展中心
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期4779-4784,共6页
基金
国家自然科学基金(32302850)
甘肃省科技计划资助(22JR5RA035)
+1 种基金
甘肃省科技重大专项(22ZD6NA001)
中国农业科学院兰州兽医研究所基本科研业务费(1610312021008)。
文摘
基于山羊痘病毒(goat pox virus,GTPV)的基因组序列,建立靶向G蛋白偶联趋化因子受体(G-protein-coupled chemokine receptor,GPCR)基因的荧光定量PCR检测方法。基于GTPV全基因序列设计6对qPCR引物,并进行特异性和灵敏性的筛选和检测,最终筛选得到1对高特异性和灵敏性的荧光定量PCR引物;根据GTPV/AV41疫苗株GPCR基因序列,设计普通PCR引物,扩增GPCR基因,构建真核表达载体,建立荧光定量PCR标准曲线。结果表明:筛选得到1对靶向于GPCR基因的特异性qPCR引物;构建pCAGGS-GPCR真核表达质粒,建立标准曲线y=-3.5289x+49.07,线性相关系数R^(2)=0.9972,扩增效率为92.7%;验证性试验结果显示,该引物最低检测限为2.0拷贝·μL^(-1),各批次内与批次间重复性结果的变异系数均小于2%,表明其具有特异性强、重复性好和灵敏度高的优点。建立了靶向山羊痘病毒GPCR基因的qPCR检测方法,为防控山羊痘提供了高效的检测手段。
关键词
山羊痘病毒
GPCR
荧光定量PCR
Keywords
goat pox virus
GPCR
fluorescence quantitative PCR
分类号
S852.654 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于TMT技术的牦牛妊娠期血清蛋白质组学分析
姚颖
周应聪
杜培岩
李一娟
钱文洁
李柳杨
余志鹏
崔燕
余四九
樊江峰
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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职称材料
2
靶向山羊痘病毒GPCR基因SYBR Green荧光定量PCR检测方法的建立
张红强
任善会
姚威
龚真莉
杨雪
马春玲
尤婷
张玉哲
柳民意
钱文洁
李柳杨
余志鹏
孙跃峰
陈豪泰
樊江峰
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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